Adonis 分析 是基于距离矩阵的多变量方差置换分析，

代码示例：

默认使用bray 距离来计算样本间的距离矩阵

参考资料：

https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/topics/adonis

https://pdfs.semanticscholar.org/038e/8869b676aa365f2afdea935edf3f2003324d.pdf

vegan 包进行Adonis 分析的更多相关文章

  1. vegan 包进行 Bioenv 分析

    Bioenv 分析通过 计算样本群落结构的距离矩阵和 环境因子的距离矩阵,计算两个距离之间的相关系数,挑选出最佳的环境因子组合: 默认情况下,计算 群落结构的距离矩阵时, 使用 Bray-Curtis ...

  2. R语言 vegan包计算物种累计曲线

    vegan 包是进行群落数据分析最常用的R包,其中的 specaccum 函数用来计算物种的累计曲线 首先看下官方示例: library(vegan) data(BCI) sp1 <- spec ...

  3. 重磅︱R+NLP：text2vec包——New 文本分析生态系统 No.1（一,简介）

    每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- 词向量的表示主流的有两种方式,一种当然是耳熟能 ...

  4. 捕获网络数据包并进行分析的开源库-WinPcap

    什么是WinPcap WinPcap是一个基于Win32平台的,用于捕获网络数据包并进行分析的开源库. 大多数网络应用程序通过被广泛使用的操作系统元件来访问网络,比如sockets.  这是一种简单的 ...

  5. 计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers（Wireshark抓包与协议分析实验）

    计算机网络实验 Labexercise1-1 Protocol Layers(Wireshark抓包与协议分析实验) 前言:本博客包含Windows10下安装wget.Wireshark. 一些有用的 ...

  6. [转] TCP数据包重组实现分析

    PS: 这个实现对于某些特定情况未必是最佳实现,可以用数组来代替队列来实现 参照TCP/IP详解第二卷24~29章,详细论述了TCP协议的实现,大概总结一下TCP如何向应用层保证数据包的正确性.可靠性 ...

  7. golang中container/heap包源码分析

    学习golang难免需要分析源码包中一些实现,下面就来说说container/heap包的源码 heap的实现使用到了小根堆,下面先对堆做个简单说明 1. 堆概念 堆是一种经过排序的完全二叉树,其中任 ...

  8. 网络编程-SOCKET开发之----2. TCP粘包现象产生分析

    1. 粘包现象及产生原因 1)概念 指TCP协议中,发送方发送的若干个包数据到接收方接收时粘成一包.发送方粘包:发送方把若干个要发送的数据包封装成一个包,一次性发送,减少网络IO延迟:接收方粘包:接收 ...

  9. 1.Spring Boot入门及其jar包依赖模型分析

    Spring Boot介绍 Spring Boot是由Pivotal团队提供的新框架,其设计目的是简化Spring应用的搭建以及开发过程.其目标是: 为所有Spring开发提供一个从根本上更快,且方便 ...

随机推荐

  1. 漫游Kafka之过期数据清理【转】

    转自:http://blog.csdn.net/honglei915/article/details/49683065 Kafka将数据持久化到了硬盘上,允许你配置一定的策略对数据清理,清理的策略有两 ...

  2. 【socket】小项目-智能点餐系统

    系统说明 前段时间做的一个智能点餐系统,从0开始,用时3天,其中调bug(内存拷贝)调了一天,囧,现记一些架构文档 这个系统涉及到的知识点还是挺多的 典型的c/s模式,socket通信 多线程操作 数 ...

  3. 使用 IDEA 开发工具（版本为 IntelliJ IDEA 14.1.4）打可执行jar包的操作步骤

    声明:教程演示使用的开发工具的版本是 IntelliJ IDEA 14.1.4. 1.选择IDEA开发工具菜单栏 File --> Project Structure,弹出如下窗口,在左侧的列表 ...

  4. visual studio 2005提示脚本错误 /VC/VCWizards/2052/Common.js

    今天在做OCX添加接口的时候,莫名其妙的遇到visual studio 2005提示脚本错误,/VC/VCWizards/2052/Common.js. 网上找了很多资料,多数介绍修改注册表“vs20 ...

  5. 隐藏windows任务栏中的窗口显示

    在实际应用中遇到类似下列需要: 隐藏windows窗口,在windows任务栏中窗口不可见,但应用程序在后台运行. windows应用程序的窗口默认会在任务栏中添加一个可见的窗口项,方便用户操作和在不 ...

  6. Lintcode: Majority Number II 解题报告

    Majority Number II 原题链接: http://lintcode.com/en/problem/majority-number-ii/# Given an array of integ ...

  7. LeetCode: Jump Game II 解题报告

    Jump Game II Given an array of non-negative integers, you are initially positioned at the first inde ...

  8. uboot第一阶段关键位置分析

    /* * the actual reset code */ reset: /* * set the cpu to SVC32 mode */ mrs r0,cpsr bic r0,r0,#0x1f o ...

  9. CLR笔记-枚举类型

    class Program { static void Main(string[] args) { Color color = Color.Red; Console.WriteLine(color.T ...

  10. 卡西欧（casio）Fx-5800p程序调试器||模拟器V1.0

    一.[背景] 都说这个卡西欧5800p没有模拟器,模拟器其实就是个电脑上面模拟他的界面的东西,但是真正的核心,他不一定有,而且我们测量方面的编程及时有了所谓的外形模拟器也学不会的. 都说这个卡西欧58 ...