图片来源(Nature Methods)   摘要 单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq, scRNA-seq)数据有高噪音和稀疏的特点.原文作者展示了跨数据集的迁移学习可显著提高数据的质量.通过将深度自动编码器与贝叶斯模型相结合,原文开发的SAVER-X软件可从不同实验室.不同条件和不同物种的数据中提取可迁移的基因关系,以对新的目标数据…

一 下载maven 在maven官网上可下载maven:http://maven.apache.org/download.cgi 下载好后,解压.我的解压到了:D:\maven\apache-maven-3.3.9 二 配置maven 环境变量 系统变量:MAVEN_HOME = D:\Development\apache-maven-3.3.9 系统变量:path = %MAVEN_HOME%\bin 相信大家都有配过环境变量的,详细步骤就不说了,对着把属性名和属性值配上就OK了. 打开 cm…

可变剪接(alternative splicing),在真核生物中是一种非常基本的生物学事件.即基因转录后,先产生初始RNA或称作RNA前体,然后再通过可变剪接方式,选择性的把不同的外显子进行重连,从而产生不同的剪接异构体(isoform).这种方式,使得一个基因可产生多个不同的转录本,这些转录本分别在细胞/个体分化发育的不同阶段,在不同的组织中有各自特异的表达和功能,从而极大地丰富了编码RNA和非编码RNA种类和数量,进而增加了转录组和蛋白质组的复杂性. 可变剪接主要有以下五种常见的形式: 1…

单细胞测序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进了相关的研究和应用.其中转录组测序(RNA-seq)被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录本的表达情况.但传统的转录组测序技术(bulk RNA-seq)是基于群体细胞,每个样本包含成千上万个细胞,所以最终反映的是基因在群体细胞中平均表达水平,从而掩盖了不同细胞之间的表达异质性.近年来,单细胞转录组测序(single-cell RNA-…

单细胞测序 单细胞基因组学 测量理由是单细胞的时间空间特异性. Gene expression&co-expression 比较正常cell与疾病cell,正常organ与疾病organ,看出偏差. 分离单细胞,破碎细胞,RNA逆转录,测量cDNA. Eg:BAC扩增,可以实现bias很小的的genome,genome质量高. Eg:对sperm cell进行single cell, Eg:oocyte与sperm结合后,可以对过程中丢弃的部分进行single cell. 如果父源或母源中任何一…

摘要 编写正确的并发程序对我来说是一件极其困难的事情,由于知识不足,只知道synchronized这个修饰符进行同步. 本文为学习极客时间:Java并发编程实战 01的总结,文章取图也是来自于该文章 并发Bug源头 在计算机系统中,程序的执行速度为:** CPU > 内存 > I/O设备 ** ,为了平衡这三者的速度差异,计算机体系机构.操作系统.编译程序都进行了优化: 1.CPU增加了缓存,以均衡和内存的速度差异 2.操作系统增加了进程.线程,已分时复用CPU,以均衡 CPU 与 I/O 设…

python 数据分析与挖掘实战 day 01 08/02 这种从数据中"淘金",从大量数据包括文本中挖掘出隐含的.未知的.对决策有潜在价值关系.模式或者趋势,并用这些知识和规则建立用于决策支持的模型.提供预测性决策支持的方法.工具和过程就是数据挖掘. 数据挖掘的基本任务就是包括利用>>>>>>分类与预测.聚类.关联规则.时序模式.偏差检测和智能推荐等方法找到meta-relationship 要针对具体的数据挖掘需求,首先应该明确本次挖掘的目的是什…

早就想对redis进行实战操作了,最近看了一些视频和参考书籍,总结总结一下,redis实战内容: 实战前先对redis做一个大概的认识: 现在开始安装redis了... redis的安装下载地址 http://redis.io/download 安装步骤:1 把下载好的redis-3.2.6-rc2.tar.gz放到linux /usr/local文件夹下2 进行解压tar -zxvf redis-3.2.6.tar.gz3 进入到redis-3.2.6目录下,进行编译make[即执行make指…

前言 Extjs5的发布已经有些日子了,目前的最新稳定版本是Extjs5.1.0,我们可以在官方网站进行下载.不过笔者今天访问得到的是502Bad Gateway,原因可能是sencha的nigix没有配置好缓冲. 如果E文比较好,建议跳过本系列教程,直接阅读官方5.1文档. 正文 Extjs是开源的遵循GPL协议,我们下载到的文件包含了源代码,我们要在这堆源代码中找到Extjs5的真正需要引用的文件. 这些文件在build文件夹下.我们首先需要引用的是ext.all.js,(ext.all-d…

转自:https://blog.csdn.net/eson_15/article/details/51277324 今天开始做一个网上商城的项目,首先从搭建环境开始,一步步整合S2SH.这篇博文主要总结一下如何整合Struts2.Hibernate4.3和Spring4.2. 整合三大框架得先从搭建各部分环境开始,也就是说首先得把Spring,Hibernate和Struts2的环境搭建好,确保它们没有问题了,再做整合.这篇博文遵从的顺序是:先搭建Spring环境-->然后搭建Hibernate…