:或者1、简单介绍

固定指数(FST)是一种由遗传结构决定的种群分化指标。它通常是由遗传多态性数据,如单核苷酸多态性(SNP)或微卫星估计。作为莱特f统计的一个特例,它是种群遗传学中最常用的统计方法之一。

2、Definition

两个最常用的FST定义是基于群体间等位基因频率的方差,以及由血统决定身份的概率。

或者

p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total population

p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total population

-p或者Π: is the average frequency of an allele in the total population

或者:variance in allele frequency among  populations(the variance in the frequency of the allele between different subpopulations, weighted by the sizes of the subpopulations)

或者Π(1-Π):the variance of the allelic state in the total population,

这种群体内部和群体之间遗传变异的比较常用于应用群体遗传学。取值范围从0到1。零值意味着完全的随机交配;也就是说,这两个种群可以自由交配。1的值意味着所有的遗传变异都由种群结构来解释,两个种群不具有任何遗传多样性。

p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total population p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total population

Fixation index的更多相关文章

  1. 使用vcftools或者gcta计算群体间固定指数(Fixation index,FST)

    下列所用到的数据均为千人基因组数据库 1.通过vcftools计算FST 命令行如下: ./vcftools --vcf input_data.vcf --weir-fst-pop populatio ...

  2. Fst指数说明

    群体遗传学--Fst指数,即群体间分化指数,用于群体间分化分析. 群体遗传学中衡量群体间分化程度的指标有很多种,最常用的就是Fst指数.Fst指数,由F统计量演变而来.F统计量(FIS,FIT,FST ...

  3. Pooled genome sequence strategies |representative genome assembly approaches|Domestication|GERP|selective sweep|Hybridization|Introgression|iHS|SNP genotyping arrays|haplotype

    Design based on biology 通过比较基因组学的方法,将脊椎动物基因组的数据,解决生物学各方面问题.新的调控注释(在脊椎动物的进化过程中的出现的)可以丰富物种树(比如不同功能蛋白质进 ...

  4. 【转】Fst指数

    [转]Fst指数 转载自 http://blog.csdn.net/zhu_si_tao/article/details/71513099 与 http://blog.sina.com.cn/s/bl ...

  5. 漏洞:会话固定攻击(session fixation attack)

    什么是会话固定攻击? 会话固定攻击(session fixation attack)是利用应用系统在服务器的会话ID固定不变机制,借助他人用相同的会话ID获取认证和授权,然后利用该会话ID劫持他人的会 ...

  6. MySQL 优化之 ICP (index condition pushdown:索引条件下推)

    ICP技术是在MySQL5.6中引入的一种索引优化技术.它能减少在使用 二级索引 过滤where条件时的回表次数 和 减少MySQL server层和引擎层的交互次数.在索引组织表中,使用二级索引进行 ...

  7. 在v-for中利用index来对第一项添加class(vue2.0)

    <li v-for="(el,index) in event" v-bind:class="{ 'm-swipe-active': !index}"> ...

  8. Ubuntu-server 下Apache2 配置.htaccess 隐藏thinkPHP项目index.php

    需要开启Apache2的rewrite模块 1.打开/etc/apache2/apache2.conf 将文件中的AllowOverride None改为AllowOverride All 2.修改m ...

  9. SQL Server-聚焦强制索引查询条件和Columnstore Index(九)

    前言 本节我们再来穿插讲讲索引知识,后续再讲数据类型中的日期类型,简短的内容,深入的理解,Always to review the basics. 强制索引查询条件 前面我们也讲了一点强制索引查询的知 ...

随机推荐

  1. tornado-模版reverse_url

    from tornado.web import url handler=[ url(r"/hello", grab_handler.HelloHandler, name='hell ...

  2. CopyOnWriteList-JDK1.8

    CopyOnWrite,一个写时复制的技术来保证并发操作的安全,使用这种技术的前提是读大于写. 读读之间相容, 写写之间互斥, 读写操作相容. 实现方法: 在对底层数据进行写的时候,把底层数据复制一份 ...

  3. 3.div+css 的布局较 table 布局有什么优点

    改版的时候更方便,只需改css文件. 页面加载速度更快.结构化清晰.页面显示简介. 表现与结构相分离. 已于优化搜索引擎更友好,排名更容易靠前.

  4. CentOS修改locale解决调用API乱码问题

    查看所有的locale语言 locale 查看当前操作系统使用的语言 echo $LANG 永久设置系统locale语言 vi /etc/profile LANG="zh_CN.UTF-8& ...

  5. hadoop/hdfs/yarn 详细命令搬运

    转载自文章 http://www.cnblogs.com/davidwang456/p/5074108.html 安装完hadoop后,在hadoop的bin目录下有一系列命令: container- ...

  6. 浅谈如何避免内存泄漏(out of memory)

    1.在涉及使用Context时,对于生命周期比Activity长的对象应该使用Application的Context.凡是使用Context优先考虑Application的Context,当然它并不是 ...

  7. APP-8.1-百度语音应用

    1.百度语音登录地址 http://yuyin.baidu.com/ 2.控制台创建应用 3.生成签名 3.1Postman软件应用 APP-8.2-Postman应用 3.2Postman执行 UR ...

  8. 函数参数,const 引用 和 非 const引用是不同的函数。

    举个例子, void f(const int &x) 和 void f(int &x) 是不同的函数. 函数的返回值不能作为区分

  9. iOS开发 2x 3x图

    众所周知,iOS开发中的图片资源一般需要2倍图和3倍图,也就是2x,3x,但是最近思考了一个问题,为什么不能只提供3x的图片,2x的图片让系统从3x压缩就好了,于是上网搜索了下,得到了答案. 当我们在 ...

  10. 一种去中心化的manager设计思路

    通常,我们设计游戏引擎时,或者管理器时,都会由管理器产出各种产品,一旦有新产品要加,就要修改管理器,来增加相应的生成代码. 这从设计上来看有两个问题: 1,管理器参数需要有个类型,在管理器中用if e ...