之间介绍过annovar进行对snp注释,今天介绍snpEFF SnpEff is a variant annotation and effect prediction tool. It annotates and predicts the effects of variants on genes 详细的说明请阅读: http://snpeff.sourceforge.net/SnpEff_manual.html 一.安装 1 wget http://sourceforge.net/projec

nginx中可以将lua嵌,让nginx执行lua脚本,可以处理高并发,非阻塞的处理各种请求,openresty项目中可以使用nignx可以直接构建 srcache_nginx + redis 缓存,而不用通过动态语言来处理(QPS可以轻松的提高了) 看一下openresty中srcache-nginx-module的工作流 好了废话不多说 一.安装 pcre cd /usr/local/src wget -c ftp://ftp.csx.cam.ac.uk/pub/software/progr

MariaDB的安装 构建 MariaDB Galera Cluster之前,首先安装MariaDB,本文使用的版本是10.1 1.环境准备 主机: MariaDB01(192.168.56.102) MariaDB02(192.168.56.103) MariaDB03(192.168.56.104) OS: centos6.5MariaDB版本:10.1 yum源设置Here is your custom MariaDB YUM repository entry for CentOS. Co

第三章.项目分析.搭建目录及模型设计 3.1.前后台项目目录分析 微电影网站 前台模块 后台模块 前台(home) 数据模型:models.py 表单处理:home/forms.py 模板目录:templates/home 后台(admin) 数据模型:models.py 表单处理:admin/forms.py 模板目录:templates/admin 静态文件:static 开始创建目录,如下: 3.2.蓝图构建项目目录 什么是蓝图? 一个应用中或跨用用制作应用组件和支持通用的模式 蓝图的作用

构建mysql 运行centos7容器 docker run --privileged -dti --name=centos-container centos:7 /usr/sbin/init 查询centos7容器 docker ps -a 进入centos7容器 docker exec -it CONTAINER ID /bin/bash 安装mysql数据库 yum install -y mariadb-server 启动数据库 systemctl start mariadb 修改用户状态

docker:Dockerfile构建LNMP平台   1.dockerfile介绍  Dockerfile是Docker用来构建镜像的文本文件,包含自定义的指令和格式.可以通过docker build命令从Dockerfile中构建镜像.这个过程与传统分布式集群的编排配置过程相似,且提供了一系列统一的资源配置语法.用户可以用这些统一的语法命令来根据需求进行配置,通过这份统一的配置文件,在不同的平台上进行分发,需要使用时就可以根据配置文件自动化构建,这解决了开发/运维人员构建镜像的复杂过程.同时

sqler 在社区的响应还是很不错的,已经添加了好多数据库的连接,就在早上项目的包管理还没有写明确, 下午就已经有go mod 构建的支持了,同时也调整下docker 镜像的构建,直接使用git clone + go mod 备注: go mod 是新的包管理方案,需要新版本的golang,使用容器就不存在这个问题了,同时对于国内 还有一个墙的问题,同时我push了1.7tag 的镜像,就是使用go mod 构建的. dockerfile   FROM golang:alpine as buil

参考链接: FTP README 如何下载 NCBI NR NT数据库? 下载blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+ 先了解BLAST Databases:BLAST FTP Site   如何下载NCBI blast数据库? NCBI提供了一个非常智能化的脚本update_blastdb.pl来自动下载所有blast数据库. 脚本使用方法: perl update_blastdb.pl nr 有哪些可供下载的blast

dockerfile文件: FROM centos:centos6  MAINTAINER admin "admin@topsec.com.cn"    RUN yum install -y mysql-server mysql  RUN /etc/init.d/mysqld start &&\      mysql -e "grant all privileges on *.* to 'root'@'%' identified by 'Talent123';

Coursera课程<Using Databases with Python> 密歇根大学 Week4 Many-to-Many Relationships in SQL 15.8 Many-to-Many Relationships 我们之前学的都是One-to-Many的关系,比如说Album与Track的关系.而我们现在要说的是Many-to-Many关系,比如说Books与Authors的关系. 所以我们需要在Books表和Authors的表中间建立一个新表来将它转变成One-to-M

用SparkSQL构建用户画像 二.  前言 大数据时代已经到来,企业迫切希望从已经积累的数据中分析出有价值的东西,而用户行为的分析尤为重要. 利用大数据来分析用户的行为与消费习惯,可以预测商品的发展的趋势,提高产品质量,同时提高用户满意度. 三.  初识用户画像 右边是一个人的基本属性,通过一个人的基本属性我们可以了解到这个人的基本信息,左边上图是通过消费购物信息来描述一个人特征,左边下图是通过交际圈信息来描述一个人特征,通过不同的维度,去描述一个人,认识一个人,了解一个人.这就是我们今天所要

