在.slurm文件中激活Anaconda环境
超算中心使用slurm作为集群调度。原始slurm脚本如下:
source activate tensorflow-gpu
python neural_style.py --content content/nju-.jpg --styles style/.jpg --output result-v100/result-nju-.jpg
srun -p gpu -w g0051提交任务后报错:
很明显,第一句激活anaconda环境失败了,提示找不到conda activate可执行程序。
Google了一下,发现了这个:
https://github.com/conda/conda/issues/5071
看了一下,大概心里有数了,直接将slurm脚本改为:
source /home/xieweibo/project/software/anaconda3/bin/activate tensorflow-gpu
python neural_style.py --content content/nju-.jpg --styles style/.jpg --output result-v100/result-nju-.jpg
也就是将conda activate可执行程序作为绝对路径在任务脚本中索引即可。
任务成功提交至调度系统:
tz@croplab, hzau
2019-11-23
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