Est--编码序列,gene 片段且具有标签 其中,est数据库中是类似测序1.测序2.测序3这样的序列.实验室测得的序列是cDNA,通过上图方法拼接,电脑克隆(dbest).如果有overlap则认为两个序列来自于同一个gene,overlap的碱基数目是40(不建议低于30,不建议高于40),过少容易拼接乱,过多对碱基突变的容忍性差.就一条序列来说,将比对后延长的结果进行二次比对,以此类推,直到不能延长为止. est数据库的覆盖率超过95%. 先利用其他数据库(eg:引物数据库.末端数据库)…

一.下载与安装 MySQL是一个关系型数据库管理系统,由瑞典MySQL AB 公司开发,目前属于 Oracle 旗下公司.MySQL 最流行的关系型数据库管理系统,在 WEB 应用方面MySQL是最好的 RDBMS (Relational Database Management System,关系数据库管理系统) 应用软件之一. 想要使用MySQL来存储并操作数据,则需要做几件事情: a. 安装MySQL服务端b. 安装MySQL客户端c. [客户端]连接[服务端]d. [客户端]发送命令给[服…

http://www.educity.cn/jiaocheng/j9415.html JSP程序员常用的技术   第1章 JSP及其相关技术导航 [本章专家知识导学] JSP是一种编程语言,也是一种动态网页开发技术,要用它完成实践项目工程的开发,需要掌握的知识点比较多.为了让读者对JSP这一开发技术的知识体系有个全面.清晰的了解,为后续的学习打下基础,本章将首先讲述作为一名JSP程序员应该掌握的技术知识体系和本书的内容安排.接着,对JSP技术进行了简要的介绍,使读者了解JSP技术的功能和优势.读…

前段时间,接手一个项目使用的是原始的jdbc作为数据库的访问,发布到服务器上在运行了一段时间之后总是会出现无法访问的情况,登录到服务器,查看tomcat日志发现总是报如下的错误. Caused by: com.mysql.jdbc.exceptions.jdbc4.MySQLNonTransientConnectionException: Data source rejected establishment of connection, message from server: "Too man…

SELECT TGTID,PHONENUM,REGISTERDATE ,to_date(REGISTERDATE,'YYYY-MM-DD HH24:MI:SS') AS T FROM WTRESSENWEB.T_AXMALL_COMMONCLIENT WHERE TGTID = '2087' AND to_date(REGISTERDATE,'YYYY-MM-DD HH24:MI:SS') > to_date('2014-07-09','yyyy-mm-dd'); 对于to_char() to_…

Linux同平台数据库整体物理迁移 需求:A机器不再使用,要将A机器的Oracle迁移到B机器. 之前写过类似需求的文章:http://www.cnblogs.com/jyzhao/p/3968504.html 本文这次旨在更多用到自动化通用的整合脚本去实现同平台的数据库整体迁移. A机器操作 B机器操作 A机器操作 0.系统版本: [root@DB-A tmp]# uname -a Linux DB-A 2.6.32-358.el6.x86_64 #1 SMP Tue Jan 29 11:47…

早上海南的同事打电话说他们的审计库连不上了启动也报错,问了下最近做了些什么操作,答复是之前添加了一次磁盘. 猜测是添加磁盘启动后/dev/sdx顺序出错,或者没有正常的关闭数据库导致数据库无法正常启动.远程登过去,先看了一下alert日志:发现有如下报警:ORA-00704: bootstrap process failureORA-00604: error occurred at recursive SQL level 1ORA-00942: table or view does not ex…

1.首先下载GeoIP的IP库.参考<利用GeoIP数据库及API进行地理定位查询>.下载后解压,得到一个GeoIP.dat文件 2.新建一个文件geoip.inc.内容为 <?php /* -*- Mode: C; indent-tabs-mode: t; c-basic-offset: 2; tab-width: 2 -*- */ /* geoip.inc * * Copyright (C) 2007 MaxMind LLC * * This library is free soft…

