MySQL Error--打开过多文件导致数据库无法连接

【此文抄自同事的邮件，当作笔记学习】

环境描述
Mysql 5.5.21
OS centos 5.8
zabbix agent 2.4.3

情况描述
现象数据库处于运行状态，但是无法创建新的连接，监控报警数据库无法连接，连接不上MySQL，一直处于等待状态。

Mysql的error日志报错：

[ERROR] /usr/sbin/mysqld: Can't find file: './wukong_customs/wukong_task_info.frm' (errno: 23)
[ERROR] Error in accept: Too many open files in system

Mysqld进程打开的文件句柄数：
lsof（list open files）是一个列出当前系统打开文件的工具。

[root@db11149 ~]# lsof -p  | wc -l

没有超过MySQL设置的限值。

查看操作系统的日志：

localhost kernel: VFS: file-max limit  reached
localhostnrpe[]: Network server accept failure (: Too many open files in system)

日志显示操作系统的连接数已经达到了最大值65535了，但是服务器上运行的业务应用只有数据库服务，而mysql打开的文件句柄数不到5000个。因此推断是有哪个正在运行的服务打开的句柄数过多导致的。

显示shell中的资源限制：
ulimit命令修改的数值只对当前登录用户的目前使用环境有效（只对当前会话有效）,系统重启或者用户退出后就会失效.

[root@db11149 ~]# ulimit -a
core file size (blocks, -c)
dataseg size (kbytes, -d) unlimited
scheduling priority (-e)
file size (blocks, -f) unlimited
pending signals (-i)
max locked memory (kbytes, -l)
max memory size (kbytes, -m) unlimited
open files (-n)
pipe size ( bytes, -p)
POSIX message queues (bytes, -q)
real-time priority (-r)
stack size (kbytes, -s)
cpu time (seconds, -t) unlimited
max user processes (-u)
virtual memory (kbytes, -v) unlimited
file locks (-x) unlimited

对所有会话永久生效，修改limits.conf：

[root@db11149 ~]# cat /etc/security/limits.conf | tail -
# End of file
* soft nofile
* hard nofile 

这个当中的硬限制是实际的限制，而软限制，是warnning限制，只会做出warning.其实ulimit命令本身就有分软硬设置，加-H就是硬，加-S就是软
默认显示的是软限制，如果运行ulimit命令修改的时候没有加上的话，就是两个参数一起改变.

查看目前运行的所有进程打开的句柄数：

# fori in `ps -ef| egrep -v 'UID PID PPID' | awk '{print $2}'` ; do echo "pid=$i, open_files=`lsof -p $i | wc -l`" >> ;done
pid=, open_files=
pid=, open_files=
pid=, open_files=
pid=, open_files=
pid=, open_files=
pid=, open_files=
pid=, open_files=
pid=, open_files=
pid=, open_files=
pid=, open_files=

#for i in `ps -ef| egrep -v 'UID PID PPID' | awk '{print $2}'` ; do echo "open_files=`lsof -p $i | wc -l` &&& whole=`ps -ef | awk '{if($2=="'"$i"'"){print $0}}'`" ;done

查看打开句柄数最多的进程：

确定是zabbix进程打开的

[root@db11149 ~]# ps -ef | grep zabbix
root    Jul27 ? :: zabbix_agentd -c /etc/zabbix/zabbix_agentd.conf
root    Jul27 ? :: zabbix_agentd: collector [idle  sec]
root    Jul27 ? :: zabbix_agentd: listener # [waiting for connection]
root    Jul27 ? :: zabbix_agentd: listener # [waiting for connection]
root    Jul27 ? :: zabbix_agentd: listener # [waiting for connection]
root    Jul27 ? :: zabbix_agentd: listener # [waiting for connection]
root    Jul27 ? :: zabbix_agentd: listener # [waiting for connection]
root    Jul27 ? :: zabbix_agentd: listener # [waiting for connection]
root    Jul27 ? :: zabbix_agentd: listener # [waiting for connection]
root    Jul27 ? :: zabbix_agentd: listener # [waiting for connection]

产生原因

重启zabbix agent后，打开的文件被释放。

https://support.zabbix.com/browse/ZBX-9251

由此确定是由于zabbix agent的异常导致的。

如何处理
查找zabbix的资料后确定是zabbix agent的BUG，目前在zabbix agent 2.4.3和2.4.4版本中发现了这个BUG，在2.2和2.5版本中已经修复了。
然后更新zabbix agent的版本。