Python实现DBSCAN聚类算法(简单样例测试)
发现高密度的核心样品并从中膨胀团簇。
Python代码如下:
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Demo of DBSCAN clustering algorithm
Finds core samples of high density and expands clusters from them.
"""
print(__doc__)
# 引入相关包
import numpy as np
from sklearn.cluster import DBSCAN
from sklearn import metrics
from sklearn.datasets.samples_generator import make_blobs
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
import matplotlib.pyplot as plt
# 初始化样本数据
centers = [[1, 1], [-1, -1], [1, -1]]
X, labels_true = make_blobs(n_samples=750, centers=centers, cluster_std=0.4,
random_state=0)
X = StandardScaler().fit_transform(X)
# 计算DBSCAN
db = DBSCAN(eps=0.3, min_samples=10).fit(X)
core_samples_mask = np.zeros_like(db.labels_, dtype=bool)
core_samples_mask[db.core_sample_indices_] = True
labels = db.labels_
# 聚类的结果
n_clusters_ = len(set(labels)) - (1 if -1 in labels else 0)
n_noise_ = list(labels).count(-1)
print('Estimated number of clusters: %d' % n_clusters_)
print('Estimated number of noise points: %d' % n_noise_)
print("Homogeneity: %0.3f" % metrics.homogeneity_score(labels_true, labels))
print("Completeness: %0.3f" % metrics.completeness_score(labels_true, labels))
print("V-measure: %0.3f" % metrics.v_measure_score(labels_true, labels))
print("Adjusted Rand Index: %0.3f"
% metrics.adjusted_rand_score(labels_true, labels))
print("Adjusted Mutual Information: %0.3f"
% metrics.adjusted_mutual_info_score(labels_true, labels,
average_method='arithmetic'))
print("Silhouette Coefficient: %0.3f"
% metrics.silhouette_score(X, labels))
# 绘出结果
unique_labels = set(labels)
colors = [plt.cm.Spectral(each)
for each in np.linspace(0, 1, len(unique_labels))]
for k, col in zip(unique_labels, colors):
if k == -1:
col = [0, 0, 0, 1]
class_member_mask = (labels == k)
xy = X[class_member_mask & core_samples_mask]
plt.plot(xy[:, 0], xy[:, 1], 'o', markerfacecolor=tuple(col),
markeredgecolor='k', markersize=14)
xy = X[class_member_mask & ~core_samples_mask]
plt.plot(xy[:, 0], xy[:, 1], 'o', markerfacecolor=tuple(col),
markeredgecolor='k', markersize=6)
plt.title('Estimated number of clusters: %d' % n_clusters_)
plt.show()
测试结果如下:
最终结果绘图:
具体数据:
Python实现DBSCAN聚类算法(简单样例测试)的更多相关文章
- extern外部方法使用C#简单样例
外部方法使用C#简单样例 1.添加引用using System.Runtime.InteropServices; 2.声明和实现的连接[DllImport("kernel32", ...
- spring事务详解(二)简单样例
系列目录 spring事务详解(一)初探事务 spring事务详解(二)简单样例 spring事务详解(三)源码详解 spring事务详解(四)测试验证 spring事务详解(五)总结提高 一.引子 ...
- 机器学习入门-DBSCAN聚类算法
DBSCAN 聚类算法又称为密度聚类,是一种不断发张下线而不断扩张的算法,主要的参数是半径r和k值 DBSCAN的几个概念: 核心对象:某个点的密度达到算法设定的阈值则其为核心点,核心点的意思就是一个 ...
- Python实现 K_Means聚类算法
使用 Python实现 K_Means聚类算法: 问题定义 聚类问题是数据挖掘的基本问题,它的本质是将n个数据对象划分为 k个聚类,以便使得所获得的聚类满足以下条件: 同一聚类中的数据对象相似度较高 ...
