【字符串hash】DNA
DNA
题目描述
小X进行了一项关于DNA序列研究,发现人某条染色体上的一段DNA序列中连续的k个碱基组成的碱基序列与做题的AC率有关!于是他想研究一下这种关系。
现在给出一段DNA序列,请帮他求出这段DNA序列中所有连续k个碱基形成的碱基序列中,出现最多的一种的出现次数。
输入
第二行为一个正整数k,意义与题目描述相同。
输出
样例输入
AAAAA
1
样例输出
5
提示
对于这段DNA序列,连续的1个碱基组成的碱基序列只有A,共出现5次,所以答案为5。
记DNA序列长度为n。
下面给出每组数据的范围和满足性质情况:
【题解】
看清楚题意,是连续k个,然后可以重叠的,直接字符串Hash搞即可.
#include<bits/stdc++.h>
using namespace std;
const int N = 5e6+;
typedef unsigned long long ull;
unordered_map < ull , int > Mp ;
unordered_map < ull , int > Cnt ; ull h[N],p[N],base=;
char str[N];
ull get_hash( int L , int R){
return h[R] - h[L-] * p[ R - L + ];
} ull t[N];
int main()
{
int n,k;
scanf("%s%d",str+,&k);
n = strlen(str+);
p[] = ;
for( int i = ; i <= n ; i++ ){
h[i] = h[i-] * base + str[i] - 'A' + ;
p[i] = p[i-] * base ;
if( i >= k ){
ull tmp = get_hash( i-k+ , i ) ;
Cnt[tmp] ++ ;
}
}
int ans = ;
for( auto x : Cnt ){
ans = max( ans , x.second );
}
printf("%d\n",ans);
return ;
}
/*
AAAAACCCCCGGGGGGGGTTTTTTTTTTTTTT
1
14 */
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