.h5图像文件(数据集)的读取并存储 工具贴(二)
概述
H5文件是层次数据格式第5代的版本(Hierarchical Data Format,HDF5),它是用于存储科学数据的一种文件格式和库文件。由美国超级计算中心与应用中心研发的文件格式,用以存储和组织大规模数据。
h5文件为一个存放数据的容器,包括group名称和datasets,group名称为key,datasets为value,文件结构如下图:
首先读取文件的group值,也即key值,根据key值加载datasets,datasets的文件可为图像、文本、pdf 或其他数据形式。
import h5py as h5
## 获取文件的group(key)值
file = h5.File(file_path, "r")
groups = [key for key in file.keys()]
print(groups)
代码
# 加载.h5图片数据
## import
import os
from PIL import Image
import numpy as np
import h5py as h5
## functions
def save_image(file, groups):
'''
将.h5/group下的array转换为灰度图像并存储
:param group: .h5文件包中的组名(key值)
:param save_path: 图像存储的路径
:return: None
'''
for group in groups:
print(group + " 组:")
image_path = input("请输入第一组图片要存储的路径(不存储输入N):")
counter = 0
for i in file[group][:]:
if image_path == "N":
continue
else:
makedir(image_path)
save_path = image_path + str(counter) + ".png"
image = np.array(i)
image *= 255 # 变换为0-255的灰度值
image = Image.fromarray(image)
image = image.convert('L') # 灰度为L,彩色为RGB’
image.save(save_path)
print(counter + 1)
counter += 1
print("done!")
def makedir(dir_path):
'''
创建文件夹
:param dir_path: 文件夹路径
:return: None
'''
isExists = os.path.exists(dir_path)
if not isExists: # 判断如果文件不存在,则创建
os.makedirs(dir_path)
def load_h5(file_path):
'''
加载.h5数据
:param file_path: .h5文件路径
:return: groups, file
'''
file = h5.File(file_path, "r")
groups = [key for key in file.keys()]
print("该文件共有以下几组:", groups)
return groups, file
## main
if __name__ == "__main__":
h5_file = input("输入.h5文件路径:")
groups, file = load_h5(h5_file)
save_image(file, groups)
操作说明
输入.h5文件路径
根据提示输入每组的存储路径 (注意路径最后要加 \ )
无需创建文件夹,输入路径会自动创建
提取的图片如下
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