Linux中fasta文件的拆分与合并 FASTA文件的拆分: (1)如果从一个文件a提取第11至20个序列存到另一个文件b: awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=21{print ">"$0}' a.fasta|sed '/^$/d'>b.fasta (2)将某一文件a中每一条序列保存到一个文件中: awk '/^>/{f=++d".fasta"} {print > f

Shell排序(希尔排序)算法Shell排序严格来说基于插入排序的思想,其又称为希尔排序或者缩小增量排序. Shell排序的流程:1.将由n个元素的数组分成n/2个数字序列,第1个数据和第n/2+1个数据为一对,......2.一次循环使每个序列对排序好顺序3.然后,再变为n/4个序列,再次排序.4.不断重复上述过程,随着序列减少最后为一个,也就完成整个排序 /** * Shell排序(希尔排序) * @author Red Ants(guangboyuan.cn) * 微信公众号:程序员之路

sort分类操作 示例文件 Boys in Company C:HK:192:2192 Alien:HK:119:1982 The Hill:KL:63:2972 Aliens:HK:532:4892 Star Wars:HK:301:4102 A Few Good Men:KL:445:5851 Toy Story:HK:239:3972 sort的命令格式为:sort -cmu -o output_file [other options] +pos1 +pos2 input_files 对整

文件 file2内容如下:0 qwert1 asdfghjk2 asdjkl2 zxcvbn3 dfghjkll4 222224 tyuiop4 bnm 让第一列相等的合并成一行,不要第一列,也就是变为如下格式:22222;tyuiop;bnmqwertasdfghjkasdjkl;zxcvbndfghjkll 第一种解法 解题思路: awk '{if(a[$1]){a[$1]=a[$1]";"$2}else{a[$1]=$2}}END{for(i in a)print a[i]}'

1.创建文件夹#!/bin/shmkdir -m 777 "%%1" 2.创建文件#!/bin/shtouch "%%1" 3.删除文件#!/bin/shrm -if "%%1" 4.删除文件夹#!/bin/shrm -rf "%%1" 5.删除一个目录下所有的文件夹#!/bin/bashdirec="%%1" #$(pwd)for dir2del in $direc/* ; doif [ -d $dir2

Java中,如何合并两个数组? 示例 本例展示了如何使用List类的List.Addall(array1.asList(array2))方法和Array类的Arrays.toString()方法将两个数组合并成一个数组. package com.yiibai; import java.util.ArrayList; import java.util.Arrays; import java.util.List; public class MergeTwoArrays { public static

创建weblogic的server和cluster ip="10.20.0.2" nwport=8001 wwport=9001 nwlist=[ ('wtdsrwnw','Cluster_dsrwnw',8111), ('wtjscxnw','Cluster_jscxnw',8151), ('wtmhnw','Cluster_mhnw',8801), ('wttyrznw','Cluster_tyrznw',8701), ('wtwsjsnw','Cluster_wsjsnw',85

目录 目录 1 1. 前言 2 2. 概念 2 2.1. Region name 2 3. 约定 2 4. 相关端口 3 5. 下载HBase 3 6. 安装步骤 3 6.1. 修改conf/regionservers 3 6.2. 修改conf/hbase-site.xml 3 6.2.1. hbase.master.info.port 5 6.2.2. hbase.master.info.bindAddress 5 6.3. 修改conf/hbase-env.sh 5 7. 系统设置 6 8

将nios产生的编程文件转换成jic 前言: 基于某种原因,自从开始fpga开发和nios项目开发中,均为正常使用EDS IDE自带的flash programmer 进行成功的下载固化epcs程序.好在通过研究,发现了可以使用命令行直接合成数据.通过jic转换工具,直接生成jic文件,直接使用jtag下载,由此省了不少事. 使用软件:Quartus II 12.0(基于某种原因不再考虑之前的版本,13.1测试也没问题) FPGA:EP4CE10E22C8 开发板:FPGA_VIP_V101 核

目录 目录 1 1. 前言 3 2. 缩略语 3 3. 安装规划 3 3.1. 用户规划 3 3.2. 目录规划 4 4. 相关端口 4 5. 下载安装包 4 6. 修改配置文件 5 6.1. 修改策略 5 6.2. 修改conf/regionservers 5 6.3. 修改conf/hbase-env.sh 5 6.4. 修改conf/log4j.properties 6 6.5. 修改conf/hbase-site.xml 6 6.5.1. hbase.master.info.port 8

