bwlabel函数的c++实现
实验中需要用到区域联通的算法,就是类似于matlab中bwlabel的函数。网上找了找c++源码未果,bwlabel-python版用python描述了matlab中的实现方法,但是最后对标签的处理部分并未看明白,故自己用c++实现了一个。先直接看bwlabel函数代码:
cv::Mat bwlabel(const cv::Mat in, int * num, const int mode)
{
const int num_runs = number_of_runs(in);
int * sc = new int[num_runs];
int * ec = new int[num_runs];
int * r = new int[num_runs];
int * labels = new int[num_runs];
memset(labels, 0, sizeof(int)*num_runs);
fill_run_vectors(in, sc, ec, r);
first_pass(sc, ec, r, labels, num_runs, mode);
cv::Mat result = cv::Mat::zeros(in.size(), CV_8UC1); int number = 0;
for(int i = 0; i < num_runs; i++)
{
uchar * p_row = result.ptr<uchar>(r[i]);
for(int j = sc[i]; j <= ec[i]; j++)
p_row[j] = labels[i];
if(number < labels[i])
number = labels[i];
}
if(num != NULL)
*num = number;
delete [] sc;
delete [] ec;
delete [] r;
delete [] labels;
return result;
}
bwlabel中要用到三个辅助函数:number_of_runs,fill_run_vectors,first_pass。函数number_of_runs计算每一行中非零像素团的个数并累加起来。
1 1 0 0 0 1 1 1 0 0
比如,上面这一行就有2个非零像素团,我们称这样的像素团为Run,函数number_of_runs实现如下:
int number_of_runs(const cv::Mat in)
{
const int rows = in.rows;
const int cols = in.cols;
int result = 0;
for(int row = 0; row < rows; row++)
{
const uchar * p_row = in.ptr<uchar>(row);
if(p_row[0] != 0)
result++;
for(int col = 1; col < cols; col++)
{
if(p_row[col] != 0 && p_row[col-1] == 0)
result++;
}
}
return result;
}
这个函数算法思想是,扫描每一行,对每一行,如果当前元素非零并且前一元素为零则Run的个数加一。
函数fill_run_vectors的作用是填充三个数据结构:sc[],ec[],r[],它们分别表示开始列标、结束列标和行标,数组长度为由number_of_runs函数得到的Run的个数。函数fill_run_vectors实现如下:
void fill_run_vectors(const cv::Mat in, int sc[], int ec[], int r[])
{
const int rows = in.rows;
const int cols = in.cols;
int idx = 0;
for(int row = 0; row < rows; row++)
{
const uchar * p_row = in.ptr<uchar>(row);
int prev = 0;
for(int col = 0; col < cols; col++)
{
if(p_row[col] != prev)
{
if(prev == 0)
{
sc[idx] = col;
r[idx] = row;
prev = 1;
}
else
{
ec[idx++] = col - 1;
prev = 0;
}
}
if(col == cols-1 && prev == 1)
{
ec[idx++] = col;
}
}
}
}
算法思想还是遍历每一行,用变量prev保存一行中上一个团是0还是1,如果出现01跳变那么就要记录下新的Run的开始列标和行标,如果出现10跳变(或者这行结束并且prev=1)那么就记录下这个Run的结束列标。
函数first_pass顾名思义,字面上说第一次扫描。因为函数扫描每一个Run块,给它打标签。当出现如下情况时:
1 1 0 0 1 1 1 0
0 1 1 1 1 0 0 0
函数给第一行第一个Run打上标签1,第二个Run打上标签2,当遍历到第二行时,发现这一行的一个Run与第一行第一个Run相邻,故打上标签1,但当继续遍历时发现这个Run也与第一行第二个Run相邻,但函数并没有改变第一行第二个Run的标签,而是记录下这两个标签其实该一样。遍历完第二行结果为:
1 1 0 0 2 2 2 0
0 1 1 1 1 0 0 0
遍历完每一个Run过后就是处理刚才未处理的标签了。函数first_pass实现如下:
void first_pass(const int sc[], const int ec[], const int r[],int labels[], const int num_runs, const int mode)
{
int cur_row = 0;
int next_label = 1;
int first_run_on_prev_row = -1;
int last_run_on_prev_row = -1;
int first_run_on_this_row = 0;
int offset = 0;
int * equal_i = new int[num_runs];
int * equal_j = new int[num_runs];
int equal_idx = 0;
if(mode == 8)
offset = 1;
for(int k = 0; k < num_runs; k++)
{
if(r[k] == cur_row + 1)
{
cur_row += 1;
first_run_on_prev_row = first_run_on_this_row;
first_run_on_this_row = k;
last_run_on_prev_row = k - 1;
}
else if(r[k] > cur_row + 1)
{
first_run_on_prev_row = -1;
last_run_on_prev_row = -1;
first_run_on_this_row = k;
cur_row = r[k];
}
if(first_run_on_prev_row >= 0)
{
int p = first_run_on_prev_row;
while(p <= last_run_on_prev_row && sc[p] <= (ec[k] + offset))
{
if(sc[k] <= ec[p] + offset)
{
if(labels[k] == 0)
labels[k] = labels[p];
else if(labels[k] != labels[p])
{
//labels[p] = labels[k];
equal_i[equal_idx] = labels[k];
equal_j[equal_idx] = labels[p];
equal_idx += 1;
}
}
p += 1;
}
}
if(labels[k] == 0)
{
labels[k] = next_label++;
}
}
/////////////////////// process labels
for(int i = 0; i < equal_idx; i++)
{
int max_label = equal_i[i] > equal_j[i] ? equal_i[i] : equal_j[i];
int min_label = equal_i[i] < equal_j[i] ? equal_i[i] : equal_j[i];
for(int j = 0; j < num_runs; j++)
{
if(labels[j] == max_label)
labels[j] = min_label;
}
}
delete [] equal_i;
delete [] equal_j;
/////////////////////process ignore labels
int * hist = new int[next_label];
int * non_labels = new int[next_label];
memset(hist, 0, sizeof(int)*next_label);
int non_num = 0;
for(int i = 0; i < num_runs; i++)
{
hist[labels[i]]++;
}
for(int i = 1; i < next_label; i++)
{
if(hist[i] == 0)
non_labels[non_num++] = i;
}
for(int j = 0; j < num_runs; j++)
{
int k = labels[j];
for(int i = non_num-1; i >= 0; i--)
{
if(k > non_labels[i])
{
labels[j] -= (i+1);
break;
}
}
}
delete [] hist;
delete [] non_labels;
}
前面遍历每一个Run分两种情况,上一行有Run和上一行无Run:当上一行无Run时就分配一个新的标签,当上一行有Run时还要考虑是否与上一行Run相邻,若相邻则打上上一行的标签,当出现上面讲到的情况时就保存这两个标签到数组equal_i,equal_j中。
接下来就是处理equal_i和equal_j这两个数组了,要将它们当中相同族的不同标签合并到一起(注释process labels下面代码)。
这样过后还不能完事,有可能出现标签间断的现象(如1,2,4,6),就是还必须把标签(如1,2,4,6)映射到一个连续的空间(1,2,3,4)。参见注释process ignore labels以下代码。
这样过后就差不多了,最后一步是在bwlabel中给返回的Mat中元素打上对应的标签。
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