Martini粗粒化模型一开始就是为脂质开发的.(http://jerkwin.github.io/2016/11/03/Martini%E5%AE%9E%E4%BE%8B%E6%95%99%E7%A8%8BLip/ Martini方法的主要思想是, 根据简单的分子构建模块构建可扩展的粗粒化模型, 使用少量的参数和标准的相互作用势达到实用性与可移植性的最大化. Martini大致把全原子(重原子)按照4:1的比例转化为粗粒化珠子, 在2.0版本中, 定义了18种珠子类型来表征其化学特性. 粗粒化

本文介绍两种Golang的开发环境一种基于notepad++.还有一种基于liteide. 1.下载Golang语言的pkg:http://golangtc.com/download 直接点击安装,一路next. 2.程序猿必备神器notepad++开发Golang环境非常easy 一次点击:插件->Plugin Manger->Show Plugin Manger,安装插件GOnpp.重新启动notepad++. 新建文件命名为hello.go用notepad++打开.拷贝例如以下代码: p

如果只是想了解chat的实现方式,在gorilla和revel框架里面都有完整的chat实例可以提供参考.本篇讲解的是,如何基于martini实现websocket的聊天. 配置步骤: 1 已经安装了go命令,配置了GOPATH 2 安装gorilla/websocket go get github.com/gorilla/websocket 3 安装martini go get github.com/go-martini/martini 项目文件列表 $GOPATH/demo/home.htm

出于效率等原因,最近将web框架由martini切换为了beego,其他地方都很平顺,只是两个框架的handler签名不一致,需要修改,所以耗时较长,这是预计到的.但是有一个地方没有预计到,也耗费了较多时间,那就是静态文件的服务. 用过martini的tx都知道,在mairtini中如果我们设置一个目录为静态文件目录,只需添加martini的Static插件,如设置web子目录为应用的静态文件路径: m.Use(martini.Static("web")) 此时,如果我们访问一个url

一.首先,需要了解一下websocket基本原理:here 二.go语言的websocket实现: 基于go语言的websocket也有不少,比如github.com/gorilla/websocket.这里选用的应该算是官方的实现code.google.com/p/go.net/websocket 使用go get安装下载即可.(不过,由于周知的原因:(,我是通过golangtc.com的第三方包下载功能才下载来的) 三.server端 第一个遇到的问题,websocket如何和martini

继上一篇关于inject注入的笔记,理解了martini的关键核心之一:依赖注入.注入回调函数,由运行时进行主动调用执行.这一篇主要是注解martini的骨架martini.go的实现,下面先从一个简单的martini使用实例,即创建一个最简单的http服务器开始. server.go //martini使用简单实例 package main import "github.com/go-martini/martini" func main() { m := martini.Classi

martini是go语言写的一个超级轻量的web开源框架,具体源码可在github搜索找到.13年那会开始接触go语言时有稍微看过这个框架,由于之后没有继续使用go就慢慢忽略了,最近由于手头项目可能会用到,因此又想起这个框架. github上显示该项目更新不断,说明真是个好框架,简洁高效的东西从来都不缺少拥护者.周末阅读martini源码时做了注释写下一些理解,主要是inject.go以及martini.go两个文件,后续估计还会再阅读路由功能的主要文件. 注:以下的'泛型'均表示interfa

本文介绍golang中的优秀web开发框架martini! 序 Martini框架是使用Go语言作为开发语言的一个强力的快速构建模块化web应用与服务的开发框架.Martini是一个专门用来处理Web相关内容的框架,其并没有自带有关ORM或详细的分层内容.所以当我们使用Martini作为我们的开发框架时,我们还需要选取适合的ORM等其他包. 安装 go get github.com/codegangsta/martini 使用 我们可以使用如下的代码来测试我们安装的包是否是可用的: // ser

ChatRoom A stand-alone ChatRoom in Martini Please Star https://github.com/renleimlj/ChatRoom Interface Usage install Martini go get github.com/go-martini/martini install websocket go get github.com/gorilla/websocket install this ChatRoom go get githu

golang webservice[ json Martini webframe] https://github.com/brunoga/go-webservice-sample 自己修改了一下例子,在client 中添加了 访问的步骤,不用再到命令行中 用 go run xxxx 跑了. 下面是修改后的源码: http://files.cnblogs.com/files/rojas/martini-go-webservice-sample-master.zip

