原文连接:MxNet和Caffe之间有什么优缺点

一、前言:

Minerva: 高效灵活的并行深度学习引擎

不同于cxxnet追求极致速度和易用性,Minerva则提供了一个高效灵活的平台让开发者快速实现一个高度定制化的深度神经网络。

Minerva在系统设计上使用分层的设计原则,将“算的快”这一对于系统底层的需求和“好用”这一对于系统接口的需求隔离开来,如图3所示。在接口上,我们提供类似numpy的用户接口,力图做到友好并且能充分利用Python和numpy社区已有的算法库。在底层上,我们采用数据流(Dataflow)计算引擎。其天然的并行性能够高效地同时地利用多GPU进行计算。Minerva通过惰性求值(Lazy Evaluation),将类numpy接口和数据流引擎结合起来,使得Minerva能够既“好用”又“算得快”。

图 3 Minerva的分层设计

惰性求值

Minerva通过自己实现的ndarray类型来支持常用的矩阵和多维向量操作。在命名和参数格式上都尽量和numpy保持一致。Minerva同时支持读取Caffe的配置文件并进行完整的训练。Minerva提供了两个函数与numpy进行对接。from_numpy函数和to_numpy函数能够在numpy的ndarray与Minerva的类型之间互相转换。因此,将Minerva和numpy混合使用将变得非常方便。

数据流引擎和多GPU计算

从Mapreduce到Spark到Naiad,数据流引擎一直是分布式系统领域研究的热点。数据流引擎的特点是记录任务和任务之间的依赖关系,然后根据依赖关系对任务进行调度。没有依赖的任务则可以并行执行,因此数据流引擎具有天然的并行性。在Minerva中,我们利用数据流的思想将深度学习算法分布到多GPU上进行计算。每一个ndarray运算在Minerva中就是一个任务,Minerva自身的调度器会根据依赖关系进行执行。用户可以指定每个任务在哪块卡上计算。因此如果两个任务之间没有依赖并且被分配到不同GPU上,那这两个任务将能够并行执行。同时,由于数据流调度是完全异步的,多卡间的数据通信也可以和其他任务并行执行。由于这样的设计,Minerva在多卡上能够做到接近线性加速比。此外,利用深盟的Parameter
Server,Minerva可以轻松将数据流拓展到多机上,从而实现多卡多机的分布式训练。

图4  Minerva和Caffe在单卡和多卡上训练GoogLeNet的比较

表1 Minerva在不同网络模型和不同GPU数目上的训练速度

数据流引擎和多GPU计算

Minerva采用惰性求值的方式将类numpy接口和数据流引擎结合起来。每次用户调用Minerva的ndarray运算,系统并不立即执行这一运算,而是将这一运算作为任务,异步地交给底层数据流调度器进行调度。之后,用户的线程将继续进行执行,并不会阻塞。这一做法带来了许多好处:

  • 在数据规模较大的机器学习任务中,文件I/O总是比较繁重的。而惰性求值使得用户线程进行I/O的同时,系统底层能同时进行计算。
  • 由于用户线程非常轻量,因此能将更多的任务交给系统底层。其中相互没有依赖的任务则能并行运算。
  • 用户能够在接口上非常轻松地指定每个GPU上的计算任务。Minerva提供了set_device接口,其作用是在下一次set_device调用前的运算都将会在指定的GPU上进行执行。由于所有的运算都是惰性求值的,因此两次set_device后的运算可以几乎同时进行调度,从而达到多卡的并行。

Parameter Server: 一小时训练600T数据

深盟的组件参数服务器(Parameter Server)对前述的应用提供分布式的系统支持。在大规模机器学习应用里,训练数据和模型参数均可大到单台机器无法处理。参数服务器的概念正是为解决此类问题而提出的。如图5所示,参数以分布式形式存储在一组服务节点中,训练数据则被划分到不同的计算节点上。这两组节点之间数据通信可归纳为发送(push)和获取(pull)两种。例如,一个计算节点既可以把自己计算得到的结果发送到所有服务节点上,也可以从服务节点上获取新模型参数。在实际部署时,通常有多组计算节点执行不同的任务,甚至是更新同样一组模型参数。

图5 参数服务器架构

在技术上,参数服务器主要解决如下两个分布式系统的技术难点。

降低网络通信开销

在分布式系统中,机器通过网络通信来共同完成任务。但不论是按照延时还是按照带宽,网络通信速度都是本地内存读写的数十或数百分之一。解决网络通信瓶颈是设计分布式系统的关键。

