Adonis 分析 是基于距离矩阵的多变量方差置换分析，

代码示例：

默认使用bray 距离来计算样本间的距离矩阵

参考资料：

https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics/adonis

https://pdfs.semanticscholar.org/038e/8869b676aa365f2afdea935edf3f2003324d.pdf

vegan 包进行Adonis 分析的更多相关文章

  1. vegan 包进行 Bioenv 分析

    Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合: 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 Bray-Curtis ...

  2. R语言 vegan包计算物种累计曲线

    vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: library(vegan) data(BCI) sp1 <- spec ...

  3. 重磅︱R+NLP：text2vec包——New 文本分析生态系统 No.1（一,简介）

    每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 词向量的表示主流的有两种方式,一种当然是耳熟能 ...

  4. 捕获网络数据包并进行分析的开源库-WinPcap

    什么是WinPcap WinPcap是一个基于Win32平台的,用于捕获网络数据包并进行分析的开源库. 大多数网络应用程序通过被广泛使用的操作系统元件来访问网络,比如sockets.  这是一种简单的 ...

  5. 计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers（Wireshark抓包与协议分析实验）

    计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers(Wireshark抓包与协议分析实验) 前言:本博客包含Windows10下安装wget.Wireshark. 一些有用的 ...

  6. [转] TCP数据包重组实现分析

    PS: 这个实现对于某些特定情况未必是最佳实现,可以用数组来代替队列来实现 参照TCP/IP详解第二卷24~29章,详细论述了TCP协议的实现,大概总结一下TCP如何向应用层保证数据包的正确性.可靠性 ...

  7. golang中container/heap包源码分析

    学习golang难免需要分析源码包中一些实现,下面就来说说container/heap包的源码 heap的实现使用到了小根堆,下面先对堆做个简单说明 1. 堆概念 堆是一种经过排序的完全二叉树,其中任 ...

  8. 网络编程-SOCKET开发之----2. TCP粘包现象产生分析

    1. 粘包现象及产生原因 1)概念 指TCP协议中,发送方发送的若干个包数据到接收方接收时粘成一包.发送方粘包:发送方把若干个要发送的数据包封装成一个包,一次性发送,减少网络IO延迟:接收方粘包:接收 ...

  9. 1.Spring Boot入门及其jar包依赖模型分析

    Spring Boot介绍 Spring Boot是由Pivotal团队提供的新框架,其设计目的是简化Spring应用的搭建以及开发过程.其目标是: 为所有Spring开发提供一个从根本上更快,且方便 ...

随机推荐

  1. HBase操作（Shell与Java API）

    版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载.     转: http://blog.csdn.net/u013980127/article/details/52443155 下面代码在Hado ...

  2. webpack配置提取公共代码

    公共代码提取功能是针对多入口文件的: 背景:在pageA.js和pageB.js中分别引用subPageA.js和subPageB.js webpack.config.js文件: var path = ...

  3. 使用 Jackson 树模型(tree model) API 处理 JSON

    http://blog.csdn.net/gao1440156051/article/details/54091702 http://blog.csdn.net/u010003835/article/ ...

  4. JAVA实现MD5加密算法（使用MessageDigest）

    http://blog.csdn.net/ymc0329/article/details/6738711 *********************************************** ...

  5. PHP 常见header 状态

    转载:http://blog.csdn.net/mothz/article/details/6029810 <?php //200 正常状态 header('HTTP/1.1 200 OK'); ...

  6. JAVA-JSP内置对象之application范围

    相关资料:<21天学通Java Web开发> application范围1.就是指在整个服务器范围,直到服务器停止以后才会失效.2.通过使用application的setAttribute ...

  7. golang后台任务库

    功能需求 本来想用linux自带的corntab,然而corn调试困难,而且不支持以下需求 能分布式 有http接口 能调试 有统计 kala 这个需求也不算小众,于是在网上查了一下,果然有,而且还比 ...

  8. Bootstrap+Angularjs自制弹框

    指令 directive('bsPopup', function ($parse) { return { require: 'ngModel', restrict: 'A', link: functi ...

  9. 让PHP7达到最高性能的几个Tips(转)

    PHP7已经发布了, 作为PHP10年来最大的版本升级, 最大的性能升级, PHP7在多放的测试中都表现出很明显的性能提升, 然而, 为了让它能发挥出最大的性能, 我还是有几件事想提醒下. PHP7 ...

  10. MySQL日志——二进制日志

    Mac怎么这么坑呢,搞了2小时了.唉 先来一个简单的,挖好坑,明天解决. 终端进入mysql: mysql> set global general_log=on; 然后进行数据库的任意操作: 查 ...