HUPO|PSI|PeptideAtlas|TPP|Partial submission|Complete submission|proteomeXchange
蛋白质组实验数据提交
需要共享数据,共享要求:
质谱实验数据
HUPO Proteomics Standards Initiative (http://www.psidev.info/overview)
PSI-MS标准词汇文件结构
蛋白质组实验数据库:
PeptideAtlas具有独有的软件包TPP得到靶向质谱数据,Partial submission是上传原始和结果文件。Complete submission是上传原始数据与结果文件的关联信息、原始数据和结果文件,原始数据可以看出仪器和实验人员的水平。
proteomeXchange每次提交数据集会有统一编号图:
国内:
Iprox上传流程:
上传数据后可以选择公开,或者延迟公开,即延迟公开可在之后不断申请保密数据,或者保持私有,即仅供reviewer和合作者查看。
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