GATK4.0 和之前的版本相比还是有较大的不同,更加趋于流程化. 软件安装 1 wget https://github.com/broadinstitute/gatk/releases/download/4.1.5.0/gatk-4.1.5.0.zip 2 unzip gatk-4.1.5.0.zip GATK 简单说明 1 ## 帮助信息 2 gat --help 3 4 ## 列出所有的工具 5 gatk --list 6 7 ## 工具的说明,比如以VariantAnnotator 为例

一个矛盾: GWAS得到的SNP做富集分析的话,通常都会有强的偏向性. co-localization of GWAS signals to gene-dense and high linkage disequilibrium (LD) regions, and correlations of gene size, location and function 数据库使用注意: 一次最多只能输入200-300个SNP SNP必须以rs id格式输入,否则基本不识别 SNPsnap: a Web-b

Django框架十分简单易用,适合搭建个人博客网站.网上有很多教程,大多是关于命令行操作Django,这里分享一些用最新工具进行Django开发过程,主要是PyCharm太强大,不用有点可惜. 第一次写技术开发类的博文,可能抓不到重点,详略也可能失衡,感谢支持. 环境&工具:Windows server 2012  , PyCharm 2016.2.1 , Django 1.10 , Python 2.7 , MySQL Community 5.7.14 0.创建前的配置 安装MySQL,并已设

1.数据增删改 2.单表查询 3.正则表达式 4.多表查询 ​ 笛卡尔积 ​ 内连接 ​ 外链接 ​ 子查询 一.数据的增删改 为什么不说查 因为查询语句 有很多细节 所以先从简单的说起 添加数据: 1.insert into table_name[column,[column2.....]] values(value1...)[,(value1...)]; 如果表名后没制定字段 则插入的数据必须和表格结构顺序匹配 每一个字段都必须给出值 当然 数据类型也必须一致 如果在表名后制定了字段名 可以

1.通过单元格的值来引用以单元格值命名的sheet,在做多个类似sheet的统计结果时效率比较高 当一项测试中有很多个模块,每个模块中有很多条测试用例 将以上测试用例整理在Excel中,每个模块一个sheet分隔,现要统计所有测试结果,如何最有效的统计出结果? 案例: 如下为某厂商手机相机.设置.音频.视频模块的测试用例集: 方法一:手动填写 在每个模块中去看,或通过筛选Pass.fail,统计数据,然后填写到汇总表中 方法二:通过 COUNT.COUNTIF 逐个模块去做统计 这样的话,每一个

思路 各种密码类别大致数学原理 https://blog.csdn.net/carol980206/article/details/96705859 https://www.jianshu.com/p/cb77838c69db 目标系统实施了强安全措施 安装了所有补丁 无任何已知漏洞 无应用层漏洞 攻击面最小化 社会工程学 获取目标系统用户身份 非授权用户不受信,认证用户可以访问守信资源 已有用户账号权限受 不触发系统报警 密码破解 人工猜解 垃圾桶工程 被动信息搜集 基于字典暴力破解 键盘空间

目录 前言 四个SNP集 hapmapSNPs tagSNPs fixedSNPs barcodeSNPs hapmapSNPs的指标统计 tagSNPs的群体结构验证 tagSNPs的遗传多样性 tagSNPs用于GS fixedSNPs验证 barcodeSNPs指纹图谱 barcodeIndel SR4R数据库 前言 王向峰老师2020年发表在<Genomics Proteomics Bioinformatics>(IF=6.597)上的文章.对于做数据分析的人来说,如何挖掘公共数据,如

1,软件介绍 FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite

本章开始分析过滤器,根据API的顺序来 主要涉及的知识点 jQuery的组成 pushStack方法的作用 sizzle伪类选择器 首页我们知道jQuery对象是一个数组对象 内部结构 jQuery的选择最终还是依靠的DOM提供的接口,jQuery只是最了最佳的方式最快的匹配到合适的位置 构建一个基础的jQuery对象有: 元素合集 元素数量 上下文 通过pushStack()方法构建的prevObject的引用储存,这个在DOM操作的时候特别有用 选择器 具体文章前面有分析,pushStack

在前面分析的时候也分析了部分筛选操作(详见),我们接着分析,把主要的几个分析一下. jQuery.fn.find( selector ) find接受一个参数表达式selector:选择器(字符串).DOM元素(Element).jQuery对象.分两种情况处理: 第一种,如果传入的参数是非字符串,则先通过jQuery选择器将selector查找出来,然后过滤出包含于当前jQuery对象所匹配的元素的节点. if ( typeof selector !== "string" ) { s

