package com.excellence.splitsentence;
import java.net.UnknownHostException;
import java.util.ArrayList;
import java.util.Arrays;
import java.util.Collections;
import java.util.List;
import org.jblas.ComplexDoubleMatrix;
import org.jblas.ComplexFloatMatrix;
import org.jblas.DoubleMatrix;
import org.jblas.Eigen;
import org.jblas.FloatMatrix; import com.mongodb.BasicDBList;
import com.mongodb.DB;
import com.mongodb.DBCollection;
import com.mongodb.DBCursor;
import com.mongodb.MongoClient;
import com.mongodb.MongoCredential;
import com.mongodb.ServerAddress;
public class PCA {
/**
* Reduce matrix dimension 减少矩阵维度
* @param source 源矩阵
* @param dimension 目标维度
* @return Target matrix 返回目标矩阵
*/ public static FloatMatrix dimensionReduction(FloatMatrix source, int dimension) {
//C=X*X^t/m 矩阵*矩阵^异或/列数
FloatMatrix covMatrix = source.mmul(source.transpose()).div(source.columns);
ComplexFloatMatrix eigVal = Eigen.eigenvalues(covMatrix);
ComplexFloatMatrix[] eigVectorsVal = Eigen.eigenvectors(covMatrix);
ComplexFloatMatrix eigVectors = eigVectorsVal[0];
//通过特征值将符号向量从大到小排序
List<PCABean> beans = new ArrayList<PCA.PCABean>();
for (int i = 0; i < eigVectors.columns; i++) {
beans.add(new PCABean(eigVal.get(i).real(), eigVectors.getColumn(i)));
}
Collections.sort(beans);
FloatMatrix newVec = new FloatMatrix(dimension, beans.get(0).vector.rows);
for (int i = 0; i < dimension; i++) {
ComplexFloatMatrix dm = beans.get(i).vector;
FloatMatrix real = dm.getReal();
newVec.putRow(i, real);
}
return newVec.mmul(source);
}
static class PCABean implements Comparable<PCABean> {
float eigenValue;
ComplexFloatMatrix vector;
public PCABean(Float eigenValue, ComplexFloatMatrix vector) {
super();
this.eigenValue = eigenValue;
this.vector = vector;
}
@Override
public int compareTo(PCABean o) {
return Float.compare(o.eigenValue, eigenValue);
}
@Override
public String toString() {
return "PCABean [eigenValue=" + eigenValue + ", vector=" + vector + "]";
}
}
} 如何调用?

float[] vector = docvector.getElementArray();
FloatMatrix d = new FloatMatrix(vector);

FloatMatrix result = PCA.dimensionReduction(d, 10);

 

Java中实现PCA降维的更多相关文章

  1. [综] PCA降维

    http://blog.json.tw/using-matlab-implementing-pca-dimension-reduction 設有m筆資料, 每筆資料皆為n維, 如此可將他們視為一個mx ...

  2. 关于PCA降维中遇到的python问题小结

    由于论文需要,开始逐渐的学习CNN关于文本抽取的问题,由于语言功底不好,所以在学习中难免会有很多函数不会用的情况..... ̄へ ̄ 主要是我自己的原因,但是我更多的把语言当成是一个工具,需要的时候查找就 ...

  3. 机器学习公开课笔记(8):k-means聚类和PCA降维

    K-Means算法 非监督式学习对一组无标签的数据试图发现其内在的结构,主要用途包括: 市场划分(Market Segmentation) 社交网络分析(Social Network Analysis ...

  4. Python中T-SNE实现降维

    Python中T-SNE实现降维 from sklearn.manifold import TSNE from sklearn.datasets import load_iris from sklea ...

  5. 在SCIKIT中做PCA 逆运算 -- 新旧特征转换

    PCA(Principal Component Analysis)是一种常用的数据分析方法.PCA通过线性变换将原始数据变换为一组各维度线性无关的表示,可用于提取数据的主要特征分量,常用于高维数据的降 ...

