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合并fasta文件工具
2024-08-03
fasta文件拆分与合并
Linux中fasta文件的拆分与合并 FASTA文件的拆分: (1)如果从一个文件a提取第11至20个序列存到另一个文件b: awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=21{print ">"$0}' a.fasta|sed '/^$/d'>b.fasta (2)将某一文件a中每一条序列保存到一个文件中: awk '/^>/{f=++d".fasta"} {print > f
[Linux] vimdiff 快速比较和合并少量文件
纯文本文件比较和合并工具一直是软件开发过程中比较重要的组成部分,vimdiff 能够在比较出来的多处差异之间快速定位,很容易的进行文件合并操作.在需要快速比较和合并少量文件的时候,vimdiff是很好的选择. vimdiff 基本用法: 首先保证系统中的diff命令是可用的.Vim的diff模式是依赖于diff命令的. 启动方法1. vimdiff file1 file2 …2. vim -d file1 file2 … 差异点跳转]c 下一个差异点[c 上一个差异点n]c 转到下面第n个差异点
合并BIN文件的两种方法(转)
源:http://blog.chinaunix.net/uid-20745340-id-1878803.html 合并BIN文件的两种方法 在单片机的开发过程中,经常需要将两个单独的BIN文件合并成一个文件,方便烧写和生产.下面结合STM32的IAP Bootloader Code和Application Code的合并,介绍两种合并BIN文件的方法. 首先简单介绍一下STM32的IAP.IAP(In-application-programming),即在应用中编程.有了它,产品发布之后,仍然可
映像文件工具srec
目录 映像文件工具srec 介绍与帮助 常用例子 常用选项 一个实际的例子 hex转bin 数据填充 文件合并 文件分割 加入CRC 查看信息 使用命令集合的文本 详细文件格式的描述 附录:MDK的例子(谷歌翻译的) 用例 教程 句法 更多信息 也可以看看 另见8051 title: 映像文件工具srec tags: pc date: 2019-01-06 22:58:38 --- 映像文件工具srec 介绍与帮助 项目主页在这里 MDK提供的简单例子 官方的例子 在线hex,bin的工具 ar
使用Python批量合并PDF文件(带书签功能)
网上找了几个合并pdf的软件,发现不是很好用,一般都没有添加书签的功能. 又去找了下python合并pdf的脚本,发现也没有添加书签的功能的. 于是自己动手编写了一个小工具,使用了PyPDF2. 下面是使用的截图: 代码如下: #!/usr/bin/env python3 # -*- coding: utf-8 -*- ''' #文件名:pdfmerge.py 本脚本用来合并pdf文件,输出的pdf文件按输入的pdf文件名生成书签 使用示例如下: python pdfmerge.py -p "D
Android Developer:合并清单文件
使用Android Studio而且基于Gradle构建.每一个App能在多个位置包括清单文件,比如在src/main文件夹下productFlavor.库.Android ARchive(AAR) bundles of Android Library项目,和第三方依赖.在构建过程中.包括在你的app中的多个AndroidMainfest.xml设置合并成一个,生成APK清单文件用于app的打包和公布. 清单文件的设置基于清单优先级来合并.取决于清单文件的位置.从制定build variant清
[原]Nginx+Lua服务端合并静态文件
http://homeway.me 0x01.About 源代码已经上传到github:https://github.com/grasses/nginx-lua-static-merger nginx-lua-static-merger是一个基于openresty的模块,主要用于合并静态文件.降低http请求,加快静态文件訪问速度的模块. 使用nginx-lua-static-merger 须要在编译nginx时候加入openresty的模块,或者直接安装openresty作为server. n
(转)vimdiff 快速比较和合并少量文件
vimdiff 快速比较和合并少量文件 原文:http://www.cnblogs.com/abeen/p/4255754.html 纯文本文件比较和合并工具一直是软件开发过程中比较重要的组成部分,vimdiff 能够在比较出来的多处差异之间快速定位,很容易的进行文件合并操作.在需要快速比较和合并少量文件的时候,vimdiff是很好的选择. vimdiff 基本用法: 首先保证系统中的diff命令是可用的.Vim的diff模式是依赖于diff命令的. 启动方法1. vimdiff file1 f
Java常用工具类---IP工具类、File文件工具类
package com.jarvis.base.util; import java.io.IOException;import java.io.InputStreamReader;import java.io.LineNumberReader; /** * * * @Title: IpMacUtil.java * @Package com.jarvis.base.util * @Description:Ip工具类. * @version V1.0 */public class IpMacUtil
Linux文件排序和FASTA文件操作
文件排序 seq: 产生一系列的数字; man seq查看其具体使用.我们这使用seq产生下游分析所用到的输入文件. # 产生从1到10的数,步长为1 $ seq 1 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 # 产生从1到10的数,步长为1,用空格分割 $ seq -s ' ' 1 10 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 # 产生从1到10的数,步长为2 # 如果有3个数,中间的数为步长,最后一个始终为最大值 $ seq -s ' ' 1 2 10 1 3 5 7 9 $ cat
