vcf-query:

通过 vcf-query 提取DP (reads depth).

~/zengs/Tools/vcftools/perl/vcf-query -f '%CHROM\t%POS\t%REF\t%ALT\t%INFO/DP\n' my.vcf | awk '{if($1==1) print  $1"\t"$2"\t"$3"\t"$4"\t"$5 }'  > my.vcf.DP

　　

vcf-tools 笔记的更多相关文章

  1. Tools - 笔记记录方法Markdown

    Markdown 简介 轻量级标记语言,使用易读易写的纯文本格式和类似HTML的标记语法来编写具有一定的格式的文档. 语法简洁直观,易学易用,可以使用任何喜爱的文本编辑器来阅读和写作. 可精- 确控制 ...

  2. Learning ROS for Robotics Programming Second Edition学习笔记(二) indigo tools

    中文译著已经出版,详情请参考:http://blog.csdn.net/ZhangRelay/article/category/6506865 Learning ROS for Robotics Pr ...

  3. VMware workstation运维实践系列博客导航

    第一章:VMware workstation虚拟化1.1 VMware workstation计算网络存储介绍1.2 VMware workstation其他功能特性介绍1.3 VMware work ...

  4. ROCKETMQ源码分析笔记1：tools

    rocketmq源码解析笔记 大家好,先安利一下自己,本人男,35岁,已婚.目前就职于小资生活(北京),职位是开发总监. 姓名DaneBrown 好了.我保证本文绝不会太监!转载时请附上以上安利信息. ...

  5. Chrome development tools学习笔记(5)

    调试JavaScript 随着如今JavaScript应用的越来越广泛,在面对前端工作的时候,开发人员须要强大的调试工具来高速有效地解决这个问题.我们文章的主角,Chrome DevTools就提供了 ...

  6. Chrome development tools学习笔记(3)

    (上次DOM的部分做了些补充,欢迎查看Chrome development tools学习笔记(2)) 利用DevTools Elements工具来调试页面样式 CSS(Cascading Style ...

  7. Tools - 为知笔记

    为知笔记 Homepage Web登陆 帮助支持 功能 特色功能 发布到blog 便携版制作 模板 如何建立模板 下载为知笔记模版 Markdown http://www.wiz.cn/markdow ...

  8. 【Tools】Pro Git 一二章读书笔记

    记得知乎以前有个问题说:如果用一天的时间学习一门技能,选什么好?里面有个说学会Git是个很不错选择,今天就抽时间感受下Git的魅力吧.   Pro Git (Scott Chacon) 读书笔记:   ...

  9. 【转】树莓派学习笔记——I2C Tools 学习笔记

    原文网址:http://blog.csdn.net/xukai871105/article/details/15029843 1.安装     I2C驱动载入和速率修改请查看博文[树莓派学习笔记——I ...

  10. RH033读书笔记(9)-Lab 10 Understanding the Configuration Tools

    Lab 10 Understanding the Configuration Tools Sequence 1: Configuring the Network with system-config- ...

随机推荐

  1. UVa 12186 - Another Crisis（树形DP）

    链接: https://uva.onlinejudge.org/index.php?option=com_onlinejudge&Itemid=8&page=show_problem& ...

  2. tmux分屏

    网上很多教程: 新手教程: tmux进入 ctrl + b 命令 % 纵向分屏 命令 方向键 切换 https://lukaszwrobel.pl/blog/tmux-tutorial-split-t ...

  3. 17、配置嵌入式servlet容器（1）

    SpringBoot默认使用Tomcat作为嵌入式的Servlet容器 1).如何定制和修改Servlet容器的相关配置         1.修改和server有关的配置            (Se ...

  4. MyBatis（7）高级查询

    本次全部学习内容:MyBatisLearning 高级查询:   对于整体的工程是时候增加一点文件了: 具体用到那个类再去说明类的内容   一对一查询: 1.resultType进行实现: 执行的sq ...

  5. Web Pages

    什么是Web Pages 1.WebPages是三种创建ASP.NET网站或Web应用程序模式中的一种 2.而其两种编程模式是MVC(Model-View-Controller,模型-视图-控制器)和 ...

  6. 在EF Core里面如何使用以前EntityFramework的DbContext.Database.SqlQuery<SomeModel>自定义查询

    问: With Entity Framework Core removing dbData.Database.SqlQuery<SomeModel> I can't find a solu ...

  7. 对IIS7经典模式和集成模式的理解(转载)

    从IIS6新增应用程序池的概念,到现在IIS7,对HTTP请求处理功能已经越来越精确化和不断改善,IIS7应用程序池新增了经典模式和集成模式可供选择,不管官方还是一些书籍或文章都有介绍,但多数过于官方 ...

  8. oracle cascade用法

    原文地址:https://www.cnblogs.com/moyijian/p/9940323.html#4111551 级联删除,比如你删除某个表的时候后面加这个关键字,会在删除这个表的同时删除和该 ...

  9. Web—06-JavaScript

    JavaScript介绍 JavaScript是运行在浏览器端的脚步语言,JavaScript主要解决的是前端与用户交互的问题,包括使用交互与数据交互. JavaScript是浏览器解释执行的,前端脚 ...

  10. 若是将Map作为Key,存入Redis,该如何操作？

    1.先封装HashMap Map<String,Object> map=new HashMap<String,Object>(); map.put("name&quo ...