[E::hts_idx_push] NO_COOR reads not in a single block at the end 10 -1
在分析转录组数据时，用bowtie2比对生成的bam文件，下一步call peak使用m6Aviewer，需要bam文件的index文件。所以我直接敲命令
samtools index xx.bam
[E::hts_idx_push] NO_COOR reads not in a single block at the end -
报上面的错误。后来发现，samtools建索引时，bam或sam文件必须是排序好了的，而且必须使用samtools的默认排序方法，即坐标顺序排序。
time nohup samtools sort -@ .m6A.bam -o .m6A.sort.bam &
然后在进行index
[E::hts_idx_push] NO_COOR reads not in a single block at the end 10 -1的更多相关文章
- C语言的AES加密
C语言的AES加密 稍微封装了几个函数 方便使用 #if 1 #include <stdio.h> #include <stdlib.h> #include <strin ...
- POJ1742Coins(并不理解是什么意思）
Coins Time Limit: 3000MS Memory Limit: 30000K Total Submissions: 32309 Accepted: 10986 Descripti ...
- Oracle Tuning 基础概述01 - Oracle 常见等待事件
对Oracle数据库整体性能的优化,首先要关注的是在有性能问题时数据库排名前几位等待事件是哪些.Oracle等待事件众多,随着版本的升级,数量还在不断增加,可以通过v$event_name查到当前数据 ...
- Coins
Description Whuacmers use coins.They have coins of value A1,A2,A3...An Silverland dollar. One day Hi ...
- POJ1742 Coins[多重背包可行性]
Coins Time Limit: 3000MS Memory Limit: 30000K Total Submissions: 34814 Accepted: 11828 Descripti ...
- HDU-2844 Coins(多重背包)
Problem Description Whuacmers use coins.They have coins of value A1,A2,A3...An Silverland dollar. On ...
- hdu 2844 多重背包coins
http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=2844 题意: 有n个硬币,知道其价值A1.....An.数量C1...Cn.问在1到m价值之间,最多能组成多少种 ...
- The Secrets of Oracle Row Chaining and Migration
from http://www.akadia.com/services/ora_chained_rows.html Overview If you notice poor performance in ...
- poj 1430 Binary Stirling Numbers
Binary Stirling Numbers Time Limit: 1000MS Memory Limit: 10000K Total Submissions: 1761 Accepted ...
随机推荐
- C#.Net与MATLAB集成
在数学分析工具方面,MATLAB无疑是佼佼者,除了作为软件工具外,MATLAB的自定义编程语言以及混合编程的支持,使其可以与Python.R之类数学分析语言媲美.尤其是在一些传统领域的研究,由于其研究 ...
- 第三方登录，一般都是遵循OAuth2.0协议。
1. QQ登录OAuth2.0协议开发流程 1.1 开发流程 申请接入,获取appid和appkey; 开发应用,设置协作者账号,上线之前只有协作者才能进行第三方登录 放置QQ登录按钮(这个自己可以用 ...
- 原生Js实现拖拽（适用于pc和移动端）
效果: HTML和CSS部分 <!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset= ...
- 解决zabbix中文显示乱码问题
中文显示问题,图表乱码 解决办法: [root@zabbix ~]# cd /usr/share/zabbix/include/ [root@zabbix include]# vim locales. ...
- C++反汇编第五讲,认识多重继承,菱形继承的内存结构,以及反汇编中的表现形式.
C++反汇编第五讲,认识多重继承,菱形继承的内存结构,以及反汇编中的表现形式. 目录: 1.多重继承在内存中的表现形式 多重继承在汇编中的表现形式 2.菱形继承 普通的菱形继承 虚继承 汇编中的表现形 ...
- 【NOIP2014提高组】寻找道路
https://www.luogu.org/problem/show?pid=2296 满足条件的路径:路径上的所有点的出边所指向的点都与终点连通.反过来,不满足条件的路径:路径上至少一点的出边所指向 ...
- springBoot数据库连接池常用配置
在配置文件中添加配置如下(我使用的是多数据源): spring.datasource.primary.url=jdbc\:mysql\://localhost\:3306/test?useUnicod ...
- labview生成可执行文件
labview生成可执行文件可以分为两种情况. 第一种,是电脑中有labview软件开发环境的情况 第二种,是电脑中没有安装labview软件开发环境 下面是一个简单的labview代码: 程序解释: ...
- 教你如何用 lib-flexible 实现移动端H5页面适配
前话 好久没写教程了(可能会误导新手的菜鸟教程(￣▽￣)"). 这是我的github,欢迎前端大大们和我一起学习交流 https://github.com/pwcong 最近入职公司做前端实 ...
- Backtrack无线攻防(很任性的一篇)
首先你得有一个backtrack操作系统 然后还得花钱买一个无线网卡,最好是Intel的,还有要是USB接口的,可能是因为其他接口我不会接.