- velocity简单样例
velocity简单样例整体实现须要三个步骤,详细例如以下: 1.创建一个Javaproject 2.导入须要的jar包 3.创建须要的文件 ============================= ...
- 自己定义隐式转换和显式转换c#简单样例
自己定义隐式转换和显式转换c#简单样例 (出自朱朱家园http://blog.csdn.net/zhgl7688) 样例:对用户user中,usernamefirst name和last name进行 ...
- Kafka在Linux上安装部署及样例测试
Kafka是一个分布式的.可分区的.可复制的消息系统.它提供了普通消息系统的功能,但具有自己独特的设计.这个独特的设计是什么样的呢 介绍 Kafka是一个分布式的.可分区的.可复制的消息系统.它提供了 ...
- gtk+3.0的环境配置及基于gtk+3.0的python简单样例
/********************************************************************* * Author : Samson * Date ...
- 5.无监督学习-DBSCAN聚类算法及应用
DBSCAN方法及应用 1.DBSCAN密度聚类简介 DBSCAN 算法是一种基于密度的聚类算法: 1.聚类的时候不需要预先指定簇的个数 2.最终的簇的个数不确定DBSCAN算法将数据点分为三类: 1 ...
随机推荐
- Linux内存管理解析(二) : 关于Linux内存管理的大体框架
什么是内存管理 ? 首先内存管理管理的主要对象是虚拟内存,但是虚拟内存对应的映射主要为物理内存,其次也可能通过交换空间把虚拟内存与硬盘映射起来,既然如此,那我们先了解物理内存的管理. 对于物理内存而言 ...
- centos6.8 安装.net core2.1 sdk 或 .net core2.1 runtime
前段时间看.net core 更更更新了,大家反应都挺好,想有机会也学习一下,正好这两天要写一个简单的服务在centos上面跑,于是决定放弃使用java,直接.net core走起来,事情进行的非常顺 ...
- [Docker] 使用docker inspect查看宿主机与容器的共享目录
docker inspect 容器名,可以查看到容器的元信息,在返回的j'son信息里面有个Mounts字段可以看到挂载目录 "Mounts": [ { "Type&qu ...
- 移动端 location.href 无法成功跳转页面
最近做的移动端页面在请求成功后要跳转页面,通过location.href实现的跳转.但同事在测试时,安卓机可以成功跳转,苹果IOS确无法成功跳转. 解决办法:在链接后面加一个随机参数,这样就可以跳 ...
- 学习了解CSS3发展方向和CSS样式与优先级
通过学习CSS3游戏介绍.CSS样式和优先级章节,了解到html5+css3+js不光可以实现动画,其次可以往这个游戏与建模方向发展,更多css3特效访问Gerard Ferrandez on Cod ...
- element-ui 组件 el-calendar 农历显示问题
一.官方文档:https://element.eleme.cn/#/zh-CN/component/calendar 发现官方并无农历显示的介绍 二.1. 自己写阳历转阴历的方法或引入别人写好的 JS ...
- Anaconda使用教程全攻略
Anaconda使用教程全攻略 本文转自 https://zhuanlan.zhihu.com/p/32925500 〇.序 Python是一种面向对象的解释型计算机程序设计语言, ...
- Codeforces Round447 D树上前缀和
已知完全二叉树和每条边的权值,q次询问,每次给出sta起点和H. w=(H-点到sta的权值),求w>0的所有w的加和. 这题用树上前缀和来写,e[i]记录子树上的点到点i的距离,sum[i][ ...
- Linux基础:df命令总结
本文只总结一些常用的用法,更详细的说明见man df和 df --help. df命令 df命令用于显示目前在Linux系统上的文件系统的磁盘使用情况统计. df命令主要是从各文件系统的Super b ...
- VMware Workstation Pro工具
安装包 链接:https://pan.baidu.com/s/1n-URb83lHtric3Ds8UbF9Q 提取码:c9z5 密钥 FF31K-AHZD1-H8ETZ-8WWEZ-WUUVA CV7 ...