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louvian算法gephi
2024-09-07
LabelRank非重叠社区发现算法介绍及代码实现(A Stabilized Label Propagation Algorithm for Community Detection in Networks)
最近在研究基于标签传播的社区分类,LabelRank算法基于标签传播和马尔科夫随机游走思路上改装的算法,引用率较高,打算将代码实现,便于加深理解. 这个算法和Label Propagation 算法不同的是计算复杂度较高,对每个标签都确定了概率,但是准确性比Label Propagation算法好. 一.概念 相关概念不再累述,详情见前两篇文章 二.算法思路 首先建立一个标签集合,C={1,2,……n},n是节点的数量.标签概率向量Pi(1*n),Pi(c)=节点i对标签c的概率估计,迭代过程中
社区发现算法 - Fast Unfolding(Louvian)算法初探
1. 社团划分 0x1:社区是什么 在社交网络中,用户相当于每一个点,用户之间通过互相的关注关系构成了整个网络的结构. 在这样的网络中,有的用户之间的连接较为紧密,有的用户之间的连接关系较为稀疏.其中连接较为紧密的部分可以被看成一个社区,其内部的节点之间有较为紧密的连接,而在两个社区间则相对连接较为稀疏. 整个整体的结构被称为社团结构.如下图,红色的黑色的点集呈现出社区的结构, 用红色的点和黑色的点对其进行标注,整个网络被划分成了两个部分,其中,这两个部分的内部连接较为紧密,而这两个社区之间的连
社区发现算法问题&&NetworkX&&Gephi
在做东西的时候用到了社区发现,因此了解了一下有关社区发现的一些问题 1,社区发现算法 (1)SCAN:一种基于密度的社团发现算法 Paper: <SCAN: A Structural Clustering Algorithm for Networks> Auther: Xiaowei Xu, Nurcan Yuruk, Zhidan Feng, Thomas A. J. Schweiger Conference: SIGKDD 2007 主要概念: 节点相似度定义为两个节点共同邻居的数目与
Gephi可视化(二)——Gephi Toolkit叫板Prefuse
继在园子里写的<Gephi可视化(一)——使用Gephi Toolkit创建Gephi应用>介绍了如何使用Gephi Toolkit工具集进行可视化编程后,本篇对Gephi Toolkit进行一个详尽的介绍,了解其工作原理以及与Gephi应用程序之间的差异,Gephi Toolkit对于平台的要求使用方法,最后通过比较可视化工具集Prefuse,列举两种可视化工具之间的相似之处. Gephi Toolkit是一个标准的java类库,任何java工程都可以引入使用(包括eclipse.netbe
Gephi可视化(一)——使用Gephi Toolkit创建Gephi应用
在Prefuse上摸打滚爬了一段时间,发现其和蔼可亲,容易上手.但是每每在打开gephi,导入数据再运行时,总还是在心里暗自赞叹gephi的绚烂之极,无与匹敌,当然,gephi也有自己的缺陷,但是gephi是一个在发展的.进步的.不断壮大的开源软件.纵使她曾经那般伤我,我仍是对其恋恋不舍,好吧,我已经病入膏肓..... 言归正传,Gephi是一款开源免费跨平台基于JVM的复杂网络分析软件, 其主要用于各种网络和复杂系统,动态和分层图的交互可视化与探测开源工具.可用作:探索性数据分析,链接分析,社
可视化工具gephi源码探秘(一)
今天在老大和小梁的鼓舞和忽悠下(^_^),我决定还是把之前下载好的gephi源码好好利用起来,不在朝三暮四的想d3js或是什么vizster,用心去选择一个自己熟悉的,而不是一直在各种困难之间来回徘徊,踌躇不前,虚度光阴.老大有句话说的好,有问题了就要想着怎么去解决它,而不是躲避,要想尽各种办法去解决问题. gephi这款软件以前在做社区分类的时候用过,现在主要是想深究以下内部的布局算法,比如力导向算法,下载下来的源码如图所示: 主要的核心源码模块在目录modulers中,部分文件如下: 1
PageRank算法初探
