Cell Ranger是一个"傻瓜"软件,你只需提供原始的fastq文件,它就会返回feature-barcode表达矩阵.为啥不说是gene-cell,举个例子,cell hashing数据得到的矩阵还有tag行,而列也不能肯定就是一个cell,可能考虑到这个才不叫gene-cell矩阵吧~它是10xgenomics提供的官方比对定量软件,有四个子命令,我只用过cellranger count,另外三个cellranger mkfastq.cellranger aggr.cellra

python安装 windows 下载安装包 https://www.python.org/downloads 改环境变量 [右键计算机]-->[属性]-->[高级系统设置]-->[高级]-->[环境变量]--> 如:原来的值;C:\python3,切记前面有分号 linux   wget https://www.python.org/ftp/python/3.5.2/Python-3.5.2.tgz tar xf Python-3.5.0.tgz cd Python-3.5

1.安装numpy,matplotlib,scipy和scikit-learn win7系统下直接采用pip或者下载源文件进行安装numpy,matplotlib,scipy时会遇到各种问题,这是因为这些库需要C编译环境,所以无法完成安装会出错. 采用以下方法安装完成: (1)在http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/上找到numpy对应版本的whl文件下载,比如32位和64位系统,python的版本2.7还是3.x.然后 pip install do

转载自 醇酒醉影 python安装完毕后,提示找不到ssl模块: [root@localhost ~]# python2.7.5 Python 2.7.5 (default, Jun 3 2013, 11:08:43) [GCC 4.1.2 20080704 (Red Hat 4.1.2-54)] on linux2 Type "help", "copyright", "credits" or "license" for mo

这篇文章主要讲述Python如何安装Numpy.Scipy.Matlotlib.Scikit-learn等库的过程及遇到的问题解决方法.最近安装这个真是一把泪啊,各种不兼容问题和报错,希望文章对你有所帮助吧!你可能遇到的问题包括:        ImportError: No module named sklearn 未安装sklearn包        ImportError: DLL load failed: 找不到指定的模块        ImportError: DLL load fai

最近要对一系列数据做同比比较,需要用到numpy和pandas来计算,不过使用python安装numpy和pandas因为linux环境没有外网遇到了很多问题就记下来了.首要条件,python版本必须是2.7以上. linux首先安装依赖包 yum -y install blas blas-devel lapack-devel lapack yum -y install seaborn scipy yum -y install freetype freetype-devel libpng lib

python安装模块的方法很多,在此仅介绍一种,不需要安装其他附带的pip等,python安装完之后,配置环境变量,我由于中英文分号原因,环境变量始终没能配置成功汗. 1:下载模块的压缩文件解压到任意文件夹, 2:在有setup.py的文件夹目录打开cmd(win10下在该目录文件夹下按住shift鼠标右键在此处打卡控制台) 3:python setup.py install 就Ok了

由于使用公司服务器时没有root权限,只能把python安装到个人文件夹下,使用源码包方式安装,这里记录一下. 1.python下载 cd到目录/users/w,在此目录下安装python.通过wget命令下载python源码包: $ wget https://www.python.org/ftp/python/2.7.9/Python-2.7.9.tgz 2.解压python到当前目录 $ .tar.xz 3.编译与安装 a)./configure --prefix=/users/w/pyth

Python安装.配置图文详解 目录: 一. Python简介 二. 安装python 1. 在windows下安装 2. 在Linux下安装 三. 在windows下配置python集成开发环境(IDE) 1. 在Eclipse中安装PyDev插件 2. 配置Python Interpreters 四. 创建Python Project 五. 编写HelloWorld 六. 小结 一. Python简介: Python在Linux.windows.Mac os等操作系统下都有相应的版本,不管在

解决两个问题: (1)Import Error: No module named numpy (2)Python version 2.7 required, which was not found in the registry (1)这种错误是因为没有安装numpy科学计算库,因此需要安装此模块. 首先下载正确的exe安装文件:numpy-MKL-1.8.0.win-amd64-py2.7.exe. 接着我们双加打开安装文件,点击运行按钮 安装过程很简单,点击下一步 在第一步,如果你看到自己的