Linux同平台数据库整体物理迁移需求:A机器不再使用,要将A机器的Oracle迁移到B机器.之前写过类似需求的文章: http://www.linuxidc.com/Linux/2015-05/117556.htm本文这次旨在更多用到自动化通用的整合脚本去实现同平台的数据库整体迁移.1.A机器操作 2.B机器操作 A机器操作 0.系统版本:[root@DB-A tmp]# uname -aLinux DB-A 2.6.32-358.el6.x86_64 #1 SMP Tue Jan 29 11…

对数据仓库的操作(CURD): 新增:  create database db_test; 新增的时候设置编码: create database da_test_1 character set utf-8; 删除: drop database da_test_1; 修改: 修改数据仓库的字符编码集: alter database db_test character set 'gbk'; 查看: 获取所有的数据仓库: show databases; 查看数据仓库的编码: show create d…

往Oracle数据库中插入日期型数据(to_date的用法) INSERT  INTO  FLOOR  VALUES  ( to_date ( '2007-12-20 18:31:34' , 'YYYY-MM-DD HH24:MI:SS' ) ) ; 查询显示:2007-12-20 18:31:34.0 ------------------- INSERT  INTO  FLOOR  VALUES  ( to_date ( '2007-12-14 14:10' , 'YYYY-MM-DD HH2…

sa密码的修改转载自:http://blog.csdn.net/templar1000/article/details/20211191 SQL server 2008数据库的备份与还原转自 :http://www.cnblogs.com/zgqys1980/archive/2012/07/04/2576382.html 一.SQLServer2008修改sa密码的方法 1. 先用Window身份验证方式登陆进去,选择数据库实例,右键选择属性--安全性:把服务器身份验证选项从"Window身份验…

转载:https://blog.csdn.net/huangyuehong914/article/details/81742039 --------------------- --------------------- --------------------- --------------------- --------------------- --------------------- --------------------- --------------------- --------…

实验环境: 操作系统:Redhat 6.4 64位 数  据 库:Oracle 12c R2   一. 安装前准备 1. 创建用户和组 [root@wjq ~]# groupadd -g 1000 oinstall  //oinstall组:是清单目录组(Oracle Inventory group),用于管理清单目录(Inventory) [root@wjq ~]# groupadd -g 1001 dba       //dba组:用于数据库管理 [root@wjq ~]# useradd…

GoldenGate抽取Informix数据库安装及配置 本次测试架构 l  在中间机上安装informix csdk4.10版本,并编译配置unixODBC; l  在中间机上安装ogg for Informix 12.2,负责抽取informix主机的数据: l  在目标端oracle节点 上安装ogg for oracle 12.2,负责接收增量数据并写入到oracle db. 安装配置 源端主机上启用cdc功能 使用dbaccess,执行 $INFORMIXDIR/etc/syscdcv…

1.根据Alert报错信息,查询Trace日志 /oracle/app/oracle/admin/fgsquery/bdump/fgsquery_j001_11111.trc Oracle Database 10g Enterprise Edition Release - 64bit Production With the Partitioning, OLAP, Data Mining and Real Application Testing options ORACLE_HOME = /ora…

一.Introduction Sakila可以作为数据库设计的参考,也可作为实验数据.我是用作数据仓库和ODI学习的实验数据. The Sakila sample database was developed by Mike Hillyer, a former member of the MySQL AB documentation team, and is intended to provide a standard schema that can be used for examples i…

Peptide Sequence Databases蛋白序列的数据库 nrAll non-redundant GenBank CDS translations + RefSeq Proteins + PDB + SwissProt + PIR + PRF所有非冗余的的GenBank CDS区的翻译序列 + 参考序列的蛋白 + PDB数据库 + SwissProt蛋白数据库 + PRF蛋白数据库 refseqRefSeq protein sequences from NCBI’s Referenc…

参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解BLAST Databases:BLAST FTP Site   如何下载NCBI blast数据库? NCBI提供了一个非常智能化的脚本update_blastdb.pl来自动下载所有blast数据库. 脚本使用方法: perl update_blastdb.pl nr 有哪些可供下载的blast…

新建“计划(Maintenance Plan)”时,记得执行计划需把SQL的“代理服务(SQL Server Agent)”也开启 出现对话框:“SQL Server 阻止了对组件 'Agent XPs' 的 过程 'dbo.sp_set_sqlagent_properties' 的访问,因为此组件已作为此服务器安全配置的一部分而被关闭.SQL Server 阻止了对组件 'Agent XPs' 的 过程 'dbo.sp_set_sqlagent_properties' 的访问,因为此组件已作为…