1. PageRank的由来和发展历史 0x1:源自搜索引擎的需求 Google早已成为全球最成功的互联网搜索引擎,在Google出现之前,曾出现过许多通用或专业领域搜索引擎.Google最终能击败所有竞争对手,很大程度上是因为它解决了困扰前辈们的最大难题:对搜索结果按重要性排序.而解决这个问题的算法就是PageRank.毫不夸张的说,是PageRank算法成就了Google今天的地位. 1. 搜索引擎的核心框架 从本质上说,搜索引擎是一个资料检索系统,搜索引擎拥有一个资料库(具体到这里就是互联
关系网络数据可视化:1. 关系网络图&Gephi
1.关系网络图 如何来表示两个对象之间的关系? 把对象变成点,点的大小.颜色可以是它的两个参数,两个点之间的关系可以用连线来表示.连线分为无向(只是连接的导向,一些简单的关系很容易体现)和有向(复杂网络,连接+方向,线本身的方向代表了连接的关系同时线的粗线也可以表示线的连接强度). 这个图 有点杂乱,看不出哪个点之间连接了,看不出点之间的特征. 导向分为3类: 力导向布局.空间导向布局.规则导向布局 1.1 力导向布局 它除了点与点之间的联系外,还分为空间聚集的聚类,反应出不同团队.不同聚类之间
Gephi可视化(二)
继在园子里写的<Gephi可视化(一)——使用Gephi Toolkit创建Gephi应用>介绍了如何使用Gephi Toolkit工具集进行可视化编程后,本篇对Gephi Toolkit进行一个详尽的介绍,了解其工作原理以及与Gephi应用程序之间的差异,Gephi Toolkit对于平台的要求使用方法,最后通过比较可视化工具集Prefuse,列举两种可视化工具之间的相似之处. Gephi Toolkit是一个标准的java类库,任何java工程都可以引入使用(包括eclipse.netbe
B树——算法导论(25)
B树 1. 简介 在之前我们学习了红黑树,今天再学习一种树--B树.它与红黑树有许多类似的地方,比如都是平衡搜索树,但它们在功能和结构上却有较大的差别. 从功能上看,B树是为磁盘或其他存储设备设计的,能够有效的降低磁盘的I/O操作数,因此我们经常看到有许多数据库系统使用B树或B树的变种来储存数据结构:从结构上看,B树的结点可以有很多孩子,从数个到数千个,这通常依赖于所使用的磁盘的单元特性. 如下图,给出了一棵简单的B树. 从图中我们可以发现,如果一个内部结点包含n个关键字,那么结点就有n+1个孩
分布式系列文章——Paxos算法原理与推导
Paxos算法在分布式领域具有非常重要的地位.但是Paxos算法有两个比较明显的缺点:1.难以理解 2.工程实现更难. 网上有很多讲解Paxos算法的文章,但是质量参差不齐.看了很多关于Paxos的资料后发现,学习Paxos最好的资料是论文<Paxos Made Simple>,其次是中.英文版维基百科对Paxos的介绍.本文试图带大家一步步揭开Paxos神秘的面纱. Paxos是什么 Paxos算法是基于消息传递且具有高度容错特性的一致性算法,是目前公认的解决分布式一致性问题最有效的算法之一
【Machine Learning】KNN算法虹膜图片识别
K-近邻算法虹膜图片识别实战 作者:白宁超 2017年1月3日18:26:33 摘要:随着机器学习和深度学习的热潮,各种图书层出不穷.然而多数是基础理论知识介绍,缺乏实现的深入理解.本系列文章是作者结合视频学习和书籍基础的笔记所得.本系列文章将采用理论结合实践方式编写.首先介绍机器学习和深度学习的范畴,然后介绍关于训练集.测试集等介绍.接着分别介绍机器学习常用算法,分别是监督学习之分类(决策树.临近取样.支持向量机.神经网络算法)监督学习之回归(线性回归.非线性回归)非监督学习(K-means聚
红黑树——算法导论(15)
1. 什么是红黑树 (1) 简介 上一篇我们介绍了基本动态集合操作时间复杂度均为O(h)的二叉搜索树.但遗憾的是,只有当二叉搜索树高度较低时,这些集合操作才会较快:即当树的高度较高(甚至一种极端情况是树变成了1条链)时,这些集合操作并不比在链表上执行的快. 于是我们需要构建出一种"平衡"的二叉搜索树. 红黑树(red-black tree)正是其中的一种.它可以保证在最坏的情况下,基本集合操作的时间复杂度是O(lgn). (2) 性质 与普通二叉搜索树不
散列表(hash table)——算法导论(13)
