:或者1、简单介绍

固定指数(FST)是一种由遗传结构决定的种群分化指标。它通常是由遗传多态性数据,如单核苷酸多态性(SNP)或微卫星估计。作为莱特f统计的一个特例,它是种群遗传学中最常用的统计方法之一。

2、Definition

两个最常用的FST定义是基于群体间等位基因频率的方差,以及由血统决定身份的概率。

或者

p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total population

p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total population

-p或者Π: is the average frequency of an allele in the total population

或者:variance in allele frequency among  populations(the variance in the frequency of the allele between different subpopulations, weighted by the sizes of the subpopulations)

或者Π(1-Π):the variance of the allelic state in the total population,

这种群体内部和群体之间遗传变异的比较常用于应用群体遗传学。取值范围从0到1。零值意味着完全的随机交配;也就是说,这两个种群可以自由交配。1的值意味着所有的遗传变异都由种群结构来解释,两个种群不具有任何遗传多样性。

p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total population p ¯ {\displaystyle {\bar {p}}} is the average frequency of an allele in the total population

Fixation index的更多相关文章

  1. 使用vcftools或者gcta计算群体间固定指数(Fixation index,FST)

    下列所用到的数据均为千人基因组数据库 1.通过vcftools计算FST 命令行如下: ./vcftools --vcf input_data.vcf --weir-fst-pop populatio ...

  2. Fst指数说明

    群体遗传学--Fst指数,即群体间分化指数,用于群体间分化分析. 群体遗传学中衡量群体间分化程度的指标有很多种,最常用的就是Fst指数.Fst指数,由F统计量演变而来.F统计量(FIS,FIT,FST ...

  3. Pooled genome sequence strategies |representative genome assembly approaches|Domestication|GERP|selective sweep|Hybridization|Introgression|iHS|SNP genotyping arrays|haplotype

    Design based on biology 通过比较基因组学的方法,将脊椎动物基因组的数据,解决生物学各方面问题.新的调控注释(在脊椎动物的进化过程中的出现的)可以丰富物种树(比如不同功能蛋白质进 ...

  4. 【转】Fst指数

    [转]Fst指数 转载自 http://blog.csdn.net/zhu_si_tao/article/details/71513099 与 http://blog.sina.com.cn/s/bl ...

  5. 漏洞:会话固定攻击(session fixation attack)

    什么是会话固定攻击? 会话固定攻击(session fixation attack)是利用应用系统在服务器的会话ID固定不变机制,借助他人用相同的会话ID获取认证和授权,然后利用该会话ID劫持他人的会 ...

  6. MySQL 优化之 ICP (index condition pushdown:索引条件下推)

    ICP技术是在MySQL5.6中引入的一种索引优化技术.它能减少在使用 二级索引 过滤where条件时的回表次数 和 减少MySQL server层和引擎层的交互次数.在索引组织表中,使用二级索引进行 ...

  7. 在v-for中利用index来对第一项添加class(vue2.0)

    <li v-for="(el,index) in event" v-bind:class="{ 'm-swipe-active': !index}"> ...

  8. Ubuntu-server 下Apache2 配置.htaccess 隐藏thinkPHP项目index.php

    需要开启Apache2的rewrite模块 1.打开/etc/apache2/apache2.conf 将文件中的AllowOverride None改为AllowOverride All 2.修改m ...

  9. SQL Server-聚焦强制索引查询条件和Columnstore Index(九)

    前言 本节我们再来穿插讲讲索引知识,后续再讲数据类型中的日期类型,简短的内容,深入的理解,Always to review the basics. 强制索引查询条件 前面我们也讲了一点强制索引查询的知 ...

随机推荐

  1. StanFord ML 笔记 第四部分

    第四部分: 1.生成学习法 generate learning algorithm 2.高斯判别分析 Gaussian Discriminant Analysis 3.朴素贝叶斯 Navie Baye ...

  2. iOS获取当前路由信息

    导入头文件: #import <SystemConfiguration/CaptiveNetwork.h> - (void)currentWifiSSID {    // Does not ...

  3. python3基础:基本语句(2017)

    http://www.cnblogs.com/qq21270/p/4591318.html  字符串.文本文件 http://www.cnblogs.com/qq21270/p/7872824.htm ...

  4. IP与十进制相互转化

    def ip2Long(ip: String): Long = { val fragments = ip.split("[.]")  var ipNum = 0L  for (i ...

  5. 42. oracle通过两张表的一个字段对应,update其中一张表的某个字段

    update A a set a.A2 = (select b.B2 from B b where b.B1=a.A1) where exists (select 1 from B where B.B ...

  6. 白鹭引擎 - 遮罩( Rectangle )

    1: 矩形遮罩 class Main extends egret.DisplayObjectContainer { /** * Main 类构造器, 初始化的时候自动执行, ( 子类的构造函数必须调用 ...

  7. __file__ 作用以及模块导入方法

    python 执行py 文件的时候,默认就会把当前目录增加到sys.path中 import os print(__file__) #打印文件当前的位置 直接在目录里面执行,结果显示当前文件(pych ...

  8. 交叉编译zookeeper的C库

    原创文章,转载请正确注明本文原始URL及作者. 今天要编译一个zookeeper的C接口,要编译一个TK1版本. 事情经过这这样的:原来用的是zookeeper-3.4.6版本,但是源码中有个函数是汇 ...

  9. 前后台交互实现点击超链接通过指定的 url 去网络或者文件服务器下载文件

    前台 VUE 界面: <el-table-column prop="attachment" align="center" label="附件详情 ...

  10. Windows 端口占用解决