http://wiki.bits.vib.be/index.php/Identify_the_Phred_scale_of_quality_scores_used_in_fastQ # S - Sanger Phred+33, raw reads typically (0, 40) # X - Solexa Solexa+64, raw reads typically (-5, 40) # I - Illumina 1.3+ Phred+64, raw reads typically (0, 4

今天用fastx_tookit 时遇到问题, 我的fastq 文件的碱基质量值格式为phred33, 而fastq_tookit 默认碱基质量值的格式为phred64, 所以报错了,提示我的fastq文件中包含非法的碱基质量值,逗号 逗号的在ascii 码表中对应的十进制数字为44, 按照phred 33 格式,其对应的碱基质量值为11,如果按照phred64处理的化, 其质量值为-20,此时就会报错, 所以需要将碱基质量给位phred64 格式的,我没找到现有工具, 只能自己写了,虽然很慢,

转载:http://blog.csdn.net/soyabean555999/article/details/62235577 一.转录组还是基因组? map常用的工具有bowtie/bowtie2, BWA,SOAP1/SOAP2等.这个问题又会被分成两个问题,是基因组测序(DNA-seq)还是转录组测序(mRNA-seq).其中的区别是对于真核生物而言,mRNA序列与DNA序列并不完全相同,在经历了后剪切之后,成熟的mRNA可能是原基因的一部分,甚至顺序及个别碱基会产生变化.如果是mRNA测

说到数据类型,我们先理一下JavaScript中常见的几种数据类型: 基本类型:string,number,boolean 特殊类型:undefined,null 引用类型:Object,Function,Function,Array,Date,... 很多时候我们都需要通过判断变量的数据类型来进行下一步操作,下面我们介绍常用的三种方法: ① typeof typeof 返回一个表示数据类型的字符串,返回结果包括:number.boolean.string.object.undefined.fu

问题描述 能被2整除的数称为偶数,不能被2整除的数称为奇数.给一个整数x,判断x是奇数还是偶数. 输入格式 输入包括一个整数x,0<=x<=100000000. 输出格式 如果x是奇数,则输出"odd",如果是偶数,则输出"even". 样例输入 10 样例输出 even 样例输入 2009 样例输出 odd #include<stdio.h> int main(){ int x; scanf("%d",&x);

Android 判断一个 View 是否可见 getLocalVisibleRect(rect) 与 getGlobalVisibleRect(rect) [TOC] 这两个方法的区别 View.getGlobalVisibleRect(rect); //以屏幕 左上角 为参考系的 View.getLocalVisibleRect(rect); //以目标 View 左上角 为参考系 鉴于这一点的区别,View.getLocalVisibleRect(rect) 的 rect.left恒等于 0

ToString和string.Concat(可屏蔽Null的异常)性能相差不大,一些中小项目完全可以用Concat(新人容易忘记判断Null的情况,遇到太多了,所以建议重写tostring方法,内部用这个实现) 比较:

题目: 给Array对象原型上添加一个sameStructureAs方法,该方法接收一个任意类型的参数,要求返回当前数组与传入参数数组(假定是)相对应下标的元素类型是否一致. 假设已经写好了Array.prototype.sameStructureAs ,会有下面的结果: [1,1].sameStructureAs([2,2]) // true [1,[1,1]].sameStructureAs([2,[2,2]]) // true [1,[1]].sameStructureAs([[2],2]

1.鼠标进入容器方向的判定 判断鼠标从哪个方向进入元素容器是一个经常碰到的问题,如何来判断呢?首先想到的是:获取鼠标的位置,然后经过一大堆的if..else逻辑来确定.这样的做法比较繁琐,下面介绍两种比较方便的方法: 第一种方法,利用圆和反正切三角函数 如下图所示: 以div容器的中心点作为圆心,以高和宽的最小值作为直径画圆,将圆以[π/4,3π/4),[3π/4,5π/4),[5π/4,7π/4),[-π/4,π/4)划分为四个象限. 代码如下: $(".box").on("

js 判断类型的在开发中是很常用的,因为js 是弱类型的语言,var 可以接受任何形式的类型,但是在真正的开发中,我们需要根据不同类型做不同的处理,所以这个是必须的精通. 首先需要知道 typeof这个方法 了解可以看看http://www.cnblogs.com/lidabo/archive/2011/12/29/2305770.html 1.判断Object类型  isObject(arg) 根据了解,对象.数组.null 返回的值是 object,那么只要把null排除就可以了. func

