http://daler.github.io/pybedtools/

用个下面这个

>>> fn = pybedtools.example_filename('test.fa')

>>> BedTool.seq('chr1:2-10', fn)

'GATGAGTCT'

>>> BedTool.seq(('chr1', 1, 10), fn)

'GATGAGTCT'

pybedtools --bedtools的python包的更多相关文章

  1. 离线pip下载Python包

    离线pip下载Python包   这几天搞Windows离线断网环境下安装Python包,配置环境,各种坑!做个记录,供以后查询吧.      # 生产环境  windows xp# python 2 ...

  2. 【转】linux和windows下安装python集成开发环境及其python包

    本系列分为两篇: 1.[转]windows和linux中搭建python集成开发环境IDE 2.[转]linux和windows下安装python集成开发环境及其python包 3.windows和l ...

  3. RobotFramework中加载自定义python包中的library（一个py文件中有多个类）

    结构如下: appsdk\ appsdk.py(这里面有多个类,包括appsdk,appsdksync等类) __init__.py ... ① 有个appsdk的文件夹(符合python包的定义) ...

  4. centos 7 下安装numpy、scipy等python包

    本文适用于刚入门的小白,欢迎大牛们批评指正. 因为要开始数据分析,而python又不像R和matlab那么简洁.需要安装的包很多~ 网上找了好多牛人博客,想在centos7下安装numpy,scipy ...

  5. python 包管理工具

    python 包管理工具 Python当前的包管理工具链是 easy_install/pip + distribute/setuptools + distutils,显得较为混乱. 而将来的工具链组合 ...

  6. Python 包管理工具解惑

    Python 包管理工具解惑 本文链接:http://zengrong.net/post/2169.htm python packaging 一.困惑 作为一个 Python 初学者,我在包管理上感到 ...

  7. Python 包的相对导入讲解

    [Python 包的相对导入讲解] 参考:http://www.dai3.com/python-import.html

  8. 转: CentOS 6.4安装pip，CentOS安装python包管理安装工具pip的方法

    from: http://www.linuxde.net/2014/05/15576.html CentOS 6.4安装pip,CentOS安装python包管理安装工具pip的方法 2014/05/ ...

  9. 纯Python包发布setup脚本编写示例

    如果你有多个模块需要发布,而它们又存在于多个包中,那么指定整个包比指定模块可能要容易地多.即使你的模块并不在一个包内,这种做法也行的通:你可以告诉Distutils从根包(root package)处 ...

随机推荐

  1. Egret Wing4.1.0 断点调试

    一  双击代码行号左侧打断点 二 选择调试视图工具栏. 三  点击开始调试 1 wing内置播放器调试 选择此项进行调试会打开Egret内置播放器,我这里这个版本该选项无法进行断点... 2 使用本机 ...

  2. 知道WCF的地址用工厂通道方式快速调用WCF

    知道WCF的地址用工厂通道方式快速调用WCF  1 using System;  2 using System.ServiceModel;  3 using System.ServiceModel.D ...

  3. Linux定时对日志批量打包Shell脚本及定时任务crontab 详细用法

    一.需求背景     因此次项目的生产环境中部署了多套系统,每天会产生大量的日志(数百GB的量),侵占了服务器宝贵的存储资源空间.为了有效缓解服务器存储压力,考虑通过Linux的Shell脚本结合cr ...

  4. Cisco配置发送日志到日志服务器

    Cisco配置发送日志到日志服务器logging 172.16.6.22logging onlogging trap 7  //指定日志消息的级别 (0:紧急(Emergencies) 1:告警(Al ...

  5. poj1722 SUBTRACT【线性DP】

    SUBTRACT Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 10000K Total Submissions: 2037   Accepted: 901   Special ...

  6. sql 中如何将返回的记录某一条置顶

    将table1中id 为2的记录置顶select * from table1order by case when id='2' then 0 else 1 end 例子:将已发布的置顶,status  ...

  7. 基于linux-2.6.35的class_create(),device_create解析

    基于linux-2.6.35的class_create(),device_create解析 作者:苗老师,华清远见嵌入式学院讲师. 从linux内核2.6的某个版本之后,devfs不复存在,udev成 ...

  8. Mongo副本集的配置以及php node.js连接使用副本集

    最近弄了下mongodb的副本集, 首先说下没有认证情况的副本集,相对比较简单,因为环境有限,我在同一台服务器上做了模拟. --rest参数是打开web监控页面,比如我们这里监听37017端口,则打开 ...

  9. Python开发【Django】：组合搜索、JSONP、XSS过滤

    组合搜索 做博客后台时,需要根据文章的类型做不同的检索 1.简单实现 关联文件: from django.conf.urls import url from . import views urlpat ...

  10. AC自动机板子题/AC自动机学习笔记!

    想知道484每个萌新oier在最初知道AC自动机的时候都会理解为自动AC稽什么的,,,反正我记得我当初刚知道这个东西的时候,我以为是什么神仙东西,,,(好趴虽然确实是个对菜菜灵巧比较难理解的神仙知识点 ...