bzoj1966: [Ahoi2005]VIRUS 病毒检测

Description

科学家们在Samuel星球上的探险仍在继续。非常幸运的，在Samuel星球的南极附近，探险机器人发现了一个巨大的冰湖！机器人在这个冰湖中搜集到了许多RNA片段运回了实验基地。科学家们经过几个昼夜的研究，发现这些RNA片段中有许多是未知的病毒！每个RNA片段都是由A、C、T、G组成的序列。科学家们也总结出了Samuel星球上的“病毒模版片段”。一个模版片段是由A、C、T、G的序列加上通配符 * 和 ? 来表示。其中 * 的意思是可以匹配上0个或任意多个字符，而 ? 的意思是匹配上任意一个字母。如果一个RNA片段能够和“病毒模版片段”相匹配，那么这个RNA片段就是未知的病毒。例如，假设“病毒模版片段”为A*G?C。RNA片段：AGTC，AGTGTC都是未知的病毒，而RNA片段AGTGC则不是病毒。由于，机器人搜集的这些RNA片段中除去病毒的其他部分都具有非常高的研究价值。所以科学家们希望能够分辨出其中哪些RNA片段不是病毒，并将不是病毒的RNA片段运回宇宙空间站继续进行研究。科学家将这项任务交给了小联。现在请你为小联编写程序统计哪些RNA片段不是病毒。

Input

第一行有一个字符串，由A、C、T、G、*、? 组成。表示“病毒模版片段”。“病毒模版片段”的长度不超过1000。第二行有一个整数N（0<N<500），表示机器人搜集到的RNA片段的数目。随后的N行，每一行有一个字符串，由A、C、T、G组成，表示一个RNA片段。每个RNA片段的长度不超过500。注意：“病毒模版片段”和RNA片段的长度都至少为1。

Output

只有一行输出，为整数M，即不是病毒的RNA片段的数目。

数据范围小所以n³能过。。

模板显然是一个简单的正则表达式，所以建一个NFA然后就可以O(n²)判定一个串是否匹配了，总复杂度还是 O(n³)

#include<cstdio>
#include<vector>
#include<cstring>
int n,ans=;
char s[];
int cid[],p=;
std::vector<int>nx[][];
bool d[],d1[];
void adde(int a,int b,int c){
    nx[a][b].push_back(c);
}
int main(){
    for(int i=;i<;i++)cid["ATGC#"[i]]=i;
    scanf("%s",s+);
    int l=strlen(s+),w=,w2=;
    s[]=s[++l]='#';
    for(int i=;i<=l;i++){
        int c=s[i],u=++p;
        if(c=='*'){
            if(!w2){
                for(c=;c<;c++)adde(w,c,u),adde(u,c,u);
                w2=w;w=u;
            }
        }else if(c=='?'){
            for(c=;c<;c++)adde(w,c,u);
            if(w2){
                for(c=;c<;c++)adde(w2,c,u);
                w2=;
            }
            w=u;
        }else{
            c=cid[c];
            adde(w,c,u);
            if(w2)adde(w2,c,u),w2=;
            w=u;
        }
    }
    scanf("%d",&n);
    while(n--){
        scanf("%s",s+);
        int len=strlen(s+);
        s[]=s[++len]='#';
        memset(d1,,);
        d1[]=;
        for(int i=;i<=len;i++){
            memcpy(d,d1,p+);
            memset(d1,,p+);
            int c=cid[s[i]];
            for(int j=;j<=p;j++)if(d[j]){
                for(int k=;k<nx[j][c].size();k++)d1[nx[j][c][k]]=;
            }
        }
        if(!d1[p])++ans;
    }
    printf("%d",ans);
    return ;
}