  6. Python机器学习笔记 使用scikit-learn工具进行PCA降维

    之前总结过关于PCA的知识:深入学习主成分分析(PCA)算法原理.这里打算再写一篇笔记,总结一下如何使用scikit-learn工具来进行PCA降维. 在数据处理中,经常会遇到特征维度比样本数量多得多 ...

  7. PCA降维—降维后样本维度大小

    之前对PCA的原理挺熟悉,但一直没有真正使用过.最近在做降维,实际用到了PCA方法对样本特征进行降维,但在实践过程中遇到了降维后样本维数大小限制问题. MATLAB自带PCA函数:[coeff, sc ...

  8. 一步步教你轻松学主成分分析PCA降维算法

    一步步教你轻松学主成分分析PCA降维算法 (白宁超 2018年10月22日10:14:18) 摘要:主成分分析(英语:Principal components analysis,PCA)是一种分析.简 ...

  9. 【资料收集】PCA降维

    重点整理: PCA(Principal Components Analysis)即主成分分析,是图像处理中经常用到的降维方法 1.原始数据: 假定数据是二维的 x=[2.5, 0.5, 2.2, 1. ...

随机推荐

  1. HBase基础概念

    定义 非关系型分布式列式数据库,支持大数据量查询(百万,上亿行) 概要 数据存储:HDFS 数据计算:MapReduce/Spark 服务协调:Zookeeper 特征 列式存储(列只有一种类型byt ...

  2. RNA-seq简单处理流程

    RNA_seq pipline RNA_seq pipline PeRl 2018年3月7日 首先说明一下我做RNA-seq处理流程的文件树格式: RNA-seq/ data/ GRCh38.gtf ...

  3. 20155220 吴思其 《网络攻防》 Exp1 PC平台逆向破解(5)M

    20155220 <网络攻防> Exp1 PC平台逆向破解(5)M 实践内容 通过对实践对象--20155220pwn1的linux可执行文件的修改或输入,完成以下三块: 手工修改可执行文 ...

  4. [HNOI2012]永无乡 线段树合并

    [HNOI2012]永无乡 LG传送门 线段树合并练手题,写这篇博客只是为了给我的这篇文章找个板子题. 并查集维护连通性,对于不在同一个连通块内的合并操作每次直接合并两颗线段树,复杂度\(O(n \l ...

  5. Spring的IOC理解(转载)

    学习过Spring框架的人一定都会听过Spring的IoC(控制反转) .DI(依赖注入)这两个概念,对于初学Spring的人来说,总觉得IoC .DI这两个概念是模糊不清的,是很难理解的,今天和大家 ...

  6. jstl c:if 不能判断成功的问题

    这是因为test里不能直接用 ${value}=='字符串' 的方式来进行判断比较,所以只能这样写 ${value == '字符串'} ,这样就能判断了

  7. jsp手动分页

    注意: sql语句要写对,jsp显示 List 时的 item的字段名要写对 这里 where uid 要放在前面才能成功执行,否则会报错 , 在写items的时候,如果controller里面已经写 ...

  8. jsp编译原理

    jsp运行时都要先转换成servlet,使用tomcat时会在tomcat安装目录下的work生成一系列的运行的项目文件夹,文件下面含有.java文件和编译后的.class文件.jsp最终转化为ser ...

  9. Zabbix实战-简易教程--WEB类--Nginx

    一.开启Nginx status状态 1.在默认主机里面加上location添加ngx_status 如下操作: server { listen 127.0.0.1:8080; server_name ...

  10. Python学习过程笔记整理(三)

    函数 -函数使用 -函数需要先定义,定义不会执行函数 -使用函数,俗称调用 -定义函数 -格式:def 函数名称(参数=默认值):,函数名称不能用大驼峰,参数可以没有 -调用函数 -格式:函数名(参数 ...