扩增子图表解读8网络图:节点OTU或类Venn比较



扩增子图表解读8网络图:节点OTU或类Venn比较的更多相关文章
- 扩增子分析解读5物种注释 OTU表操作
本节课程,需要先完成<扩增子分析解读>系列之前的操作 1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类 4去嵌合体 非细菌序列 ...
- 扩增子图表解读4曼哈顿图:差异分类级别Taxonomy
曼哈顿图 Manhattan Plot 曼哈顿图本质上是一个散点图,用于显示大量非零大范围波动数值,最早应用于全基因组关联分析(GWAS)研究展示高度相关位点.它得名源于样式与曼哈顿天际线相似(如下图 ...
- 扩增子图表解读5火山图:差异OTU的数量及变化规律
火山图 Volcano plot 在统计学上,火山图是一种类型的散点图,被用于在大数据中快速鉴定变化.由于它的形成像火山喷发的样子,所以被称为火山图.和上文讲的曼哈顿图类似. 火山图基本元素 火山 ...
- 扩增子图表解读3热图:差异菌、OTU及功能
热图是使用颜色来展示数值矩阵的图形.通常还会结合行.列的聚类分析,以表达实验数据多方面的结果. 热图在生物学领域应用广泛,尤其在高通量测序的结果展示中很流行,如样品-基因表达,样品-OTU相对丰度矩 ...
- 扩增子图表解读6韦恩图:比较组间共有和特有OTU或分类单元
韦恩图 Venn Diagram Venn Diagram,也称韦恩图.维恩图.文氏图,用于显示元素集合重叠区域的图示. 韦图绘制工具 常用R语言的VennDiagram包绘制,输出PDF格式方便 ...
- 扩增子图表解读1箱线图:Alpha多样性
箱线图 箱形图(Box-plot)又称为盒须图.盒式图或箱线图,是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图.因形状如箱子而得名.在宏基因组领域,常用于展示样品组中各样品Alpha多样性的分布 第一种情 ...
- 宏基因组扩增子图表解读2散点图:组间整体差异分析(Beta多样性)
散点图 数据点在直角坐标系平面上的分布图.在宏基因组领域,散点图常用于展示样品组间的Beta多样性,常用的分析方法有主成分分析(PCA),主坐标轴分析(PCoA/MDS)和限制条件的主坐标轴分析(CP ...
- 扩增子分析解读6进化树 Alpha Beta多样性
分析前准备 # 进入工作目录 cd example_PE250 上一节回顾:我们的OTU获得了物种注释,并学习OTU表的各种操作————添加信息,格式转换,筛选信息. 接下来我们学习对OTU序列的 ...
- 扩增子分析解读4去嵌合体 非细菌序列 生成代表性序列和OTU表
本节课程,需要先完成 扩增子分析解读1质控 实验设计 双端序列合并 2提取barcode 质控及样品拆分 切除扩增引物 3格式转换 去冗余 聚类 先看一下扩增子分析的整体流程,从下向上逐层分析 分 ...
随机推荐
- Java虚拟机深入JVM内核—原理、诊断与优化视频教程
http://www.eimhe.com/forum.php?mod=viewthread&tid=142832&highlight=%C4%DA%BA%CB
- Oracle RAC load blance
首先声明 本文基本是阅读 大话RAC 后的笔记.OK, 进入正题. Oracle 10g RAC中采取两种方式提供负载均衡.第一种是connection blance.在用户连接的时候,根据随机算法把 ...
- 友盟 个推 微信sdk spring boot
友盟 个推 微信sdk spring boot ngix mongodb memory cache
- HDU 1973
Prime Path Time Limit: 5000/1000 MS (Java/Others) Memory Limit: 65536/32768 K (Java/Others) Total ...
- Spark SQL CLI 实现分析
背景 本文主要介绍了Spark SQL里眼下的CLI实现,代码之后肯定会有不少变动,所以我关注的是比較核心的逻辑.主要是对照了Hive CLI的实现方式,比較Spark SQL在哪块地方做了改动,哪些 ...
- 解决华为手机不出现logcat日志的问题
问题描写叙述:公司一部华为手机在连接Eclipse时在Logcat中看不到相关日志 解决方法:1 进入手机拨号界面2 输入*#*#2846579#*#*3 输入完成后自己主动跳转到測试界面4 依次选择 ...
- 自然常数 e 的理解与应用
某彩票中奖率是百万分之一,则一个人买一百万张彩票仍不中奖的概率是: (1−1106)106≈1e e 往往出现在: 许多微小事件带来的总体变化 随机性和无穷多:
- 腾讯云linux服务器安装lnmp一键包
这边域名已经实名了. 然后修改DNS服务器 然后备案吧 还是先不备案,直接云解析DNS 哦,想起来了,阿里云自己都可以生成SSL证书.重新弄一次吧,其实腾讯云也可以申请域名型免费版DV
- PCB genesis SET取中心点--算法实现
最新ICS工厂有一项incam脚本新需求,这里介绍5种解决方法解决 需求如下图所示:绿色所圈处是是需求出的中心点(图形间距一致归为一类并计算中心点坐标) 前题条件:1.一个SET里面可能有多个CAM, ...
- struts2基础学习----struts.xml配置文件
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?> <!DOCTYPE struts PUBLIC "- ...