#!/usr/bin/env python # usages: python extract_seq_by_pos.py input.fasta id_start_end > result.fasta import sys import re FASTA= sys.argv[1] BED= sys.argv[2] fasta= open(FASTA, 'U') fasta_dict= {} for line in fasta: line= line.strip() if line == '':

Linux中fasta文件的拆分与合并 FASTA文件的拆分: (1)如果从一个文件a提取第11至20个序列存到另一个文件b: awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=21{print ">"$0}' a.fasta|sed '/^$/d'>b.fasta (2)将某一文件a中每一条序列保存到一个文件中: awk '/^>/{f=++d".fasta"} {print > f

在java web开发的时候经常会用到读取读取或存放文件,这个文件的默认路径在哪里呢?写死在程序里面显然是可以的,但这样子不利于位于,假如有一天项目从window移植到linux,或者保存文件的路径变了,就需要去源代码中查找,进行替换,这样子不仅效率低,而且程序的耦合度也会过高,这里我用了一个properties文件用于存放文件的保存路径,需要保存或者读取都来自己properties所保存的路径. 1.我存放的propeities文件路径 因为linux和window上面的分盘是不一样的,所以我

AIR 中的 File 对象 所访问的文件夹位置 Link 关于File.cacheDirectory的一点说明 According to the Apple guidelines, data that can be downloaded again or regenerated shall be stored in the <APPLICATION_HOME>/Library/Caches directory. So, with AIR 3.6, a new static property,

--查看当前的存放位置 select database_id,name,physical_name AS CurrentLocation,state_desc,size from sys.master_files  where database_id=db_id(N'数据库名');    --修改文件的存放位置下次启动生效 --testDb为数据库名, alter database 数据库名 modify file ( name = 文件名(不包含后缀), filename = '文件存储路径'

1.查看HDFS下所有的文件存储位置信息 package Hdfs; import java.net.URI; import org.apache.hadoop.conf.Configuration; import org.apache.hadoop.fs.BlockLocation; import org.apache.hadoop.fs.FileStatus; import org.apache.hadoop.fs.FileSystem; import org.apache.hadoop.f

读取fasta文件genome_test.fa,并计算染色体总长,同时输出最长染色体编号.序列以及长度 fasta文件genom_test.fa的内容如下: >chr1ATATATATAT>chr2ATATATATATCGCGCGCGCG>chr3ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT>chr4ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCG>chr5ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCG

在js文件引入的时候注意配置文件的路径是否和项目目录中的文件夹位置一致,如果不一致, 浏览器会指出找不到文件404的情况

SQL Server分发服务器配置中,需要配置快照文件夹(Snapshot Folder),用于存储发布的数据和架构文件的工作目录,那么如何查找当前SQL Server数据库服务器的分发服务器的快照文件夹位置呢? 如果配置了具体发的发布和订阅,那么可以在对应的发布的属性->快照文件里面查看,如果还没有配置具体的发布和订阅,这个需要怎么查看呢? 今天恰巧遇到了这样的问题,研究了一下,其实这些值保存在表msdb.dbo.MSdistpublishers下面,如下所示. SELECT * FROM m

在windows下使用pipenv shell时,虚拟环境文件夹会在C:\Users\Administrator\.virtualenvs\目录下默认创建,为了方便管理,将这个虚环境的文件的位置更改一下. 新建一个名为“ WORKON_HOME ”的环境变量(如果已存在就忽略此步骤),然后将环境变量的值设置为“ PIPENV_VENV_IN_PROJECT ” (其他名字也行?还试过) 我觉得重点是在 WORKON_HOME 这个变量名. 完毕后使用 pipenv shell 时会在当前项目的文

ERROR StatusLogger Log4j2 could not find a logging implementation. Please add log4j-core to the classpath. Using SimpleLogger to log to the console... 去以下地址下载个核心包加入到classpath内. http://www.apache.org/dyn/closer.lua/logging/log4j 在配置日期文件输出位置时可以配置在WEB项目

