gganimate|创建可视化动图,让你的图表会说话
本文首发于“生信补给站”公众号,https://mp.weixin.qq.com/s/kKQ2670FBiDqVCMuLBL9NQ
更多关于R语言,ggplot2绘图,生信分析的内容,敬请关注小号。
介绍一个主要用于绘制动画的ggplot2的扩展包---gganimate包。
Hans Rosling的关于“New Insights on Poverty”的TED演讲绝对是对我影响最大的几个TED之一,原来数据可以这样展示,,,可视化可以这样炫,,,故事可以这样讲...
下面尝试使用 gganimate 包和 gapminder 数据集,实现类似可视化过程。
一 加载R包,数据
#R包安装
install.packages("devtools")
library(devtools)
install_github("thomasp85/gganimate")
install.packages("gapminder")
#加载
library(gganimate)
library(gapminder)
#查看数据
head(gapminder)
# A tibble: 6 x 6
country continent year lifeExp pop gdpPercap
<fct> <fct> <int> <dbl> <int> <dbl>
1 Afghanistan Asia 1952 28.8 8425333 779.
2 Afghanistan Asia 1957 30.3 9240934 821.
3 Afghanistan Asia 1962 32.0 10267083 853.
4 Afghanistan Asia 1967 34.0 11537966 836.
5 Afghanistan Asia 1972 36.1 13079460 740.
6 Afghanistan Asia 1977 38.4 14880372 786.
数据集包括全球主要国家在1952-2007年的人均GDP增长、预期寿命以及人口增长的数据 。
二 ggplot2绘制
使用ggplot2绘制
theme_set(theme_bw())
p <- ggplot(gapminder,
aes(x = gdpPercap, y=lifeExp, size = pop, colour = country)) +
geom_point(show.legend = FALSE, alpha = 0.7) +
scale_color_viridis_d() +
scale_size(range = c(2, 12)) +
scale_x_log10() +
labs(x = "GDP per capita", y = "Life expectancy")
p
三 gganimate 动态
1. transition_time()
核心函数,添加动态
p + transition_time(year) + labs(title = "Year: {frame_time}")
2 按需设置
1)添加小尾巴
p + transition_time(year) +
labs(title = "Year: {frame_time}") +
shadow_wake(wake_length = 0.1, alpha = FALSE)
2)原数据做背景
p + transition_time(year) +
labs(title = "Year: {frame_time}") +
shadow_mark(alpha = 0.3, size = 0.5)
参考资料
https://www.datanovia.com/en/blog/gganimate-how-to-create-plots-with-beautiful-animation-in-r/
TED:https://www.ted.com/talks/hans_rosling_the_best_stats_you_ve_ever_seen?language=zh-TW
◆ ◆ ◆ ◆ ◆
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