DICOM医学文件的解析
最近导师一直让做智慧医疗的一个项目,这里面涉及到DICOM格式的文件处理,在这里分享一下自己学到的关于DCM文件的一些内容。
DICOM
DICOM(DigitalImaging andCommunications inMedicine)是指医疗数字影像传输协定,是用于医学影像处理、储存、打印、传输的一组通用的标准协定。它包含了文件格式的定义以及网络通信协议。DICOM是以TCP/IP为基础的应用协定,并以TCP/IP联系各个系统。两个能接受DICOM格式的医疗仪器间,可通过DICOM格式的文件,来接收与交换影像及病人资料。
目前,DICOM被广泛应用于放射医疗,心血管成像以及放射诊疗诊断设备(X射线,CT,核磁共振,超声等),并且在眼科和牙科等其它医学领域得到越来越深入广泛的应用。
DICOM的存储格式
DICOM文件的整体结构如图2.1所示,先是128字节的导言部分(没有实际信息),接着是四个字节组成的"DICM"字符串,然后是若干DataElement元素依次排列直至文件结束。
DataElement的三种结构
DataElement是存储文件信息的主体,DataElement的总体结构如图2.2所示:
Tag由2 Byte的组号和2 Byte的元素号组成,VR是DICOM特有的值表示法,按照VR的类型以及是否显示VR,DataElement又分为三种具体的结构。
DataElement的Tag
DataElement的Tag用于标识Element的数据内容,比如病人信息、图像的格式等。Tag总共有2000多个,常用的主要组号:0002组描述设备通讯,0008组描述特征参数,0010组描述患者信息,0028组描述图像信息参数。
Dicom文件数据中所有dataElement从前到后按tag又可简单分段:文件元Tag,普通Tag,像素Tag。
1) 文件元Tag(组号+0000):不受传输语法影响,总是以显示VR方式表示,用于定义了传输语法;文件元Tag的dataElement,并没有多大的意义,它的值长度是整个组所有DataElement的字节长度,一个Dicom中可以只有一个文件元Tag,也可以有多个文件元Tag。
2) 普通Tag:除了文件元Tag和像素Tag,其余的都是普通Tag数据。包括:图像宽,高,数据传输格式,病人姓名,病人生日,病历医院,病历科室,病情的描述等等数据;
3) 像素Tag(7fe0,0010):表示DataElement存储的是病历的图像数据。
DataElement的VR
VR(Value Representation)值表示法是DICOM文件中特有的一种数据类型表示方式,规定了不同数据类型的含义及存储格,共有27种VR。在隐式VR的结构中会根据元素标识进行判断。Tag和VR是有对应关系的,每一种Tag其实是有一个固定的VR类型。
DataElement的数据长度
数据长度用两个字节存储了数据元素值的长度,所有DICOM数据元素都应该为偶数长度,若为奇数,追加空格或空NULL。当数据长度为0xFFFFFFFF时,数据一直到截止符为止。
现有的解析库
基于C++的DCMTK
基于Java的dcm4che
基于python的pydicom
基于C#的fo-dicom【本次项目基于fo-dicom实现】
通过在工程中引入它们可以避免软件开发人员去进行底层的解析工作,可为项目开发提高效率。
DICOM医学文件的解析的更多相关文章
- 基于cornerstone.js的dicom医学影像查看浏览功能
最近由于项目需求,需要医学影像.dcm文件的预览功能,功能完成后,基于原生Demo做一个开源分享. 心急的小伙伴可以先看如下基于原生js的全部代码: 一.全部代码 <!DOCTYPE html& ...
- Dicom格式文件解析器
转自:http://www.cnblogs.com/assassinx/archive/2013/01/09/dicomViewer.html Dicom全称是医学数字图像与通讯,这里讲的暂不涉及通讯 ...
- Dicom格式文件解析器[转]
Dicom格式文件解析器 Dicom全称是医学数字图像与通讯,这里讲的暂不涉及通讯那方面的问题 只讲*.dcm 也就是diocm格式文件的读取,读取本身是没啥难度的 无非就是字节码数据流处理.只不 ...