当我们安装扩展时,可能需要手动配置php.ini文件,把扩展加进去,所以要确认PHP CLI的php.ini文件的位置.可以运行php --ini查找PHP CLI的ini文件位置,结果类似如下(各个系统显示结果会有差异): D:\PHP\php-5.6.32-nts-x64>php --iniConfiguration File (php.ini) Path: C:\WindowsLoaded Configuration File: D:\Visual-NMP-x64\Bin\PHP\php-

1:查看MySQL服务名称 2:管理员启动控制台 3:修改配置文件my.ini中数据文件的位置,[注]修改完成之后要把响应的数据文件从旧目录拷贝到新目录当中. 4:重新启动服务 5:登录数据库查看数据文件

韩梦飞沙  韩亚飞  313134555@qq.com  yue31313  han_meng_fei_sha eclipse 怎么 直接查看 文件所在位置 显示在文件管理器中.用浏览器浏览.

如何把C盘里的文件默认位置更改到D盘指定目录? 1.打开运行,输入 %HOMEPATH% 2.以”桌面”文件转移到D盘目录为例(其他文档类比进行操作) 3.鼠标右键”桌面”----选择属性-----定位到位置标签下 4.点击移动 定位到新位置 应用----确定

昨天用VHD装了一个Win 10的预览版体验了一下,感觉磁盘操作非常慢,便用HD Tune测试了一下,发现速度只有物理硬盘的一半都不到.          这个倒大出我意料之外,由于VHD的便利性,我在公司里经常拿它来装多系统,没有什么非常明显的慢的感觉.便在网上搜了一下,找到了一篇文章VHD分区性能损失远高于传说的10%.里面有高人给出了解释:机械硬盘前面分区快,后面分区慢,也就是Hdtune那条下降曲线.因为硬盘有内外圈分别.要想速度快些,尽量把vhd放在前面的分区.也就是hdtune曲线开

yum安装Apache Web Server后各个文件存放位置   用yum安装apache软件: yum -y install httpd 安装完成后,来查看理解yum安装软件的过程和安装路径.   首先理解YUM:基于RPM包管理,能够从指定的服务器下载RPM包并自动进行安装:并自动处理依赖关系,并一次性安装所有依赖的包 避免了手动安装的麻烦(寻找资源.下载:放到指定目录安装:处理依赖关系并下载依赖关系的包进行安装) 所以用yum安装,实质上是用RPM安装,所以RPM查询信息的指令都可用.

转载:http://superich2008.iteye.com/blog/2047830 失败提示信息为:程序包com.sun.image.codec.jpeg不存在 这个类文件的位置在jre/lib/rt.jar 而我们设置的java_home下面的lib/dt.jar中没有这个文件,导致编译失败.通过配置maven-compiler-plugin插件可以解决此问题. <plugin> <artifactId>maven-compiler-plugin</artifact

1.介绍 (1)常识 (2)在res目录下新建资源文件(例如数字资源) app--->res,选择res,右击new--->value resource file 2.字符资源(strings.xml) (1)在strings.xml中定义 (2)调用 3.R文件的位置

现在装WIN7后第一件就是改变用户账户文件夹位置..因为里面存着一些软件的设定和信息等..不必要每次装后都手动改一次.. 已前用优化大师改.太麻烦.也不稳定有时有些目录不能完全改过来.. 通过命令mklink 可以完成 我已改成功了..大家放心用吧.. 1.激活ADMINISTRATOR账户 2.注销当然用户 3.进入ADMINISTRATOR账户 4.把C:\Users\*** 剪切到 D:\*** (不是复制是剪切) 5.运行-CMD mklink "C:\Users\***" &

package File; import java.io.File; import java.io.FileInputStream; import java.io.FileOutputStream; import java.io.IOException; import java.io.RandomAccessFile; /*利用RandomAccessFile类在指定文件指定位置插入内容.*/ public class InsertContent { public static void ins