1. 引言 许多应用都需要动态集合结构,它至少需要支持Insert,search和delete字典操作.散列表(hash table)是实现字典操作的一种有效的数据结构. 2. 直接寻址表 在介绍散列表之前,我们先介绍直接寻址表. 当关键字的全域U(关键字的范围)比较小时,直接寻址是一种简单而有效的技术.我们假设某应用要用到一个动态集合,其中每个元素的关键字都是取自于全域U={0,1,…,m-1},其中m不是一个很大的数.另外,假设每个元素的关键字都不同. 为表示动态集合,我们用一个数组,或称为
虚拟dom与diff算法 分析
好文集合: 深入浅出React(四):虚拟DOM Diff算法解析 全面理解虚拟DOM,实现虚拟DOM
简单有效的kmp算法
以前看过kmp算法,当时接触后总感觉好深奥啊,抱着数据结构的数啃了一中午,最终才大致看懂,后来提起kmp也只剩下“奥,它是做模式匹配的”这点干货.最近有空,翻出来算法导论看看,原来就是这么简单(先不说程序实现,思想很简单). 模式匹配的经典应用:从一个字符串中找到模式字串的位置.如“abcdef”中“cde”出现在原串第三个位置.从基础看起 朴素的模式匹配算法 A:abcdefg B:cde 首先B从A的第一位开始比较,B++==A++,如果全部成立,返回即可:如果不成立,跳出,从A的第二位开
神经网络、logistic回归等分类算法简单实现
最近在github上看到一个很有趣的项目,通过文本训练可以让计算机写出特定风格的文章,有人就专门写了一个小项目生成汪峰风格的歌词.看完后有一些自己的小想法,也想做一个玩儿一玩儿.用到的原理是深度学习里的循环神经网络,无奈理论太艰深,只能从头开始开始慢慢看,因此产生写一个项目的想法,把机器学习和深度学习里关于分类的算法整理一下,按照原理写一些demo,方便自己也方便其他人.项目地址:https://github.com/LiuRoy/classfication_demo,目前实现了逻辑回归和神经网
46张PPT讲述JVM体系结构、GC算法和调优
本PPT从JVM体系结构概述.GC算法.Hotspot内存管理.Hotspot垃圾回收器.调优和监控工具六大方面进行讲述.(内嵌iframe,建议使用电脑浏览) 好东西当然要分享,PPT已上传可供下载(点此下载),另外良心推荐阅读<深入理解Java虚拟机JVM高级特性与最佳实践.pdf>(点此下载).
【C#代码实战】群蚁算法理论与实践全攻略——旅行商等路径优化问题的新方法
若干年前读研的时候,学院有一个教授,专门做群蚁算法的,很厉害,偶尔了解了一点点.感觉也是生物智能的一个体现,和遗传算法.神经网络有异曲同工之妙.只不过当时没有实际需求学习,所以没去研究.最近有一个这样的任务,所以就好好把基础研究了一下,驱动式学习,目标明确,所以还是比较快去接受和理解,然后写代码实现就好了.今天就带领大家走近TSP问题以及群蚁算法. 机器学习目录:[目录]数据挖掘与机器学习相关算法文章总目录 本文原文地址:群蚁算法理论与实践全攻略——旅行商等路径优化问题的新方法 1.关于旅行商(
Android数据加密之SHA安全散列算法
前言: 对于SHA安全散列算法,以前没怎么使用过,仅仅是停留在听说过的阶段,今天在看图片缓存框架Glide源码时发现其缓存的Key采用的不是MD5加密算法,而是SHA-256加密算法,这才勾起了我的好奇心,所以趁着晚上没啥事,来学习一下. 其他几种加密方式: Android数据加密之Rsa加密 Android数据加密之Aes加密 Android数据加密之Des加密 Android数据加密之MD5加密 Android数据加密之Base64编码算法 Android数据加密之异或加密算法 SHA加密算
Android数据加密之Base64编码算法
前言: 前面学习总结了平时开发中遇见的各种数据加密方式,最终都会对加密后的二进制数据进行Base64编码,起到一种二次加密的效果,其实呢Base64从严格意义上来说的话不是一种加密算法,而是一种编码算法,为何要使用Base64编码呢?它解决了什么问题?这也是本文探讨的东西? 其他几种加密方式: Android数据加密之Rsa加密 Android数据加密之Aes加密 Android数据加密之Des加密 Android数据加密之MD5加密 Android数据加密之Base64编码算法 Android
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