异步执行

在一般的机器学习算法中,计算节点的每一轮迭代可以划分成CPU繁忙和网络繁忙这两个阶段。前者通常是在计算梯度部分,后者则是在传输梯度数据和模型参数部分。串行执行这两个阶段将导致CPU和网络总有一个处于空闲状态。我们可以通过异步执行来提升资源利用率。例如,当前一轮迭代的CPU繁忙阶段完成时,可直接开始进行下一轮的CPU繁忙阶段,而不是等到前一轮的网络繁忙阶段完成。这里我们隐藏了网络通信开销,从而将CPU的使用率最大化。但由于没有等待前一轮更新的模型被取回,会导致这个计算节点的模型参数与服务节点处最新的参数不一致,由此可能会影响算法效率。

灵活的数据一致性模型

数据不一致性需要考虑提高算法效率和发挥系统性能之间的平衡。最好的平衡点取决于很多因素,例如CPU计算能力、网络带宽和算法的特性。我们发现很难有某个一致性模型能适合所有的机器学习问题。为此,参数服务器提供了一个灵活的方式用于表达一致性模型。

首先执行程序被划分为多个任务。一个任务类似于一个远程过程调用(Remote Procedure Call, RPC),可以是一个发送或一个获取,或者任意一个用户定义的函数,例如一轮迭代。任务之间可以并行执行,也可以加入依赖关系的控制逻辑,来串行执行,以确保数据的一致性。所有这些任务和依赖关系组成一个有向无环图,从而定义一个数据一致性模型,如图6所示。

图6 使用有向无环图来定义数据一致性模型

如图7所示,我们可以在相邻任务之间加入依赖关系的控制逻辑,得到顺序一致性模型,或者不引入任何依赖关系的逻辑控制,得到最终一致性模型。在这两个极端模型之间是受限延时模型。这里一个任务可以和最近的数个任务并行执行,但必须等待超过最大延时的未完成任务的完成。我们通过使用最大允许的延时来控制机器在此之前的数据不一致性。

图7 不同数据一致性下运行时间

图8展示了在广告点击预测中(细节描述见后文),不同的一致性模型下得到同样精度参数模型所花费的时间。当使用顺序一致性模型时(0延时),一半的运行时间花费在等待上。当我们逐渐放松数据一致性要求,可以看到计算时间随着最大允许的延时缓慢上升,这是由于数据一致性减慢了算法的收敛速度,但由于能有效地隐藏网络通信开销,从而明显降低了等待时间。在这个实验里,最佳平衡点是最大延时为8。

选择性通信

任务之间的依赖关系可以控制任务间的数据一致性。而在一个任务内,我们可以通过自定义过滤器来细粒度地控制数据一致性。这是因为一个节点通常在一个任务内有数百或者更多对的关键字和值(key, value)需要通信传输,过滤器对这些关键字和值进行选择性的通信。例如我们可以将较上次同步改变值小于某个特定阈值的关键字和值过滤掉。再如,我们设计了一个基于算法最优条件的KKT过滤器,它可过滤掉对参数影响弱的梯度。我们在实际中使用了这个过滤器,可以过滤掉至少95%的梯度值,从而节约了大量带宽。

缓冲与压缩

我们为参数服务器设计了基于区段的发送和获取通信接口,既能灵活地满足机器学习算法的通信需求,又尽可能地进行批量通信。在训练过程中,通常是值发生变化,而关键字不变。因此可以让发送和接收双方缓冲关键字,避免重复发送。此外,考虑到算法或者自定义过滤器的特性,这些通信所传输的数值里可能存在大量“0”,因此可以利用数据压缩有效减少通信量。

容灾

大规模机器学习任务通常需要大量机器且耗时长,运行过程中容易发生机器故障或被其他优先级高的任务抢占资源。为此,我们收集了一个数据中心中3个月内所有的机器学习任务。根据“机器数×用时”的值,我们将任务分成大中小三类,并发现小任务(100机器时)的平均失败率是6.5%;中任务(1000机器时)的失败率超过了13%;而对于大任务(1万机器时),每4个中至少有1个会执行失败。因此机器学习系统必须具备容灾功能。

参数服务器中服务节点和计算节点采用不同的容灾策略。对于计算节点,可以采用重启任务,丢弃失败节点,或者其他与算法相关的策略。而服务节点维护的是全局参数,若数据丢失和下线会严重影响应用的运行,因此对其数据一致性和恢复时效性要求更高。

参数服务器中服务节点的容灾采用的是一致性哈希和链备份。服务节点在存储模型参数时,通过一致性哈希协议维护一段或者数段参数。这个协议用于确保当有服务节点发生变化时,只有维护相邻参数段的服务节点会受到影响。每个服务节点维护的参数同时会在数个其他服务节点上备份。当一个服务节点收到来自计算节点的数据时,它会先将此数据备份到其备份节点上,然后再通知计算节点操作完成。中间的任何失败都会导致这次发送失败,但不会造成数据的不一致。

