目前最新版本为2.3.2,网址为:https://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/bowtie2/2.3.2

安装分为简单的下载可执行文件和源编译安装。

如上图所示,bowtie2-2.3.2-source.zip为源代码,需要用gmake安装,此时,如果系统版本低,没有libTBB的话,可以选择不使用这个库编译

命令是:

  unzip bowtie2-2.3.2-source.zip 解压安装包

  gmake NO_TBB=1 编译安装

对于下面两个,只需解压缩即可使用:

  unzip bowtie2-2.3.2-linux-x86_64.zip

  unzip bowtie2-2.3.2-legacy-linux-x86_64.zip

随后添加环境变量:

  #bowtie2

  export PATH=/home/user/Programs/bowtie2-2.3.2-***:$PATH

即可使用,如果使用预编译版本,运行bowtie2命令时出错,则需要使用不使用TBB库的源编译安装,或者使用legacy版本。

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