BZOJ1966: [Ahoi2005]VIRUS 病毒检测 Trie+搜索
Description
科学家们在Samuel星球上的探险仍在继续。非常幸运的,在Samuel星球的南极附近,探险机器人发现了一个巨大的冰湖!机器人在这个冰湖中搜集到了许多RNA片段运回了实验基地。科学家们经过几个昼夜的研究,发现这些RNA片段中有许多是未知的病毒!每个RNA片段都是由A、C、T、G组成的序列。科学家们也总结出了Samuel星球上的“病毒模版片段”。一个模版片段是由A、C、T、G的序列加上通配符 * 和 ? 来表示。其中 * 的意思是可以匹配上0个或任意多个字符,而 ? 的意思是匹配上任意一个字母。如果一个RNA片段能够和“病毒模版片段”相匹配,那么这个RNA片段就是未知的病毒。例如,假设“病毒模版片段”为A*G?C。RNA片段:AGTC,AGTGTC都是未知的病毒,而RNA片段AGTGC则不是病毒。由于,机器人搜集的这些RNA片段中除去病毒的其他部分都具有非常高的研究价值。所以科学家们希望能够分辨出其中哪些RNA片段不是病毒,并将不是病毒的RNA片段运回宇宙空间站继续进行研究。科学家将这项任务交给了小联。现在请你为小联编写程序统计哪些RNA片段不是病毒。
Input
第一行有一个字符串,由A、C、T、G、*、? 组成。表示“病毒模版片段”。“病毒模版片段”的长度不超过1000。第二行有一个整数N(0<N<500),表示机器人搜集到的RNA片段的数目。随后的N行,每一行有一个字符串,由A、C、T、G组成,表示一个RNA片段。每个RNA片段的长度不超过500。注意:“病毒模版片段”和RNA片段的长度都至少为1。
Output
只有一行输出,为整数M,即不是病毒的RNA片段的数目。
Sample Input
3
AGTC
AGTGTC
AGTGC
Sample Output
HINT
输入中的RNA片段AGTGC不是病毒。
Solution
把所有RNA片段扔到trie里面。然后用病毒串在trie内搜索来匹配,用bitset记忆化不然会TLE。
然后要注意bitset大小,不然会MLE
#include <bits/stdc++.h> #define ll long long
#define inf 0x3f3f3f3f
#define il inline namespace io { #define in(a) a=read()
#define out(a) write(a)
#define outn(a) out(a),putchar('\n') #define I_int int
inline I_int read() {
I_int x = , f = ; char c = getchar() ;
while( c < '' || c > '' ) { if( c == '-' ) f = - ; c = getchar() ; }
while( c >= '' && c <= '' ) { x = x * + c - '' ; c = getchar() ; }
return x * f ;
}
char F[ ] ;
inline void write( I_int x ) {
if( x == ) { putchar( '' ) ; return ; }
I_int tmp = x > ? x : -x ;
if( x < ) putchar( '-' ) ;
int cnt = ;
while( tmp > ) {
F[ cnt ++ ] = tmp % + '' ;
tmp /= ;
}
while( cnt > ) putchar( F[ -- cnt ] ) ;
}
#undef I_int }
using namespace io ; #define N 610 int ans = , n , Len , ch[][] , sz , val[] ;
char a[] ;
std::bitset<> f[] ; int idx(char c) {
if(c == 'A') return ;
if(c == 'C') return ;
if(c == 'T') return ;
if(c == 'G') return ;
if(c == '?') return ;
if(c == '*') return ;
} void insert(char *s) {
int len = strlen(s) , u = ;
for(int i = ; i < len ; i ++) {
int c = idx(s[i]) ;
if(!ch[u][c]) ch[u][c] = ++ sz ;
u = ch[u][c] ;
}
val[u] ++ ;
} void dfs(int u , int now) {
if(now == Len+) {
ans += val[u] ;
val[u] = ;
return ;
}
if(f[u][now]) return ;
f[u][now] = ;
int c = idx(a[now]) ;
if(c <= ) {
if(ch[u][c]) dfs(ch[u][c] , now + ) ;
} else {
if(c == ) {
for(int i = ; i <= ; i ++)
if(ch[u][i]) dfs(ch[u][i] , now + ) ;
} else {
dfs(u , now + ) ;
for(int i = ; i <= ; i ++)
if(ch[u][i]) dfs(ch[u][i] , now) , dfs(ch[u][i] , now + );
}
}
} int main() {
scanf( "%s" , a + ) ;
Len = strlen(a + ) ;
n = read() ;
for(int i = ; i <= n ; i ++) {
char s[] ;
scanf("%s" , s) ;
insert(s) ;
}
dfs( , ) ;
outn(n - ans) ;
return ;
}
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