给个例子:

from optparse import OptionParser

msg_usage = 'usage: %prog [-W] windows size [-H] h island size [-I] input your map file [-O] output file name'

descr = '''Correct SNPs used for constructing genetic map...

Why default h_size is 6?

Fistly, for example, aaaaaaaaaaaaaaaabbbbbbbbbbbbbb will generate 6 h.

secondly, for examplem aaaaaaaaaaaaahhhhhhhhhhhhhhhhhhhhaaaaaaaaaa will generate at least 7 when num

of h larger than 9, when num of h is 5-8, no h will be generated.

Caveat: default was setted 6 above when the window size is 15.

The question still not settled yet is what the size of h will be seted when windows size is

not 15...
'''

optparser = OptionParser(usage = msg_usage, description = descr)

optparser.add_option('-W', '--win_size', dest = 'winsize', default = 15,

help = 'The size of sliding window, default is 15.')

optparser.add_option('-H', '--h_island', dest = 'hisland', default = 6,

help = 'The length of h_island you need to split, default\
 is 6')

optparser.add_option('-I', '--input', dest = 'inputfile',
                                 help = 'Input your file need to tackle')

optparser.add_option('-O', '--output', dest = 'outputfile',
                                 help = 'Your output file name')

options, args = optparser.parse_args()

if __name__ == "__main__":
    W = int(options.winsize)
    H = int(options.hisland)
    I = options.inputfile
    O = options.outputfile
    main(I, W, H, O)

by freemao

FAFU

free_mao@qq.com

OptionParser的更多相关文章

  1. Python中optionParser模块的使用方法[转]

    本文以实例形式较为详尽的讲述了Python中optionParser模块的使用方法,对于深入学习Python有很好的借鉴价值.分享给大家供大家参考之用.具体分析如下: 一般来说,Python中有两个内 ...

  2. Python OptionParser学习

    from optparse import OptionParser import sys def main(): p = OptionParser() p.add_option('-n','--nam ...

  3. 转-Python optionParser模块的使用方法

    Python  有两个内建的模块用于处理命令行参数: 一个是  getopt,<Deep in python>一书中也有提到,只能简单处理 命令行参数: 另一个是  optparse,它功 ...

  4. Python的参数模块OptionParser说明

    可以替代getopt的一个模块 from optparse import OptionParser #  生成一个实例 parser = OptionParser(usage="%prog ...

  5. python基础之 optparse.OptionParser

    optparse是专门用来在命令行添加选项的一个模块. 首先来看一段示例代码 from optparse import OptionParser MSG_USAGE = "myprog[ - ...

  6. python OptionParser模块

    Python中强大的选项处理模块. #!/usr/bin/python from optparse import OptionParser parser = OptionParser() parser ...

  7. python中的optionParser模块

    Python 有两个内建的模块用于处理命令行参数:一个是 getopt,<Deep in python>一书中也有提到,只能简单处理 命令行参数:另一个是 optparse,它功能强大,而 ...

  8. OptionParser命令参数介绍及使用

    使用optionParse解析命令行参数分以下几个步骤: 创建parser实例 使用add_option添加我们要处理的命令行参数 得到解析sys.argv后的options对象,查看用户的输入 代码 ...

  9. Python模块: 命令行解析optionparser

    Python 有两个内建的模块用于处理命令行参数:一个是 getopt,<Deep in python>一书中也有提到,只能简单处理 命令行参数:另一个是 optparse,它功能强大,而 ...

随机推荐

  1. 文本信息“welcome to java programming!”

    import javax.swing.JOptionPanepublic class welcome {public static void main(string[] arg){JOptionPan ...

  2. velocity插件 veloeclipse 支持eclipse4.4

    分享主页:http://pan.baidu.com/share/home?uk=2737650112#category/type=0 http://pan.baidu.com/s/12RSAy 感谢究 ...

  3. 佳佳的魔杖 (vijos 1283)

    题目大意: 一根树枝有N段,每一段有一个分数,可以选取一些不完全包含(可以相交)的区间,每次选取可以得到区间里所有数之和的分数. 求最大得分. 解题过程: 1.很明显的dp,默认选取区间的顺序是从左往 ...

  4. ARC 类型转换:显式转换 id 和 void *

    http://blog.csdn.net/chinahaerbin/article/details/9471419 /* * ARC有效时三种类型转换: */ 1.__bridge           ...

  5. Python 条件判断 循环

    age = 20 if age >= 18: print('your age is', age) print('adult') 根据Python的缩进规则,如果if语句判断是True,就把缩进的 ...

  6. 反Secure Boot垄断:兼谈如何在Windows 8电脑上安装Linux

    感谢HQSQ的投递一.自由软件基金会的呼吁上周,2012年将近结束的时候,自由软件基金会(FSF)发出呼吁,要求人们继续支持反Secure Boot垄断,希望签名者能达到5万人(目前是4万).我觉得, ...

  7. Processon 一款基于HTML5的在线作图工具

    CSDN的蒋涛不久前在微博上评价说ProcessOn是web版的visio,出于好奇私下对ProcessOn进行了一番研究.最后发现无论是在用户体验上,还是在技术上,ProcessOn都比微软的Vis ...

  8. IPAD2 5.1.1越狱后的屏幕不能自动旋转~~~

    己顶,出现这问题的原因是因为越狱安装了插件的原因.问题解决了,大家没有遇到类似的问题吗?问题出在大家都装了一个SBSettings的插件,解决办法就是在这个插件的ISO 5+ Notification ...

  9. iPhone 6/6 Plus国行版开卖当日抢购攻略

    在距离苹果首批发售时隔一个月也就是北京时间10月17日,苹果iPhone 6.iPhone 6 Plus终于也要在中国大陆开卖,众多国内用户终于有机会安排自己的购机计划.据不完全数据显示,目前iPho ...

  10. jQuery 元素遍历

    <!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charset="UTF-8"> <title> ...