转载:http://www.cnblogs.com/xudongliang/p/6497465.html

嵌合体序列:由来自两条或者多条模板链的序列组成,示意图如下:

在PCR反应中,在延伸阶段,由于不完全延伸,就会导致嵌合体序列的出现,以上图为例,

在扩增序列X的过程中,在序列延伸阶段,只产生了部分X序列延伸阶段就结束了,在下一轮的PCR反应中,这部分序列作为其相似序列Y的引物接着延伸,扩增就会形成X和Y的嵌合体序列;

在放一张具体一点的示意图,不完全延伸产生的序列作为下一轮PCR反应的产物,进行延伸

在PCR过程中,大概有1%的几率会出现嵌合体序列,所以在16S 扩增子测序的分析中,需要去除嵌合体序列

参考文章:http://drive5.com/usearch/manual/chimera_formation.html

24、嵌合体序列Chimeras的更多相关文章

  1. 扩增子分析解读4去嵌合体 非细菌序列 生成代表性序列和OTU表

    本节课程,需要先完成 扩增子分析解读1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类   先看一下扩增子分析的整体流程,从下向上逐层分析 分 ...

  2. 利用USearch去除嵌合体(chimeras)

    嵌合体序列指在pcr过程中,两条不同的序列产生杂交扩增的序列,属于人工污染,在ITS和16S分析中,应该首先去除,USearch提供去除嵌合体的功能 usearch -uchime_ref reads ...

  3. 剑指 Offer 题目汇总索引

    剑指 Offer 总目录:(共50道大题) 1. 赋值运算符函数(或应说复制拷贝函数问题) 2. 实现 Singleton 模式 (C#) 3.二维数组中的查找 4.替换空格              ...

  4. Chap4: question: 19 - 28

    19. 二叉树的镜像(递归) 即:交换所有节点的左右子树.从下往上 或 从上往下 都可以. #include <iostream> #include <string> usin ...

  5. Python内置函数详解——总结篇

    2个多月来,将3.5版本中的68个内置函数,按顺序逐个进行了自认为详细的解析,现在是时候进行个总结了.为了方便记忆,将这些内置函数进行了如下分类:     数学运算(7个)     类型转换(24个) ...

  6. SAMTOOLS使用 SAM BAM文件处理

    [怪毛匠子 整理] samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 #第一步:把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件 system"samtools view -bS m ...

  7. OTU(operational taxonomic units),即操作分类单元

    转自http://www.dxy.cn/bbs/topic/35655953 1.OTU是什么? OTU(operational taxonomic units),即操作分类单元.通过一定的距离度量方 ...

  8. Iso-seq 必备基础

    Iso-seq , 全称叫做 Isoform-sequencing, 是 Pacbio 公司对自己开发的转录本测序技术的规范化命名:是利用三代测序长读长的特点,不打断转录本,直接测序,从而得到全长转录 ...

  9. 5.python内置函数详解

    内置函数 声明,转载至这位大哥,感谢之至 http://blog.csdn.net/oaa608868/article/details/53506188 关于分类 数学运算(7个) 类型转换(24个) ...

随机推荐

  1. CKeditor插件开发流程(二)SyntaxHighlighter

    CKEditor整合SyntaxHighlighter实现代码高亮显示 1,版本说明 CKEditor:ckeditor_4.0.1_standard.zipSyntaxHighlighter:syn ...

  2. [原创]java WEB学习笔记16:JSP指令(page,include),JSP标签(forwar,include,param)

    本博客为原创:综合 尚硅谷(http://www.atguigu.com)的系统教程(深表感谢)和 网络上的现有资源(博客,文档,图书等),资源的出处我会标明 本博客的目的:①总结自己的学习过程,相当 ...

  3. python实现并绘制 sigmoid函数,tanh函数,ReLU函数,PReLU函数

    Python绘制正余弦函数图像 # -*- coding:utf-8 -*- from matplotlib import pyplot as plt import numpy as np impor ...

  4. Ubuntu15.10下***搭建及GUI客户端安装

    1.依赖包安装 sudo apt-get install python-pip python-dev build-essential sudo pip install pip sudo apt-get ...

  5. MySQL5.7.9(GA)的安装

    1.解压ZIP文件到安装目录: 2.进入到bin目录,试运行mysqld --console,查看可能的出错信息,安装相应的辅助软件,如.net V4.0等: 3.编辑my.ini文件,关键内容如下: ...

  6. mysql 的类型转换函数cast的用法

    CAST(expr   AS   type),   CONVERT(expr,type)   ,   CONVERT(expr   USING   transcoding_name) CAST()   ...

  7. Array对象(一)

    Array是JavaScript中的一个事先定义好的对象(也可以称作一个类),可以直接使用. 创建Array对象: var array = new Array(); 创建指定元素个数的Array对象: ...

  8. Java企业微信开发_13_异常:com.qq.weixin.mp.aes.AesException: 解密后得到的buffer非法

    一.异常信息 方法:POST@ echostr是否存在 :false java.lang.IllegalArgumentException: 20 > -367029533 at java.ut ...

  9. codeforces 515C C. Drazil and Factorial(水题,贪心)

    题目链接: C. Drazil and Factorial time limit per test 2 seconds memory limit per test 256 megabytes inpu ...

  10. STL defalloc.h

    defalloc.h . // Filename: defalloc.h . . // Comment By: 凝霜 . // E-mail: mdl2009@vip.qq.com . // Blog ...