病原微生物分析:

Eg:痢疾杆菌

测序---比对(K12vs治病菌1vs治病菌2),发现:

“毒力岛”:K12没有,两个治病菌有,缩小搜寻范围。

“黑洞”:K12有,但两个治病菌没有。

SARS:

构建系统发育树,发现由冠状病毒进化而来。

不同地区的SARS基因组比较,可溯源病毒传播

根据各SARS冠状病毒分离株与造成香港Metropole饭店疫情的SARS冠状病毒株之间的联系,它们可以被分成2类(分别称之为”局域传播类”和”全球传播类”),这两类在我们构建的世系谱上得到准确的重现,这为SARS的流行病学研究提供了辅助信息。

人类基因组范围:

28,000+-4,000----3万/4万---14015个

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