fold :

Usage: fold [OPTION]... [FILE]...
Wrap input lines in each FILE (standard input by default), writing to
standard output.

Mandatory arguments to long options are mandatory for short options too.
  -b, --bytes count bytes rather than columns
  -c, --characters count characters rather than columns
  -s, --spaces break at spaces
  -w, --width=WIDTH use WIDTH columns instead of 80
  --help display this help and exit
  --version output version information and exit

example:

[heshuai@login01 data_for_others]$ cat yq |fold -w 50
>q::chr3:171337789-171338789()
GATTCTGCAATTTTCACGAAGTCCATTTAATTGCTCTGTACCTCTGATTC
TTCACAGATAAAAATAGTTTAGTTcacaaagagatgataaatgcttgaag
tgataggtactgcaattgccctgatgtgattgttatacattgtatgactg
tatcaaaacatcgtatgtaccccatgaatatatacacctattctgtacct
ataacaattTCAACAACTGGGTTAGAAAGGATGTAAGAGAAGAGGATGGC
TTCAGAAATGTTTTAGTTATGGTGTTACTGTCTGTTTCAAATGCAAAGGA
TGCTTAGGAGGAATAGCAGCAAACATTTTTGCATGGGGTAAGTCAACTGG
CAAGGAATACAATTATAGACCATATACTGTACTTACCAATAATAACAGTG
TTATCATCAGCAATTAACAACTTGCTGTGGACATAGATAAGCTCAGTTAC
TAGGTTTCCTTCGAGCTCTGCATGTGTTCTAAGACCACAGAATGATATGT
AATTTATCCACTGATTACCAACTGCaaatttaaaaagaaattattaaaat
taatatGACCAAGCTCAATAAACGTACATTAAATCTTATTGTTTCTCAAA
ACATACTACTTAGACTGTTCAGAATAGATTGTATATTATATGTATATGTT
TTCTATTTCAGAATTCATCCAGGATTTATTTTTGATATCTGAATTTCATA
TTGTCAGTCTGAATGGctttctctctctctctctctctctctctatatat
atatatatatatatatatattatatatatTTTTTTTTTAATTGAAGTGTT
TTCTGTCTTCCCTTTGCTAAGGCAATCCAAAAAGCTATTCATATATGAAC
ATTTTATTTTAATGATTTGATGAGTTAACTACTGAAGAGTGATGGTTAAA
ACTGAGCTGGAATAGATTAACCAAGACTTCAGTGTGACATTTGCTTCTAT
CCTGCTTGACACTTGCTGCAGTTTGAATCAGATGCAAGGTGTGTGCCAAA

print the sequence limit the nucleotides to 50 per line.

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