程序计数器,虚拟机栈和本地方法栈 首先我们先来看下垃圾回收中不会管理到的内存区域,在Java虚拟机的运行时数据区我们可以看到,程序计数器,虚拟机栈,本地方法栈这三个地方是比较特别的.这个三个部分的特点就是线程私有的,它们随着线程的创建而诞生,也因线程的结束而灭亡.栈中的栈帧随着方法的进入和退出会有条不絮的执行着进栈和出栈.每一个栈帧中分配多少内存,基本上是在类结构确认下来的时候就已知的,因此这几个区域的内存分配和回收都具备确定性,在这几个区域内就不需要过多考虑回收的问题,因为方法结束或者线程结束

方法一:access函数判断文件夹或者文件是否存在 函数原型: int access(const char *filename, int mode); 所属头文件:io.h filename:可以填写文件夹路径或者文件路径 mode:0 (F_OK) 只判断是否存在 2 (R_OK) 判断写入权限 4 (W_OK) 判断读取权限 6 (X_OK) 判断执行权限 用于判断文件夹是否存在的时候,mode取0,判断文件是否存在的时候,mode可以取0.2.4.6. 若存在或者具有权限,返回值为0:不存

<?phpheader("content-type:text/html;charset=utf-8");date_default_timezone_set("Asia/Shanghai");error_reporting(0);// 根据IP判断城市$user_ip = $_SERVER['REMOTE_ADDR'];$url ="http://int.dpool.sina.com.cn/iplookup/iplookup.php?format=js

WEB开发中如何通过Javascript来判断终端为PC.IOS(iphone).Android呢? 可以通过判断浏览器的userAgent,用正则来判断手机是否是ios和Android客户端. var u = navigator.userAgent; isAndroid = u.indexOf('Android') > -1 || u.indexOf('Adr') > -1, //android终端 isiOS = !!u.match(/\(i[^;]+;( U;)? CPU.+Mac OS

//判断手机号码格式是否正确 + (BOOL)valiMobile:(NSString *)mobile{     mobile = [mobile stringByReplacingOccurrencesOfString:@" " withString:@""];     if (mobile.length != 11)     {         return NO;     }else{         /**          * 移动号段正则表达式    

从iOS8系统开始,用户可以在设置里面设置在WiFi环境下,自动更新安装的App.此功能大大方便了用户,但是一些用户没有开启此项功能,因此还是需要在程序里面提示用户的 方法一:在服务器接口约定对应的数据,这样,服务器直接传递信息,提示用户有新版本,可以去商店升级 注意:这个方法是有毛病的,若您的App还没审核通过,而移动端后台数据已经更新,后台给您返回的版本号是最新的版本号,老版本会提示用户升级,但是用户点击升级后跳转至AppStore却发现App还未更新 方法二:检测手机上安装的App版本,然

1.用Java自带的函数 public static boolean isNumeric(String str){ for(int i=str.length();--i>=0;){ if (!Character.isDigit(str.charAt(i))){ return false; } } return true; } 2.用正则表达式 public static boolean isNumeric(String str){ Pattern pattern =Pattern.compile

今天调试一段代码的时候,看到其中一个变量,想知道它到底是jquery对象还是dom对象. 虽然直接console出这个对象,看它的内部可以判断出来.但是我想有没有什么更方便的方法呢. 后来我想到了一个办法,就是使用instanceof方法来判断. 代码如下: var jqueryObject = $("#check"); jqueryObject instanceof jQuery; //jqueryObject 是jQuery对象 var domObject = document.q

代码 /// <summary> 断言器,用于判断和抛出异常 /// </summary> static class Assertor { /// <summary> 如果value值是null 则抛出异常 /// </summary> /// <param name="value">参数值</param> /// <param name="name">参数名称</param&

之前伤脑筋写过一次在Web中,JS,ActiveXObject去读取显示器数量.分辨率去判断单双屏跳转. 那么在客户端中,用C#去读取硬件信息,更方便更容易! 思路参考代码: ) { //此显示器是否为主屏 ].Primary) { ].Bounds.Y; ].Bounds.X; } else { ].Bounds.Y; ].Bounds.X; } } ) { ].Bounds.Y; ].Bounds.X; }