GTX.Zip:一款可以替代 gzip 的基因大数据压缩软件
今天给大家推荐一款基因大数据压缩的大杀器:GTX.Zip。
GTX.Zip 这款软件是由曾在 2016 年 GCTA 风云挑战赛中的那匹黑马——人和未来生物科技有限公司开发的,而当时他们也是打破了基因数据压缩的世界纪录!
根据该软件的官方团队介绍,GTX.Zip 能够支持 FASTQ、fastq.gz、bam 等数据的压缩,也可以支持普通的,像 binary 等其他所有的格式数据压缩,类似于 rar、gzip,也是一款完全可以替代 gzip 的全新软件。从其官方提供的测试结果,GTX.Zip 能将 FASTQ 文件压缩最低至原大小的 2%,也可以直接重压缩常见的 fastq.gz 至原大小的 1/3~1/7。
除了在压缩率上傲视群雄外,GTX.Zip 还在检验压缩产品的金标准——数据安全性这方面表现完美。
为什么这么说呢,据开发人员介绍,GTX.Zip 在压缩过程中,所有压缩数据都必须经过动态解压还原,确保与原始数据完全一致后,才会输出压缩数据流。因此,其能真正保证压缩数据的 100% 安全还原。(如果发生还原数据不一致的情况,GTX.Zip 会选择拒绝压缩该文件,而决不让管理员发生误判。)
带着好奇心,今晚在在荔枝微课《GTX 压缩技术秀》中进一步了解了这一软件,感觉还是充满惊喜,非常值得期待的。附上一些该课程的截图,感兴趣的童鞋可以去荔枝微课中搜索,里面也有 GTX.Zip 团队对大家关注问题的解答。
最后,把 GTZ 的一些使用体验链接分享给大家:
GTZ GitHub:github.com/genetalks/gtz
GTZ 测试接口:www.gtz.io
同时 GTX.zip 开放式体验平台也提供了基于 CentOS 和 Ubuntu 版本的 GTX.zip 解压缩工具下载地址,有兴趣可以去下载来体验。
GTX.Zip 解压工具下载:
http://gtz.io/gtz_public_0.2.2k_centos_release.tgz
http://gtz.io/gtz_public_0.2.2k_ubuntu_release.tgz
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