10X genomics|cell base|in-vivo based|model organisms|SBI|

生命组学-药物基因组学

精准医学的内容有个人全基因组测序，移动可穿戴设备，它可以实时监测，深度学习模型预测疾病，对疾病预测做到有效、安全和可控。

药物基因组学就是研究疾病、化合物和靶点之间的关系，关键是找到能控制疾病的蛋白质结合腔。

遗传性疾病可通过家系研究，非遗传性疾病可通过GWS找突变位点，基于突变情况找治疗方法。SBI是结构生物学与药物分子设计与生信相结合的学科。

药物制造的传统问题是不知道潜在的药物靶标，针对某一症状而不是疾病，广泛测试得到小分子，最后再调整基团，效率极低。

现代的药物基因组学是通过疾病相关序列找到靶标，根据靶标设计小分子，在优化阶段，可使得药物小分子变小，避免毒副作用，毒副作用就是与其他蛋白结合并影响功能，提高准确性，准确性就是分子与靶标结合程度。

鉴定药物靶标的方法是首先通过查询gene expression差异、蛋白质组信息（该方法准确率更高），蛋白质调控网络，遗传家系研究来找寻线索。通过比对数据库中的相似序列找target gene或者调控网络，找到靶标后分子优化。分子优化要同时结合个体差异性和个体基因组差异性，此时可以利用reference genome，比如为亚洲人制药就使用亚洲人的reference genome，最后利用cell base、in-vivo based、model organisms方法来验证靶标。

个体基因组研究在sequence阶段使用30X最好，10X genomics有比较好的效果。

10X genomics：chromium segregates samples into individual microwells, where DNA in each well can be labeled with a unique barcode sequence. The process recovers information that is normally lost when scientists cut DNA into short fragments as part of sample preparation for the leading DNA sequencers