E - Help Hanzo Time Limit:2000MS     Memory Limit:32768KB     64bit IO Format:%lld & %llu Submit Status Practice LightOJ 1197 Description Amakusa, the evil spiritual leader has captured the beautiful princess Nakururu. The reason behind this is he ha

试用十天被Pass所带来的启示   招聘是门学问,很多人在研究,也有很多方案,不过面对人员难聘问题,很多方法又不灵了.于是我们采用了降低标准方案,扩招进来一些人员,于是问题又来了,想不想听我亲身经历的一些故事? 背景 我Vs人事 (走廊里) 我:"最近还有简历么?" 人事:"没有,还是昨天给你那3份,没有新上简历." 我:"-" 我 Vs 人事 (人事部) 人事:"这个人怎么不行,你们要求的这几点他都符合啊,而且还是211工程院校毕业,

Sorting, filtering, paging, and grouping 7 of 8 people found this helpful By Tom Dykstra The Contoso University sample web application demonstrates how to create ASP.NET Core 1.0 MVC web applications using Entity Framework Core 1.0 and Visual Studio

背景 平时工作中,我们经常会处理大量的元数据(Raw Data),而一般的文件编辑器只能一次查询一个关键字,这就难以连续的分析元数据,比如分析产品日志文件(log),日志可能包括很多information级别的信息,这些一般是我们不太关心的,我们主要关心的是一些特殊的调试(Debug)级别的信息,所以就有必要根据很多关键字筛选出来日志文件中我们所关系的信息,这样筛选出来的日志文件不仅具有连续性,而且易读性会非常好. 解决方案 re是Python自带的正则表达式库文件,为字符串的匹配筛选提供了极大

第三百八十九节,Django+Xadmin打造上线标准的在线教育平台—列表筛选结合分页 根据用户的筛选条件来结合分页 实现原理就是,当用户点击一个筛选条件时,通过get请求方式传参将筛选的id或者值,传入逻辑处理就行数据库条件查询,将查询条件值在返回html页面判断是否是选中样式,最后将所有需要关联的筛选请求加上彼此逻辑处理传回来的查询条件值 html请求传参 黄色背景为请求传参 红色背景为逻辑处理传过来的查询条件判断样式 <div class="wp butler_list_box li

SNP问题大集锦 [2017-01-19]       最近小编对基因检测很感兴趣,也跟风去测了一下,这一测不要紧,吓得小编几天没睡着觉,这不,检测报告上称小编的减肥能力弱,虽然小编一家都是胖子,唯有小编一个瘦子,原本以为是基因发生了突变,然并卵,是未到时候...... 难过之后小编恢复了理智,凭什么你说小编减肥能力弱,小编表示不服,仔细读了报告后发现,原来是这些SNP位点搞的鬼,又是SNP! 话说小编最近收到许多关于SNP的问题,现整理如下: 1.什么是SNP? 单核苷酸多态性(single

SNP/单核苷酸多态性分析 SNP(Single Nucleotide Polymorphism),即单核苷酸多态性,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态.一般来说,一个SNP位点只有两种等位基因,因此又叫双等位基因.SNP在人类基因组中的发生频率比较高,大约平均每1000个碱基中就有一个多态位点.有些SNP位点还会影响基因的功能,导致生物性状改变甚至致病.单核苷酸多态性是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据,因此被广泛用于群体遗传学研究(如生物的起源.进化及迁移等方面)和疾病相关基因

题目链接:https://vjudge.net/problem/LightOJ-1197 1197 - Help Hanzo    PDF (English) Statistics Forum Time Limit: 2 second(s) Memory Limit: 32 MB Amakusa, the evil spiritual leader has captured the beautiful princess Nakururu. The reason behind this is he

1.基础 restful规范: - url:一般用名词 http://www.baidu.com/article (面向资源编程) - 根据请求方式的不同做不同操作:get,post,put,delete,patch - 一般传输的数据格式都是json - 根据筛选条件可以在url后面添加参数 http://www.baidu.com/article?page=1 一些动态变化的使用fk,不会动态变化的直接加入到内存里面,查找速度比较快. 分表:水平分表,垂直分表 serraliserz想自己添

目录 自定义drf-jwt配置 案例:实现多方式登陆签发token urls.py models.py serializers.py views.py 案例:自定义认证反爬规则的认证类 urls.py authentications.py views.py 测试 admin使用自定义User表:新增用户密码密文 admin.py 群查接口各种筛选组件数据准备 models.py admin.py serializers.py views.py urls.py 源码分析 drf搜索过滤组件 vie