hmmer 使用 » 转载文章请注明,转载自:博耘生物 » <hmmer的安装与使用> » 原文链接:http://boyun.sh.cn/bio/?p=1753   从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blast普及,这里是一篇入门级的介绍文章. hmmer下载与安装 对于Mac OS/X, Linux, UNIX系统,用源代码编译安装:

1.rm -rf * 删除当前目录下的所有文件,这个命令很危险,应避免使用. 所删除的文件,一般都不能恢复! 2.rm -f 其中的,f参数 (f --force ) 忽略不存在的文件,不显示任何信息 不会提示确认信息. 3.rm 命令删除一个目录中的一个或者多个文件或者目录,只用rm命令不会 删除目录,通常文件通常可以恢. 4.其他参数命令: -f, --force    忽略不存在的文件,从不给出提示. -i, --interactive 进行交互式删除 -r, -R, --recursiv

SQLMap参数命令   --method=<http方法> 指定使用的http方法 --data=<post数据> 提交post数据并对post数据进行测试 --param-del=<分隔符> 指定参数的分隔符 --cookie <cookie键值对> 添加cookie http请求头 --headers <http请求头字段和字段值> 添加http请求头,不同的头使用"(n"分隔 --auth-type和--auth-cr

1.先在数据库中完成储存过程 create proc usp_selectStudent ) as select * froom student where StudentName=@studentNanme go 2.然后再C#程序中调用储存过程防止Sql注入 //1.1 连接字符串 string str = "data source=.;initial catalog=MySchool;uid=sa;pwd=6375196"; //1.2 创建连接对象 呵呵 SqlConnecti

cmd.exe_参数_启动参数 /k指定运行后面的String命令,多个命令用&或&&连接,这样||不行&&&都能行,示例: cmd /k cd D:\1SVUSERFILES\Link&&&d: 启动命令解释程序 Cmd.exe 的新范例.如果在不含参数的情况下使用,cmd 将显示操作系统的版本和版权信息. 语法 cmd [{/c | /k}] [/s] [/q] [/d] [{/a | /u}] [/t:FG] [/e:{on |

标签(空格分隔): ceph,ceph运维,pool 1. 创建pool命令: ceph的pool有两种类型,一种是副本池,一种是ec池,创建时也有所区别 1.1 创建副本池: $ sudo ceph osd pool create pool-name pg_num pgp_num 如: [root@node3 ~]# ceph osd pool create testpool 128 128 pool 'testpool' created 1.2 创建ec池: $ sudo ceph osd

在 Linux 的 shell 中,我们把 - 和 -- 加上一个字符(字符串)叫做命令行参数. 主流的有下面几种风格Unix 风格参数 前面加单破折线 -BSD 风格参数 前面不加破折线GNU 风格参数 前面加双破折线Unix 风格参数 Unix风格的参数 一个减号,然后一个参数就是一个字母. Unix风格的参数是从贝尔实验室开发的AT&T Unix系统上原有的命令继承下来的.比如 ps -A ls -l rm -fr / git commit -am "xxx" 那么,为什

shift命令用于对参数的向左移动,通常用于在不知道传入参数个数的情况下依次遍历每个参数,然后进行相应的处理(常见与Linux中各种程序的启动脚本).在扫描处理脚本程序的参数时,经常要用到shift命令. shift命令每执行一次,参数序列顺次左移一个位置,$#的值减1,用于分别处理每个参数,移出去的参数不再可用. 注意:$#表示脚本后跟随的参数总的个数,$n可以获取脚本后跟随的第n个参数的值. 实例:加法计算 [root@youxi1 ~]# vim a.sh #!/bin/bash if [

# uname -a Linux euis1 2.6.9-55.ELsmp #1 SMP Fri Apr 20 17:03:35 EDT 2007 i686 i686 i386 GNU/Linux (查看当前操作系统内核信息) # cat /etc/issue | grep Linux Red Hat Enterprise Linux AS release 4 (Nahant Update 5) (查看当前操作系统发行版信息) # cat /proc/cpuinfo | grep name |

关于-N -N,--non-recursive Do not recurse into sub-projects 意思是,不递归到子项目(子模块). 举例: 一个父项目下Father面有3个子项目A.B.C,都生成jar包,则有Father.jar.A.jar.B.jar.C.jar;这个时候A项目依赖了B.C项目. 此时如果使用mvn clean install -N,则只会把Father.jar安装到本地仓库(~/.m2/repository),而不会安装其他三个包 造成的问题是,如果你此时

