LDA(线性判别分析,Python实现)
源代码:
- #-*- coding: UTF-8 -*-
- from numpy import *
- import numpy
- def lda(c1,c2):
- #c1 第一类样本,每行是一个样本
- #c2 第二类样本,每行是一个样本
- #计算各类样本的均值和所有样本均值
- m1=mean(c1,axis=0)#第一类样本均值
- m2=mean(c2,axis=0)#第二类样本均值
- c=vstack((c1,c2))#所有样本
- m=mean(c,axis=0)#所有样本的均值
- #计算类内离散度矩阵Sw
- n1=c1.shape[0]#第一类样本数
- print(n1);
- n2=c2.shape[0]#第二类样本数
- #求第一类样本的散列矩阵s1
- s1=0
- for i in range(0,n1):
- s1=s1+(c1[i,:]-m1).T*(c1[i,:]-m1)
- #求第二类样本的散列矩阵s2
- s2=0
- for i in range(0,n2):
- s2=s2+(c2[i,:]-m2).T*(c2[i,:]-m2)
- Sw=(n1*s1+n2*s2)/(n1+n2)
- #计算类间离散度矩阵Sb
- Sb=(n1*(m-m1).T*(m-m1)+n2*(m-m2).T*(m-m2))/(n1+n2)
- #求最大特征值对应的特征向量
- eigvalue,eigvector=linalg.eig(mat(Sw).I*Sb)#特征值和特征向量
- indexVec=numpy.argsort(-eigvalue)#对eigvalue从大到小排序,返回索引
- nLargestIndex=indexVec[:1] #取出最大的特征值的索引
- W=eigvector[:,nLargestIndex] #取出最大的特征值对应的特征向量
- return W
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