Bingduoduo 语音Coding(Beta):项目Github地址 Beta版本新功能介绍 在beta阶段我们很好地将alpha阶段已经设计好的编辑器和shell整合了起来,推出了一个完整的IDE 功能 首先是我们beta阶段最重要也是最具有难度的一项任务:shell和编辑器的整合,因为在合并过程中要解决若干不兼容等问题,最终我们使用一个按钮实现了shell端和编辑器的自由切换功能,从而将其连接在一起.你可以在在编辑器界面随意的创建修改python文件(同样支持语音输入),然后切换到she

webpack 是一个现代 JavaScript 应用程序的静态模块打包器(module bundler).当 webpack 处理应用程序时,它会递归地构建一个依赖关系图(dependency graph),其中包含应用程序需要的每个模块,然后将所有这些模块打包成一个或多个 bundle. 四个概念 entry:入口起点,可以配置多页面. output:出口,项目编译完成后之后文件输出路径. loader:webpack 自身只理解 JavaScript,loader 能够去处理非 JavaS

写在前面: 排序是计算机程序设计中的一种重要操作,它的功能是将一个数据元素的随意序列,又一次排列成一个按keyword有序的序列.因此排序掌握各种排序算法很重要. 对以下介绍的各个排序,我们假定全部排序的keyword都是整数.对传入函数的參数默认是已经检查好了的.仅仅是简单的描写叙述各个算法并给出了详细实现代码.并未做其它深究探讨. 基础知识: 因为待排序的记录数量不同,使得排序过程中设计的存储器不同,可将排序方法分为两大类:一类是内部排序,指的是待排序记录存放在计算机随机存储器中进行的排序过

之前想把代码打印出来看来着,后来合并完之后放在word里发现有2000多页,然后放弃了~anyway,这个命令还是挺有用的. 比如我有文本a001.dat, a002.dat, a003.dat ...,然后想合并成一个文本.直接在shell里敲下面这条(linux系统或者win下安装了cygwin): awk 1 a*.dat > a.dat awk是文本处理工具:1代表true,一直执行下去:*是通配符,代表任意字符.

from RogerZhu modified by King sh logback.rb "/data/logs/" "/tmp/domain" "analysis esb" 相关文件下载地址 https://pan.baidu.com/s/1qY7ggW0  参见 固定脚本无参方式 目录结构如下 /data/script/logback目录下有文件(该目录用于存放需要执行的shell脚本,shell可以以任何后缀结尾,这里定义为.rb是因为ed

格式转换: use awk :awk 'BEGIN{P=1}{if(P==1||P==2){gsub(/^[@]/,">");print}; if(P==4)P=0; P++}' input.fastq > output.fasta FASTA文件拆分: 1. 从a.fasta中提取第10至第20个序列存到b.fasta中 - awk -v RS='>' 'NR>1{i++}i>=10&&i<=20{print ">&

Shell合并两个文件成一个文件的两列 发布时间:2014-07-20   编辑:www.jquerycn.cn Shell合并两个文件成一个文件的两列,提供了两种方法,普通shell脚本,awk脚本.     文件内容如下:more eng.txt chi.txt ::::::::::::::eng.txt::::::::::::::semicoloncommadelimiterspacebarhyphensingle quotedouble quote ::::::::::::::chi.t

目录 sort命令 sort命令的基本用法 uniq命令 join命令 cut命令 paste命令 split命令 tr命令 tar命令 sort命令 sort命令是Linux系统一种排序工具,它将输入文件看作由多条记录组成的数据流,而记录由可变宽度的字段组成,以换行符为定界符.sort命令与awk类似,可将记录分成多个域来处理,默认的域分隔符是空格符,域分隔符也可由用户指定.sort命令的基本格式如下: sort [选项] [输入文件] 常用sort命令选项及其意义如下: 选项 意义 -c 测

> 覆盖写入 >> append模式写入 ###################################################################合并数据库文件:Windows 中实现合并多个文件内容到一个文件中 代码如下     复制代码 copy *.sql MERGE.sql Linux 或 类Unix 下实现合并多个文件内容到一个文件中 代码如下     复制代码 cat b1.sql b2.sql b3.sql > b_all.sql 或者

1,合并+去重+分割 转载:shell 文件合并,去重,分割 - kakaisgood - 博客园 (cnblogs.com) 第一:两个文件的交集,并集前提条件:每个文件中不得有重复行1. 取出两个文件的并集(重复的行只保留一份)2. 取出两个文件的交集(只留下同时存在于两个文件中的文件)3. 删除交集,留下其他的行1. cat file1 file2 | sort | uniq > file32. cat file1 file2 | sort | uniq -d > file33. cat