vegan 包进行Adonis 分析
Adonis 分析 是基于距离矩阵的多变量方差置换分析,
代码示例:

默认使用bray 距离来计算样本间的距离矩阵
参考资料:
https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics/adonis
https://pdfs.semanticscholar.org/038e/8869b676aa365f2afdea935edf3f2003324d.pdf
vegan 包进行Adonis 分析的更多相关文章
- vegan 包进行 Bioenv 分析
Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合: 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 Bray-Curtis ...
- R语言 vegan包计算物种累计曲线
vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: library(vegan) data(BCI) sp1 <- spec ...
- 重磅︱R+NLP:text2vec包——New 文本分析生态系统 No.1(一,简介)
每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 词向量的表示主流的有两种方式,一种当然是耳熟能 ...
- 捕获网络数据包并进行分析的开源库-WinPcap
什么是WinPcap WinPcap是一个基于Win32平台的,用于捕获网络数据包并进行分析的开源库. 大多数网络应用程序通过被广泛使用的操作系统元件来访问网络,比如sockets. 这是一种简单的 ...
- 计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers(Wireshark抓包与协议分析实验)
计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers(Wireshark抓包与协议分析实验) 前言:本博客包含Windows10下安装wget.Wireshark. 一些有用的 ...
- [转] TCP数据包重组实现分析
PS: 这个实现对于某些特定情况未必是最佳实现,可以用数组来代替队列来实现 参照TCP/IP详解第二卷24~29章,详细论述了TCP协议的实现,大概总结一下TCP如何向应用层保证数据包的正确性.可靠性 ...
- golang中container/heap包源码分析
学习golang难免需要分析源码包中一些实现,下面就来说说container/heap包的源码 heap的实现使用到了小根堆,下面先对堆做个简单说明 1. 堆概念 堆是一种经过排序的完全二叉树,其中任 ...
- 网络编程-SOCKET开发之----2. TCP粘包现象产生分析
1. 粘包现象及产生原因 1)概念 指TCP协议中,发送方发送的若干个包数据到接收方接收时粘成一包.发送方粘包:发送方把若干个要发送的数据包封装成一个包,一次性发送,减少网络IO延迟:接收方粘包:接收 ...
- 1.Spring Boot入门及其jar包依赖模型分析
Spring Boot介绍 Spring Boot是由Pivotal团队提供的新框架,其设计目的是简化Spring应用的搭建以及开发过程.其目标是: 为所有Spring开发提供一个从根本上更快,且方便 ...
随机推荐
- 【开发】MFC到Delphi的皮肤移植
最近一直在学嵌入式,蛋疼啊,专业学软件的去搞硬件原理,真心有点伤不起,比较无聊,希望尽早脱离这个状态. 中午在林同学那里看到他在MFC上应用了Skin++皮肤,这是一款通用的软件换肤套件,支持各 ...
- Git详解之Git分支
Git 分支 几乎每一种版本控制系统都以某种形式支持分支.使用分支意味着你可以从开发主线上分离开来,然后在不影响主线的同时继续工作.在很多版本控制系统中,这是个昂贵的过程,常常需要创建一个源代码目录的 ...
- FFmpeg Basics学习笔记(1)ffmpeg基础
1 FFmpeg的由来 FFmpeg缩写中,FF指的是Fast Forward,mpeg是 Moving Pictures Experts Group的缩写.官网:ffmpeg.org 编译好的可执行 ...
- 【Python】解决UnicodeEncodeError: 'ascii' codec can't encode character u'\u2019' in position 0: ordinal not in range(128)
指定文件字符集为utf-8 在文件头部加入以下代码: import sys reload(sys) sys.setdefaultencoding('utf-8')
- 利用cmd代码一次性提取电脑登陆过的wifi密码到桌面
for /f "skip=10 tokens=1,2 delims=:" %i in ('netsh wlan show profiles') do @for /f "t ...
- MVC LinqToSql Json DbComparisonExpression 需要具有可比较类型的参数。
需求是:使用post方式传入Controller一个id,然后返回给前台一个Json.突然就报了这个错误,折腾了俩小时, 发现是linq to sql 的语法错了
- Memcaced多站点登录图解
- [转]Oracle中Hint深入理解
原文地址:http://czmmiao.iteye.com/blog/1478465 Hint概述 基于代价的优化器是很聪明的,在绝大多数情况下它会选择正确的优化器,减轻了DBA的负担.但有时它也聪明 ...
- spark wordcont Spark: sortBy和sortByKey函数详解
//统计单词top10def main(args: Array[String]): Unit = { val conf = new SparkConf().setAppName("tst&q ...
- centos 6.4 x86_64 (minimal) 编译安装percona
下载Percona-Server-5.5.24-26.0 wget https://www.percona.com/downloads/Percona-Server-5.5/Percona-Serve ...