用Cython加速Python代码
安装Cython
pip install Cython
如何使用
要在我们的笔记本中使用Cython,我们将使用IPython magic命令。Magic命令以百分号开始,并提供一些额外的功能,这些功能可以增强工作流。通常,有两种类型的Magic命令:
行magic由单个“%”表示,并且只在一行输入进行操作
单元格magic由两个“%”表示,并在多行输入上操作。
让我们开始:
首先,为了能够使用Cython,我们必须运行:
%load_ext Cython
现在,每当我们想在代码单元中运行Cython时,我们必须首先将以下magic命令放入单元格:
%%cython
完成这些之后,就可以开始编写Cython代码了。
Cython可以跑多快
与普通Python代码相比,Cython的速度快多少实际上取决于代码本身。例如,如果您正在运行具有许多变量的计算开销较大的循环,Cython将大大优于常规Python代码。递归函数也会使Cython比Python快很多。
让我们用斐波那契数列来证明这一点。简单地说,这个算法通过把前两个数相加找到下一个数。下面是Python中可能出现的情况:
%%cython
def fibonacci(n):
if n<0:
print("1st fibonacci number= 0")
elif n==1:
return 0
elif n==2:
return 1
else:
return fibonacci(n-1) + fibonacci(n-2)
运行代码:
%%time
fibonacci(39)
结果:
CPU times: user 8.39 s, sys: 78.6 ms, total: 8.47 s
Wall time: 8.43 s
39088169
正如所见,找到序列的第39个数字花费了8.39秒,这里Wall time是指从函数调用开始到结束所花费的总时间。
接下来在magic命令行后面添加-a有何不同:
%%cython -a
def fibonacci_c(int n):
if n<0:
print("1st fibonacci number = 0")
elif n==1:
return 0
elif n==2:
return 1
else:
return fibonacci_c(n-1)+fibonacci_c(n-2)
运行结果如下:
正如您所看到的,通过在magic命令后面添加’ -a ‘,我们收到了一些注释,这些注释向我们展示了代码中有多少Python交互。
这里的目标是去掉所有的黄线,让它们有一个白色的背景。在这种情况下,将不存在Python交互,所有代码都将在C中运行。
您还可以单击每行旁边的“+”符号,查看Python代码的C转换。
运行代码看下能有多快:
%%time
fibonacci_c(39)
运行结果如下:
CPU times: user 4.85 s, sys: 49.7 ms, total: 4.9 s
Wall time: 4.89 s
39088169
本例中,Cython的速度大约是Python的5.8倍。这清楚地展示了利用Cython节省时间的能力,与常规Python代码相比,Cython提供了最大的改进。
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