Java读取mat文件

概述

使用ujmp中的jmatio模块读取.mat文件到java程序中。

其实，ujmp主要是在模块core中实现了矩阵运算，其余模块都是复用了已有的开源库。模块jmatio是复用了已有的JMatIo，对这个读取mat文件到java程序的库做了一层封装。从ujmp的官网(https://ujmp.org/)下载ujmp的jar包，但是这一个jar包并不能读取mat文件(虽然jar包内有jmatio模块)，还需要下载一个JMatIo的jar包(http://pan.baidu.com/s/1nuMMqvB)。将两个jar包都加入到工程中才可以从mat文件中顺利读取数据到java程序中。

添加jar包到工程

在创建的工程中新建一个lib文件夹，将以上两个jar包拷贝到此文件夹中，必须要拷贝到项目中。比如，我之前是将两个jar包放在桌面上，但是当把jar包删除或移动之后，程序就不能运行了，很简单的道理。

接下来就是将两个jar包添加到工程中，以便在程序中使用这两个包中定义的类。

读取mat文件的代码

 /**
  * Created by hfz on 2015/12/22.
  */
 import org.ujmp.jmatio.ImportMatrixMAT;
 import org.ujmp.core.Matrix;
 import java.io.File;
 import java.io.IOException;
 public class test{
     public  static void main(String[] args)throws IOException{
         //相对路径的根目录是当前工程的目录（C:\Users\hfz\Desktop\test）。另外相对路径的起始处无“/”
         ImportMatrixMAT test=new ImportMatrixMAT();
         File file=new File("data/A.mat");
         Matrix testMatrix=test.fromFile(file);
         testMatrix.showGUI();
         System.out.println("ss");
     }

 }

另外一种更简单的方式

更简单的方式就是直接使用jmatio库从.mat文件读取数据到内存中，并将其转化为二维数组的形式，代码如下：

import com.jmatio.io.MatFileReader;
import com.jmatio.types.MLArray;
import com.jmatio.types.MLDouble;
 MatFileReader read = new MatFileReader("data/totalDataSet.mat");
MLArray mlArray=read.getMLArray("img");//mat存储的就是img矩阵变量的内容
MLDouble d=(MLDouble)mlArray;
double[][] matrix=(d.getArray());//只有jmatio v0.2版本中才有d.getArray方法

jmatio参考文档：http://www.mathworks.com/matlabcentral/mlc-downloads/downloads/submissions/10759/versions/1/previews/doc/overview-summary.html

jmatio下载：http://pan.baidu.com/s/1nuMMqvB

参考：

http://www.programcreek.com/java-api-examples/index.php?api=com.jmatio.io.MatFileReader

https://www.kaggle.com/c/decoding-the-human-brain/forums/t/7862/using-jmatio/65560

http://blog.madhukaraphatak.com/matfile-to-rdd/