参考资料：

【cfDNA专题】cell-free DNA在非肿瘤疾病中的临床价值（好）

ctDNA, cfDNA和CTCs有什么区别吗？

cfDNA你懂多少？

新发现 | 基因是否表达,做个cfDNA全基因组测序就可揭晓

游离DNA

Cell-Free DNA (cfDNA) Isolation

游离DNA (circulating cell free DNA，cfDNA)，是一种在细胞外呈现游离状态且无细胞状态的的DNA，广泛存在于动植物及人类的血清、血浆、脑脊液、尿液、痰液或粪便当中。过去，有许多文献证实，肿瘤患者的血浆和血清中检测到了癌基因突变，并且与原发肿瘤相一致[1.2.3]，因此cfDNA逐渐受到重视。如今，游离在血液中DNA的研究促成了「非侵入性检测」技术的发展。除肿瘤检测(tumor gene screening) 与监控外，还发展其他应用，胎儿产前诊断(prenatal screening)。这些应用，皆可透过次世代定序技术来进行检测，同时为非侵入性，风险低且准确率高。

适用研究目的：1.非侵入性产前染色体检测；2.肿瘤检测监控。

基本分析：Quality trimmed, Mapping to reference genome, SNP/INDEL detection, SNP/INDEL annotation by VEP

cfDNA（circulating cell free DNA）全基因组测序的更多相关文章

  1. 全基因组测序 Whole Genome Sequencing

    全基因组测序 Whole Genome Sequencing 全基因组测序(Whole Genome Sequencing,WGS)是利用高通量测序平台对一种生物的基因组中的全部基因进行测序,测定其 ...

  2. PacBio全基因组测序和组装

    PacBio公司的业务范围也就5个(官网): Whole Genome Sequencing Targeted Sequencing Complex Populations RNA Sequencin ...

  3. 全基因组测序 从头测序(de novo sequencing) 重测序(re-sequencing)

    全基因组测序 全基因组测序分为从头测序(de novo sequencing)和重测序(re-sequencing). 从头测序(de novo)不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序 ...

  4. WGS 全基因组测序数据分析

    1. DNA测序技术 https://www.jianshu.com/p/6122cecec54a 2.FASTA和FASTQ文件格式 https://www.jianshu.com/p/50ff30 ...

  5. 利用ONT测序检测真核生物全基因组甲基化状态

    摘要 甲基化在真核生物基因组序列中广泛存在,其中5mC最为普遍,在真核生物基因组中也有发现6mA.捕获基因组中的甲基化状态的常用技术是全基因组甲基化测序(WGBS)和简化甲基化测序(RRBS),而随着 ...

  6. 如何鉴定全基因组加倍事件（WGD）

    目前鉴定全基因组加倍(whole-genome duplication events)有3种 通过染色体共线性(synteny) 方法是比较两个基因组的序列,并将同源序列的位置绘制成点状图,如果能在点 ...

  7. GWAS | 全基因组关联分析 | Linkage disequilibrium (LD)连锁不平衡 | 曼哈顿图 Manhattan_plot | QQ_plot | haplotype phasing

    现在GWAS已经属于比较古老的技术了,主要是碰到严重的瓶颈了,单纯的snp与表现的关联已经不够,需要具体的生物学解释,这些snp是如何具体导致疾病的发生的. 而且,大多数病找到的都不是个别显著的snp ...

  8. 柳叶刀重磅出击！全外显子测序在胎儿结构异常的评估Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective cohort study

    柳叶刀发表的文献解读:Whole-exome sequencing in the evaluation of fetal structural anomalies: a prospective coh ...

  9. 【GWAS文献解读】疟原虫青蒿素抗药性的全基因组关联分析

    英文名:Genetic architecture of artemisinin-resistant Plasmodium falciparum 中文名:疟原虫青蒿素抗药性的全基因组关联分析 期刊:Na ...

随机推荐

  1. qq

    引用:http://blog.sina.com.cn/s/blog_9e2e84050101blqz.html 腾讯QQ使用何种开发平台?                   腾讯QQ的开发分客户端软 ...

  2. 最新IP地址数据库Dat格式-高性能高并发版(2017年1月)

    最新IP地址数据库->Dat格式 高性能格式->qqzeng-ip.dat 国内版-20170101-Dat 版                国外版-20170101-Dat 版     ...

  3. cache与MMU与总线仲裁

    为了以合理的价格,设计容量和速度满足计算机系统的需求,计算机体系结构设计者设计出了存储器的层次结构. "Cache-主存"和"主存-辅存"是最常见的两种层次结构 ...

  4. Java 获取两个日期之间的日期

    1.前期需求,两个日期,我们叫他startDate和endDate,然后获取到两个日期之间的日期 /** * 获取两个日期之间的日期 * @param start 开始日期 * @param end ...

  5. 查看SQL语句在SQL Server上的执行时间

    set statistics profile onset statistics io onset statistics time ongo--begin <这里写上你的语句...>  se ...

  6. DELPHI XE5

    一直觉得DELPHI7之后,如果写WINDOWS桌面应用,没什么变化. 一直在痛苦,为什么DELPHI提供的控件那么丑陋,透明等什么功能都做的那么差. 一直在郁闷,新装的DELPHI都不带DEMO. ...

  7. Windows访问Ubuntu14.04远程桌面全攻略

    最近接到一个任务,在Ubuntu系统下开发一个串口读写程序.开发要在台式机上进行,安装UbuntuKylin 14.04,并且在串口连接了设备.个人使用的是笔记本电脑,系统是Windows8.1.自然 ...

  8. Linux驱动程序学习【转】

    本文转载自: 一直在学习驱动,对于下面这篇文章,本人觉得简洁明了,基本符合我们学习驱动的进度与过程,现转发到自己的博客,希望能与更多的朋友分享. 了解Linux驱动程序技巧学习的方法很重要,学习lin ...

  9. <Interview Problem>最小的“不重复数”

    百度的一道笔试题目,看到博客园讨论挺热烈的,也写一下玩玩. 实现思想:举个简单的例子11233,从高位到低位开始判断是否有重复数,高位有重复数后,首先修改高位的,高位修改后变为12233,因为要求最小 ...

  10. args[0]

    java程序有一个主方法,是这样的public static void main(String [] args)你说的args[0]就是你用命令行编译运行java程序时,传入的第一个参数,比如你运行一 ...