原文:http://www.blogbus.com/hx1987-logs/271955446.html 安装python (1)下载python安装包,下载网站https://www.python.org/downloads,选择Python3.4.2版本 (2)安装python,选择安装路径,这里选择D:\Python34 (3)添加环境变量,这里添加python路径,即为安装路径D:\Python34 (4)打开cmd(窗口键+r),输入执行set path=%path%;D:\Pytho

2.7的坑里出不来了,现在已经换到3.4了,不存在下列问题. win7下安装pip    http://blog.chinaunix.net/uid-24984661-id-4202194.html 1.首先下载setuptools,下载地址https://pypi.python.org/pypi/setuptools#downloads2.解压下载后的文件,进入命令行,将目录切换到解压后文件夹所在路径,执行命令python ez_install.py3.配置环境变量:将python安装目录下的

1.首先访问http://www.python.org/download/去下载最新的python版本. 2.安装下载包,一路next. 3.为计算机添加安装目录搭到环境变量,如图把python的安装目录添加到pth系统变量中即可. 4.测试python安装是否成功,cmd打开命令行输入 python 命令,如下图即成功了 5.Hello World! 按照很多资料上写的,输入 print 'Hello World!' 居然是不成功,说语法错误!这是一个坑了,很多资料是都是python 1.*/

*:first-child { margin-top: 0 !important; } body>*:last-child { margin-bottom: 0 !important; } /* BLOCKS =============================================================================*/ p, blockquote, ul, ol, dl, table, pre { margin: 15px 0; } /* HEAD

1.python安装(windows) 1.1 下载安装包 https://www.python.org/downloads/ 1.2 安装 python2.7默认安装路径:C:\python27 注:安装路径中尽量不要带有空格 1.3 配置环境变量 windows [右键计算机] -> [属性] -> [高级系统设置] -> [环境变量] -> [系统变量] -> [双击变量Path] -> [Python安装目录追加到变量值中,用';'隔开] Linux,Mac 无

Python 安装 httpie 前段时间开发RESTful的程序,使用浏览器插件HttpRequester,挺高级,易用的.后来在RESTHeart项目中认识了httpie,感觉高大上.在使用httpie之前,需要在机器上先安装python运行环境. 1.从python网站上下载最新3.x安装包,xp不支持3.4以上版本 2.安装python到机器上,在电脑的环境变量path中增加python的安装目录 添加python脚本目录到path中 3.打开CLI窗口,安装httpie 执行命令 1 

http://www.cnblogs.com/haython/p/3970426.html easy_install和pip都是用来下载安装Python一个公共资源库PyPI的相关资源包的 首先安装easy_install 下载地址:https://pypi.python.org/pypi/ez_setup 解压,安装. python ez_setup.py 安装好easy_install 之后 再安装pip 下载地址:https://pypi.python.org/pypi/pip 解压,安装

 Python安装.配置图文详解 目录: 一. Python简介 二. 安装python 1. 在windows下安装 2. 在Linux下安装 三. 在windows下配置python集成开发环境(IDE) 1. 在Eclipse中安装PyDev插件 2. 配置Python Interpreters 四. 创建Python Project 五. 编写HelloWorld 六. 小结 一. Python简介: Python在Linux.windows.Mac os等操作系统下都有相应的版本,不管

默认情况下,在windows下安装python之后,系统并不会自动添加相应的环境变量.此时不能在命令行直接使用python命令. 1. 首先需要在系统中注册python环境变量:假设python的安装路径为c:\python2.6,则修改我的电脑->属性->高级->环境变量->系统变量中的PATH为: (为了在命令行模式下运行Python命令,需要将python.exe所在的目录附加到PATH这个环境变量中.) PATH=PATH;c:\python26 上述环境变量设置成功之后,

1.Python简介:Python在Linux.windows.Mac os等操作系统下都有相应的版本,不管在什么操作系统下,它都能够正常工作.除非使用平台相关功能,或特定平台的程序库,否则可以跨平台使用.python有许多优点,如:简单.易学.免费开源.高层语言.可移植性.解释性.面向对象.可扩展性.可嵌入性.丰富的库.2 安装python Windows之所以使用的这么普遍,是因为在windows下所有的操作都变的非常简单,安装软件只要点点"下一步"就可以了.Python也不例外,