链备份适用于任何机器学习算法,但会使网络通信量成倍增长,从而可能形成性能瓶颈。对于某些算法,我们可以采用先聚合再备份的策略来减少通信。例如,在梯度下降算法里,每个服务节点先聚合来自所有计算节点的梯度,之后再更新模型参数,因此可以只备份聚合后的梯度而非来自每个计算节点的梯度。聚合可以有效减少备份所需通信量,但聚合会使得通信的延迟增加。不过这可以通过前面描述的异步执行来有效地隐藏。

在实现聚合链备份时,我们可以使用向量钟(vector clock)来记录收到了哪些节点的数据。向量钟允许我们准确定位未完成的节点,从而对节点变更带来的影响进行最小化。由于参数服务器的通信接口是基于区段发送的,所有区段内的关键字可以共享同一个向量钟来压缩其存储开销。

图8 三个系统在训练得到同样精度的模型时所各花费的时间

参数服务器不仅为深盟其他组件提供分布式支持,也可以直接在上面开发应用。例如,我们实现了一个分块的Proximal Gradient算法来解决稀疏的Logistic Regression,这是最常用的一个线性模型,被大量的使用在点击预测等分类问题中。

为了测试算法性能,我们采集了636TB真实广告点击数据,其中含有1700亿样本和650亿特征,并使用1000台机器共1.6万核来进行训练。我们使用两个服务产品的私有系统(均基于参数服务器架构)作为基线。图8展示的是这3个系统为了达到同样精度的模型所花费的时间。系统A使用了类梯度下降的算法(L-BFGS),但由于使用连续一致性模型,有30%的时间花费在等待上。系统B则使用了分块坐标下降算法,由于比系统A使用的算法更加有效,因此用时比系统A少。但系统B也使用连续一致性模型,并且所需全局同步次数要比系统A更多,所以系统B的等待时间增加到了50%以上。我们在参数服务器实现了与系统B同样的算法,但将一致性模型放松至受限延时一致性模型并应用了KKT过滤。与系统B相比,参数服务器需要略多的计算时间,但其等待时间大幅降低。由于网络开销是这个算法的主要瓶颈,放松的一致性模型使得参数服务器的总体用时只是系统B的一半。

Rabit:灵活可靠的同步通信

除了Parameter Server提供的异步通信之外,以GBDT和L-BFGS为代表的许多机器学习算法依然适合采用同步通信 (BSP)的方式进行交互。深盟的第二个通信框架Rabit提供了这一选择。

传统的同步通信机器学习程序往往采用MPI的Allreduce进行计算,但是因为MPI提供的接口过于复杂使得它并不容易提供容灾支持。Rabit简化了MPI的设计,抽取出机器学习最需要的Allreduce和Broadcast操作并加入了容灾的支持,使得基于分布式BSP的机器学习算法可以在部分节点出错或丢失的情况下快速恢复计算,完成剩下的任务。目前的GBDT算法xgboost就是基于Rabit提供的接口。同时,Rabit具有非常强的可移植性,目前支持在MPI、Hadoop Yarn和SunGrid Engine等各个平台下直接执行。异步的Parameter
Server 接口加上同步的Rabit接口基本涵盖了各种分布式机器学习算法需要的通信需求,使得我们可以很快地实现各种高效的分布式机器学习算法。



二、MxNet


caffe是很优秀的dl平台。影响了后面很多相关框架。

cxxnet借鉴了很多caffe的思想。相比之下,cxxnet在实现上更加干净,例如依赖很少,通过mshadow的模板化使得gpu和cpu代码只用写一份,分布式接口也很干净。

mxnet是cxxnet的下一代,目前实现了cxxnet所有功能,但借鉴了minerva/torch7/theano,加入更多新的功能。
  1. ndarray编程接口,类似matlab/numpy.ndarray/torch.tensor。独有优势在于通过背后的engine可以在性能上和内存使用上更优
  2. symbolic接口。这个可以使得快速构建一个神经网络,和自动求导。
  3. 更多binding 目前支持比较好的是python,马上会有julia和R
  4. 更加方便的多卡和多机运行
  5. 性能上更优。目前mxnet比cxxnet快40%,而且gpu内存使用少了一半。

目前mxnet还在快速发展中。这个月的主要方向有三,更多的binding,更好的文档,和更多的应用(language model、语音,机器翻译,视频)。地址在 dmlc/mxnet · GitHub

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