通过runlike去查看一个容器的docker run启动参数 安装pip yum install -y python-pip 安装runlike pip install runlike 查看docker run参数 发布一个容器 [root@docker01 ~]# docker run -d -v /data/nginx_test2:/data_volume_test2 -v /etc/hosts:/etc/hosts -p : --name nginx105 nginx:1.17 # 发布

1.select @@tx_isolation;    查询数据库设置的事务隔离级别 2.desc table_name;  显示表设计 3.show create table table_name; 显示建表语句

int main(int argc,char* argv[]) argc是命令行总的参数个数,argv[]是argc个参数,其中第0个参数是程序的全名,以后的参数命令行后面跟的用户输入的参数 比如:     int   main(int   argc,   char*   argv[])     {     int   i;     for   (i   =   0;   i<argc;   i++)     cout<<argv[i]<<endl;     cin>&

200 ? "200px" : this.width)!important;} --> 介绍 我们可以利用管道将一个命令的“标准输出”作为另一个命令的“标准输入”:但是这里的标准输出都是数据流,但是某些命令的输入只接收参数命令不接收数据流,那么这种一般的方法就无法实现,这里就需要借助xargs命令.xargs可以将数据流转换成命令参数作为标准输入的参数,接下来就来详细了解xargs的用法. 多行转换 [root@localhost test]# cat test 在当前的test

一:自定义实现InputFormat *数据源来自于内存 *1.InputFormat是用于处理各种数据源的,下面是实现InputFormat,数据源是来自于内存. *1.1 在程序的job.setInputFormatClass(MyselfmemoryInputFormat.class); *1.2 实现InputFormat,extends InputFormat< , >,实现其中的两个方法,分别是getSplits(..),createRecordReader(..). *1.3 g

/*Arrays jdk中为了便于开发,给开发者提供了Arrays类, 其中包含了很多数组的常用操作.例如快速输出.排序.查找等.*/ import java.util.Arrays; public class ShuZun { public static void main(String[] args) { //数组的字符串形式 int[] arr={8,3,6,7,2,9}; //数组的[输出] String str=Arrays.toString(arr); System.out.prin

"""argparse模块使得写用户友好性命令行接口很容易,程序定义所需要的参数,argparse会从ays.argv中提取出这些参数.argparse模块也能自动的产生帮助和用法信息,并且可以报告用户的无效参数错误sys.argv[0]表示程序所在路径ays.argv[1:]表示命令行的所有参数,是string的列表""" import argparse parser = argparse.ArgumentParser(description

adb和ideviceinstaller提供了许多参数供我们使用.命令行参数提供了这样的入口,针对不同的参数执行不同的命令. 1.命令行参数 命令行参数是一个String[] 数组,由JVM接收用户输入并传给main() 根据参数执行不同的代码 public class Hello { public static void main(String[] args){ System.out.println("Number of args: "+ args.length); for (Str

一.简介 文件操作对于我们来说也是非常常用的,在python中使用open函数来对文件进行操作,而在go语言中我们使用os.File对文件进行操作. 二.终端读写 操作终端句柄常量 os.Stdin: 标准输入 os.Stdout: 标准输出 os.Stderr: 标准错误输出 读写示例: package main import ( "fmt" "os" ) var( username,password string ) func main() { fmt.Prin

Redis 性能调优相关笔记 2016年09月25日 15:42:04 WenCoding 阅读数:4844更多 个人分类: Redis数据库   info可以使用info [类别]输出指定类别内容info命令输出的数据可分为10个类别,分别是:serverclients# Clientsconnected_clients:2 #Redis默认允许客户端连接的最大数量是10000.若是看到连接数超过5000以上,那可能会影响Redis的性能client_longest_output_list:0

命令行及命令参数 文章目录 命令行及命令参数 1.命令行提示符 2.命令和命令参数 简单的命令 date ls 命令参数 短参数(一个字母) 长参数(多个字母) 参数的值 其它参数 3.小结 4.参考资料 1.命令行提示符 我打开一个图形模式的终端,如下图: 我们看到终端的一行中开头是一串字符"liuawen@DESKTOP-HVI7SH0:~$",后面是闪动的光标,提示我们输入会从光标处开始. 开头那一串字符串是什么意思呢? 是"命令行提示符",就是提示我们在其后