文献名:Untargeted lipidomics reveals specific lipid abnormality in nonfunctioning human pituitary adenomas(非靶向脂质组学揭示非功能人类脑垂体瘤中的特异性脂质) 期刊名:Journal of Proteome Research 发表时间:(2020年1月) IF:3.78 单位:中国科学院大连物理化学研究所 技术:非靶向脂质组学 一. 概述: 无功能垂体腺瘤(functionless pituit

文献名:Development of a High Coverage Pseudotargeted Lipidomics Method Based on Ultra-High Performance Liquid Chromatography−Mass Spectrometry(基于超高效液相色谱-质谱法的高覆盖拟靶向脂质组学方法的开发) 期刊名:Analytical Chemistry 发表时间:(2018年5月) IF:6.38 单位: 中国科学院大连化学物理研究所 中国科学院大学 生物材料

部分内容来自http://jerkwin.github.io/9999/08/01/Martini%E7%B2%97%E7%B2%92%E5%8C%96%E5%8A%9B%E5%9C%BA%E4%BD%BF%E7%94%A8%E6%89%8B%E5%86%8C/ 参考了Martini官网的一些内容http://cgmartini.nl/ Martini力场是一种适用于生物分子体系分子动力学模拟的粗粒化(CG, coarse-grain)力场, 该力场采用系统化的方式进行参数化,结合了"自上而下&

(2013-08-14 14:58:41) 转载▼ 标签: 学习笔记 it 很久没有写博文了,之所以重新写还是因为看了coursera的computational neuroscience之后,发现这个学科里的东西对于我们对于人工神经网络的理解是相当有助益的,往大了说,你要是很好的掌握并深入了解了这个学科的话你甚至可以设计属于你自己的神经网络模型,据说hinton的dropout也是受了这个学科的启发的.之所以选择week5讲起是因为我觉得这门课的week5和6是连接我们所熟识的神经网络和真实神

http://jerkwin.github.io/2016/10/10/Martini%E5%AE%9E%E4%BE%8B%E6%95%99%E7%A8%8BMol/ 对新分子的参数化可以分为两种情况,一种是基于已知片段对新分子进行参数化,一种是基于全原子力场模拟对新分子进行参数化. 基于已知片段对新分子进行参数化:为一个含有已知片段, 但尚未被描述过的新分子构建Martini拓扑. 图1 非对称"流星锤"脂分子族, 大亲水端葡萄糖通过烷烃链与小亲水端连接 首先, 将图1中的分子拆分为

输入参数:一个典型的mdp文件 1 ; 2 ; STANDARD MD INPUT OPTIONS FOR MARTINI 2.x 3 ; Updated 02 feb 2013 by DdJ 4 ; 5 ; for use with GROMACS 4.5/4.6 6 ; 7 8 title = Martini 9 10 ; TIMESTEP IN MARTINI 11 ; Most simulations are numerically stable 12 ; with dt=40 fs,

I was recently reading a series on “Write Sequential Non-Blocking IO Code With Fibers in NodeJS” by Venkatesh. Venki was essentially trying to emphasize that writing non-blocking code in NodeJS (either via callbacks, or using promises) can get hairy

Indexes and search engines These sites provide indexes and search engines for Go packages: godoc.org gowalker gosearch Sourcegraph Contributing To edit this page you must be a contributor to the go-wiki project. To get contributor access, send mail t

参考资料: 通过beego快速创建一个Restful风格API项目及API文档自动化:  http://www.cnblogs.com/huligong1234/p/4707282.html Go 语言构建 RESTful Web 服务:  https://www.oschina.net/translate/hardcore-google-communicating-go Golang中使用 JWT认证来 保障Restful JSON API的安全(英文):   http://www.tuico

martini.go 对路由采用正则表达式处理,最终转化成正则表达式. 添加route对应的调用栈 按照生成,验证,添加的步骤 route := newRoute(method, pattern, handlers) route.Validate() r.appendRoute(route) martini会把任意类型的func 包装好,所以这里只要验证该类型是不是合适的func,因为一开始使用的是一个空的接口参数. func validateHandler(handler Handler) {