- DICOM医学图像处理:storescp.exe与storescu.exe源码剖析,学习C-STORE请求
转载:http://blog.csdn.net/zssureqh/article/details/39213817 背景: 上一篇专栏博文中针对PACS终端(或设备终端,如CT设备)与RIS系统之间w ...
- DICOM医学图像处理:DIMSE消息发送与接收“大同小异”之DCMTK fo-dicom mDCM
背景: 从DICOM网络传输一文开始,相继介绍了C-ECHO.C-FIND.C-STORE.C-MOVE等DIMSE-C服务的简单实现,博文中的代码给出的实例都是基于fo-dicom库来实现的,原因只 ...
- DICOM医学图像处理:Orthanc Plugin SDK实现WADO服务
背景: Orthanc是博主发现的一个很完美的DICOM和HTTP服务端开源软件,前几篇分别介绍了Orthanc的基本使用.Orthanc从0.8.0版本之后给出了Plugin SDK,通过该SDK可 ...
- DICOM医学图形处理:storescp.exe与storescu.exe源码剖析,学习C-STORE请求(续)
转载:http://blog.csdn.net/zssureqh/article/details/39237649 背景: 上一篇博文中,在对storescp工具源文件storescp.cc和DcmS ...
- dicom格式文件 界定标识符的处理
转自:http://www.cnblogs.com/assassinx/archive/2013/05/18/3084854.html 说到底无非几个事情 :1传输语法确定 2数据元素读取 3 7fe ...
- 自制C#版3DS文件的解析器并用SharpGL显示3DS模型
自制C#版3DS文件的解析器并用SharpGL显示3DS模型 我已经重写了3ds解析器,详情在此(http://www.cnblogs.com/bitzhuwei/p/CSharpGL-2-parse ...
随机推荐
- 风炫安全WEB安全学习第二十四节课 利用XSS钓鱼攻击
风炫安全WEB安全学习第二十四节课 利用XSS钓鱼攻击 XSS钓鱼攻击 HTTP Basic Authentication认证 大家在登录网站的时候,大部分时候是通过一个表单提交登录信息. 但是有时候 ...
- Netty学习之IO模型
目录 1.1 同步.异步.阻塞.非阻塞 同步 VS 异步 同步 异步 阻塞 VS 非阻塞 阻塞 非阻塞 举例 ...
- WebApi 中请求的 JSON 数据字段作为 POST 参数传入
使用 POST 方式请求 JSON 数据到服务器 WebAPI 接口时需要将 JSON 格式封装成数据模型接收参数.即使参数较少,每个接口仍然需要单独创建模型接收.下面方法实现了将 JSON 参数中的 ...
- 一个上传图片,预览图片的小demo
<!DOCTYPE html> <html> <head> <meta charset="UTF-8"> <title> ...
- LeetCode167 两数之和 II - 输入有序数组
给定一个已按照升序排列 的有序数组,找到两个数使得它们相加之和等于目标数. 函数应该返回这两个下标值 index1 和 index2,其中 index1 必须小于 index2. 说明: 返回的下标值 ...
- JPEG解码--(1)JPEG文件格式概览
由于懒和人的忘性,以前做的一些笔记再回过头看时又有些生疏了,我决定把一些内容整理出来,以供有需要的来参考. 了解的人知道其价值所在,不知道的人就弃之如废物吧. 本篇是JPEG解码系列的第一篇--JPE ...
- Docker构建Python Web环境
出于寻找Docker对Python相关项目部署的学习,找到腾讯课堂NEXT公开课中[Docker构建Python Web环境]的课程,本文对其进行内容梳理及知识点汇总. 该课程总计6小时左右,是个适合 ...
- zabbix 监控tomcat
zabbix 监控tomcat server端rpm -ivh jdk-8u20-linux-x64.rpmvi /etc/profileJAVA_HOME=/usr/java/jdk1.8.0_20 ...
- 【UML】Use Case Diagrams
文章目录 Use Case Diagrams Introduction Use case Diagram Use Case Diagrams - Actors Use Case Diagrams – ...
- 修改机器的hostname
vi /etc/sysconfig/network hostname=你想设置的主机名 不重启器的情况下使显示名称变成 hostname 主机名