-Gradle 翻译 Merge AndroidManifest 合并清单文件 MD
目录 目录 Merge AndroidManifest 合并清单文件 合并多个清单文件 合并优先级 合并冲突启发式算法 合并规则的标记 节点标记 属性标记 Attribute markers 标记选择器 替换导入库的 uses-sdk 隐式系统权限 检查合并清单并查找冲突 附录:合并策略 Markdown版本笔记 我的GitHub首页 我的博客 我的微信 我的邮箱 MyAndroidBlogs baiqiantao baiqiantao bqt20094 baiqiantao@sina.com
ImageMagick convert多张照片JPG转成pdf格式,pdfunite合并PDF文件
在认识ImageMagick之前,我***的图像浏览软件是KuickShow,截图软件是KSnapShot,这两款软件都是KDE附带的软件,用起来也是蛮方便的.在一次偶然的机会中,我遇到了ImageMagick,才发现Linux竟然有如此功能强大的图像软件. 你将会发现,大部分的操作,你只要在终端下动动键盘即可,省得你用鼠标点来点去. 下面,我对ImageMagick的主要功能做一个简单的介绍,其中覆盖的大都是人们常用的一些功能,如果你要全面的了解它的知识,你可以看看它的man手册. con
perl 多fasta文件匹配,并提取匹配文件第一条序列
目标如题,有多个fasta文件和一个文件名列表,将文件名列表中包含的文件匹配出来并提取第一条序列合并成一个fa文件. 这个采用perl实现,用法和代码如下: 1 #!/usr/bin/perl -w 2 use strict; 3 4 sub usage{ 5 die "usage:perl $0 <fa.list> <Fasta_Dir> <merged.fa>\n",unless(@ARGV==3); 6 } 7 usage(); 8 9 ope
获取google翻译的音频文件_合并音频文件的方法
1. 把引文输入google 翻译,然后点击"朗读"
rz和sz上传下载文件工具lrzsz
######################### rz和sz上传下载文件工具lrzsz ############################################################ rpm -qa |grep lrzsz 如果没有用RPM安装即可: rpm -ivh lrzsz-0.12.20-27.1.el6.x86_64.rpm (去光盘里找) 或者 yum install -y lrzsz 即可. ###############################
Hadoop HDFS编程 API入门系列之合并小文件到HDFS(三)
不多说,直接上代码. 代码 package zhouls.bigdata.myWholeHadoop.HDFS.hdfs7; import java.io.IOException;import java.net.URI;import java.net.URISyntaxException;import org.apache.hadoop.conf.Configuration;import org.apache.hadoop.fs.FSDataInputStream;import org.apa
matlab批量合并txt文件
1: %% merge.m 2: %%%%Main程序%%%%%% 3: %%%%%% 4: %%%%%%本程序合并完各个子文件夹中的txt到主文件目录下,并且合并的文件以子文件夹名字命名 5: %%%%%%同时,每次合并时,如果主文件夹已存在某一个子文件夹名字A的txt文件,那么此次合并,将把当前 6: %%%%%%这个子文件夹A中所有的txt文件追加到子文件夹A.txt文件的末尾处. 7: clear; 8: clc; 9: % MainFolder='D:\Master-FTP\磁流变阻尼
合并Excel文件
//合并Excel文件 private void MargeExcelFile(string destFile, string dirPath) { DirectoryInfo dir = new DirectoryInfo(dirPath); FileInfo[] files = dir.GetFiles("*.xlsx"); Microsoft.Office.Interop.Excel.Application app = app = new Microsoft.Office.Int
自动扫描FTP文件工具类 ScanFtp.java
package com.util; import java.io.BufferedInputStream; import java.io.BufferedOutputStream; import java.io.File; import java.io.FileInputStream; import java.io.FileOutputStream; import java.io.IOException; /** * 自动扫描FTP文件工具类 * 需要定时执行 */ public class S
读取Config文件工具类 PropertiesConfig.java
package com.util; import java.io.BufferedInputStream; import java.io.FileInputStream; import java.io.InputStream; import java.util.Properties; /** * 读取Config文件工具类 * @version 1.0 * @since JDK 1.6 */ public class PropertiesConfig { /** * 获取整个配置文件中的属性 *
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