转载:http://fhqdddddd.blog.163.com/blog/static/18699154201241014835362/ http://blog.sina.com.cn/s/blog_4476400f0100iq0x.html   EST----对EST序列进行冗余查找,利用CD_HIT软件聚类,快速批量去除冗余序列 est-trimer(去掉帽子和尾巴,去掉太短而不可信的) RepeatMaster(去掉转座子等重复) seqclean(去除载体,线粒体叶绿体等序列) CAP…

NCBI(National Center for Biotechnology Information,美国国家生物技术信息中心)除了维护GenBank核酸序列数据库外,还提供数据分析和检索资源.NCBI资源包括Entrez.Entrez编程组件.MyNCBI.PubMed.PudMed Central.PubReader.Gene.the NCBI Taxonomy Browser.BLAST.Pimer-Blast.COBALT.RefSeq.UniGene.HomoloGene.ProtES…

[时区设置不当会有什么问题] 当进行海外项目运维的时候,常常会遇到时区设置的问题.假设时区设置不当 或者 同样项目的server之间的时区不一致,都会有导致项目的数据异常的风险. 假设数据表的字段使用了date类型的字段,字段的默认值是sysdate.而且程序插入记录的时候使用了字段的默认值,那么就有可能导致数据异常.在改动数据库server的时区时.也是须要慎重操作的. [server时间同步的方法] # 时间同步server请改动为要求的地址(建议使用Windows的地址.由于世界上大部分个…

--查看数据库中表的语句 SELECT s2.dbid , DB_NAME(s2.dbid) AS [数据库名] , --s1.sql_handle , ( , ( ( THEN ( LEN(CONVERT(NVARCHAR(MAX), s2.text)) ) ELSE statement_end_offset ) ) AS [语句] , execution_count AS [执行次数] , last_execution_time AS [上次开始执行计划的时间] , total_worker…

http://ykdn2010.iteye.com/blog/1511349 一． 项目已用到 oracle 函数的转换 1．  Oracle 中的 TO_DATE (),TO_CHAR () 示例: select * from admadjustmoney t where t.sendtime> to_date(?,'yyyy-mm-dd      hh24:mi:ss') and t.sendtime< to_date(?,'yyyy-mm-dd hh24:mi:ss') 转换后: SEL…

mysql插入数据库的时间总是有问题,比实际时间要早8小时.检查是jdbc连接的url中配置的时区有问题,原先是 jdbc.url=jdbc:mysql://47.**.**.**:3306/yeeya?useUnicode=true&characterEncoding=UTF8&useSSL=false&serverTimezone=UTC 尝试了GMT.GMT8.UTC+8,UTC0800等可能的参数均报错.后来在mysql文档中发现可用的时区都在/usr/share/zone…

一.安装mysql # yum -y install mariadb-server # systemctl enable --now mariadb && systemctl status mariadb ● mariadb.service - MariaDB 10.3 database server Loaded: loaded (/usr/lib/systemd/system/mariadb.service; enabled; vendor preset: disabled) Acti…

转至:https://blog.csdn.net/cm_0205/article/details/100210526?utm_medium=distribute.pc_relevant_download.none-task-blog-baidujs-1.nonecase&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant_download.none-task-blog-baidujs-1.nonecase *******************os层检查 #检查o…

1. 建库连库 连接MySQL数据库需要安装支持 npm install mysql 我们需要提前安装按mysql sever端 建一个数据库mydb1 mysql> CREATE DATABASE mydb1; mysql> SHOW DATABASES; +--------------------+ | Database | +--------------------+ | information_schema | | mysql | | mydb1 | | performance_sch…

一.使用Raw文件夹下的数据库文件 在使用GreenDao框架时,数据库和数据表都是根据生成的框架代码来自动创建的,从生成的DaoMaster中的OpenHelper类可以看出: public static abstract class OpenHelper extends SQLiteOpenHelper { public OpenHelper(Context context, String name, CursorFactory factory) { super(context, name,…