IDL 实现PCA算法
在多元统计分析中,主成分分析(Principal components analysis,PCA)是一种分析、简化数据集的技术。主成分分析经常用于减少数据集的维数,同时保持数据集中的对方差贡献最大的特征。【wiki】
在遥感影像解译与分类中,PCA是经常用到的降维滤噪处理技术。现在实现这个处理流程,便于熟悉和掌握IDL矩阵乘除运算操作。
- IDL 源码PRO PCA,DATA,EIGENVALUES = egValues,EIGENVECTORS = egvec,PERCENT = PERCENT,_EXTRA=EXTRA
- GET_SZ,data,ns=ns,nl=nl,nb=nb,type = type
- IF ISA(DATA,/NUMBER) AND NB GT 1 AND SIZE(DATA,/N_DIMENSIONS) EQ 3 THEN BEGIN
- DATA = TRANSPOSE(REFORM(DATA,NS*NL,NB))
- corr = correlate(DATA,/covariance)
- egValues = EIGENQL( corr, EIGENVECTORS=egvec,/DOUBLE ,/ABSOLUTE)
- absEgValue = ABS(egValues)
- PERCENT = absEgValue / TOTAL(absEgValue);
- ; EGVEC FORMAT
- ;EGVEC = [ EGVEC1
- ; EGVEC2
- ; EGVEC3
- ; ...
- DATA = TEMPORARY(REFORM(TRANSPOSE(egvec) ## TRANSPOSE(DATA),NS,NL,NB))
- ENDIF
- END
- ;---------------------------------------
- pro GET_SZ,data,ns=ns,nl=nl,nb=nb,type = type
- sz = size(data)
- type = sz[0] ge 1 ? sz[-2] : 0
- ns = sz[0] ge 1 ? sz[1] : 1
- nl = sz[0] ge 2 ? sz[2] : 1
- nb = sz[0] ge 3 ? sz[3] : 1
- end
处理流程:
获得矩阵 行NL、列NS、波段数nb。ns ,number of samples;nl,number of lines;nb,number of bands。三种缩写借鉴自Envi。
矩阵变形,将3维变成2维,nb行,ns*nl列。也就是说将每一个波段的二维图像矩阵压缩成一维数组。因为求相关系数的函数correlate不支持3维矩阵。
对各波段之间的相关系数矩阵求特征值和对应的特征向量。
如果有需要,可以计算各主成分方差的比重。
特征向量左乘原三维矩阵得到主成分结果。转置、二维变三维都是中间过程,函数用法可以查帮助,在此是次要细节略过。
说明:
如此,输入的三维矩阵变量data,运算完毕size不变,内容却成了各主成分。这就是IDL procedure的典型用法。若要一次处理多个变量a、b、c、d,只需定义一个pro,将abcd作为参数传入,运算完毕abcd值就都改变了。如果采用函数来return计算结果则需要定义4个function。
function多用在连续调用,如a=foo1(foo2(foo3(“”)));这种情形。
本计算与Envi菜单的PCA分析结果略有差别。因为相关系数矩阵计算结果不一致,原因暂时我也不清楚,希望大牛可以告知。不过没有太大关系,本文主要是熟悉IDL的编程,PCA的运算过程。只要流程正确、结果有效,在遥感影像解译与分类中发挥作用即可。Envi可能有预处理(如归一化),没必要一定要向它看齐。
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