WordPress是使用PHP语言开发的博客平台,用户可以在支持PHP和MySQL数据库的服务器上架设属于自己的网站.也可以把 WordPress当作一个内容管理系统(CMS)来使用. WordPress是一款个人博客系统,并逐步演化成一款内容管理系统软件,它是使用PHP语言和MySQL数据库开发的.用户可以在支持 PHP 和 MySQL数据库的服务器上使用自己的博客. WordPress有许多第三方开发的免费模板,安装方式简单易用.不过要做一个自己的模板,则需要你有一定的专业知识.比如你至少要

一.Cloudera Manager介绍 Cloudera Manager(简称CM)是Cloudera公司开发的一款大数据集群安装部署利器,这款利器具有集群自动化安装.中心化管理.集群监控.报警等功能,使得安装集群从几天的时间缩短在几小时以内,运维人员从数十人降低到几人以内,极大的提高集群管理的效率. 开始之前其实有很多的工作要做,比如配置IP地址.关闭防火墙.配置SSH免密登录等,这些都是比较常规的环境配置,这里不再赘述,不懂者可以参考大数据 -- Hadoop集群环境搭建中部分内容. 附上

一,创建目录二,文件准备三,构建四,使用五,在宿主机上连接docker 中的mysql六,推送镜像到Docker hub 一,创建目录 mkdir -p mysql/5.6 二,文件准备 注意执行脚本的权限,如果没有执行权限,构建的镜像里面也没有执行权限,导致启动失败. my.cnf [mysqld] bind-address=0.0.0.0 # http://www.percona.com/blog/2008/05/31/dns-achilles-heel-mysql-installation

mysql50:192.168.4.50 1.构建MySQL服务器 安装MySQL-server.MySQl-client软件包 修改数据库用户root的密码 确认MySQL服务程序运行.root可控   1.1 卸载残留 ]# systemctl stop mariadb ]# rm -rf /etc/my.cnf ]# rm -rf /var/lib/mysql/* ]# rpm -e --nodeps mariadb-server mariadb  1.2 安装依赖包 ]# yum -y

Coursera课程<Using Databases with Python> 密歇根大学 Week3 Data Models and Relational SQL 15.4 Designing a Data Model 主要介绍了数据模型的重要性,以及数据模型构建的一些思考过程. 15.5 Representing a Data Model in Tables 概念模型 主键(Primary key),指的是一个列或多列的组合,其值能唯一地标识表中的每一行,通过它可强制表的实体完整性.主键主

Coursera课程<Using Databases with Python> 密歇根大学 Week2 Basic Structured Query Language 15.1 Relational Databases Terminology 数据库(Database) - 包含很多个表 关系或表(Relation or Table) - 包含很多元组和属性 元组或行(Tuple or Row) - 一组数据,它们一般代表着一个"实体" 属性或列(Attribute or

一.构建MySQL服务器 目标: 本案例要求熟悉MySQL官方安装包的使用,快速构建一台数据库服务器: 安装MySQL-server.MySQl-client软件包 修改数据库用户root的密码 确认MySQL服务程序运行.root可控 方案: 本课程将使用64位的RHEL 7操作系统,MySQL数据库的版本是5.7.17. 访问http://dev.mysql.com/downloads/mysql/,找到MySQL Community Server下载页面,平台选择“Red Hat Ente

NEO4J亿级数据全文索引构建优化 一.数据量规模(亿级) 二.构建索引的方式 三.构建索引发生的异常 四.全文索引代码优化 1.Java.lang.OutOfMemoryError 2.访问数据库时 3.优化方案 4.优化代码 5.执行效率测试 如果使用基于NEO4J的全文检索作为图谱的主要入口,那么做好图谱搜索引擎的优化是非常关键的. 一.数据量规模(亿级) count(relationships):500584016 count(nodes):765485810 二.构建索引的方式 使用脚

<综合>构建Mysql服务器 构建MySQL服务器 数据库基本管理 MySQL 数据类型 表结构的调整 1 构建MySQL服务器 1.1 问题 本案例要求熟悉MySQL官方安装包的使用,快速构建一台数据库服务器: 安装MySQL-server.MySQl-client软件包 修改数据库用户root的密码 确认MySQL服务程序运行.root可控 1.2 方案 本课程将使用64位的RHEL 7操作系统,MySQL数据库的版本是5.7.17. 访问http://dev.mysql.com/down