2016国自然新秀CircRNA的研究策略和分析

 

CircRNA 环化RNA的更多相关文章

  1. circRNA

    一.circRNA序列提取 环状RNA (circRNA)是一类不具有 5' 末端帽子和 3' 末端 poly(A)尾巴.并以共价键形成环形结构的非编码 RNA 分子. 环状RNA (circRNA) ...

  2. circRNA 中的ALU 重复元件

    circRNA 最初研究的很少,只有很小一部分基因有检测到circRNA, 当时都认为是剪切错误形成的,对于其功能也没人去研究:学者对人类的成纤维细胞进行转录组测序,构建去核糖体文库, 同时采用了RN ...

  3. circRNA 在人和小鼠脑组织中的表达

    circRNA 是一类动物体内的内源性的RNA,尽管circRNA的种类丰富,但是其在神经系统中的 功能,并不清楚.科学家通过对人和小鼠的不同脑部组织的RNA 测序,发现了上千种circRNA,经过分 ...

  4. circRNA研究手册

    环状RNA(circRNA)研究技术手册.doc.pdf (转自:汉恒生物)

  5. find_circ 识别circRNA 的原理

    find_circ 通过识别junction reads 来预测circRNA 和参考基因组比对完之后,首先剔除和基因组完全比对的reads,保留没比对上的reads, 这部分reads 直接比是比对 ...

  6. CIRI 识别circRNA的原理

    CIRI 根据circRNA 连接点处的reads来识别circRNA, 在连接点处的reads 其比对情况非常特殊: CIRI 根据3种模型来识别circRNA, 连接点处的read 叫做junct ...

  7. circRNA 序列提取中的难点

    在预测circRNA时,都是检测breakpoint 处的reads 数,最后给出的环状RNA的ID 都是诸如 chr14:106994222-107183708 这样的形式,给出了起始和终止位置: ...

  8. Circular RNA的产生机制、功能及RNA-seq数据鉴定方法

    推荐关注微信公众号:AIPuFuBio,和使用免费生物信息学资源和工具AIPuFu:http://www.aipufu.com. [Circular RNA的产生机制] Circular RNA,缩写 ...

  9. 2. Transcribing DNA into RNA

    Problem An RNA string is a string formed from the alphabet containing 'A', 'C', 'G', and 'U'. Given ...

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