Fixation index
:或者1、简单介绍
固定指数(FST)是一种由遗传结构决定的种群分化指标。它通常是由遗传多态性数据,如单核苷酸多态性(SNP)或微卫星估计。作为莱特f统计的一个特例,它是种群遗传学中最常用的统计方法之一。
2、Definition
两个最常用的FST定义是基于群体间等位基因频率的方差,以及由血统决定身份的概率。
或者
p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total population
p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total population
-p或者Π: is the average frequency of an allele in the total population
或者:variance in allele frequency among populations(the variance in the frequency of the allele between different subpopulations, weighted by the sizes of the subpopulations)
或者Π(1-Π):the variance of the allelic state in the total population,
这种群体内部和群体之间遗传变异的比较常用于应用群体遗传学。取值范围从0到1。零值意味着完全的随机交配;也就是说,这两个种群可以自由交配。1的值意味着所有的遗传变异都由种群结构来解释,两个种群不具有任何遗传多样性。
p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total population p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total population
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