地址:http://poj.org/problem?id=2778

题目:

DNA Sequence
Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536K
Total Submissions: 15453   Accepted: 5964

Description

It's well known that DNA Sequence is a sequence only contains A, C, T and G, and it's very useful to analyze a segment of DNA Sequence,For example, if a animal's DNA sequence contains segment ATC then it may mean that the animal may have a genetic disease. Until now scientists have found several those segments, the problem is how many kinds of DNA sequences of a species don't contain those segments.

Suppose that DNA sequences of a species is a sequence that consist of A, C, T and G,and the length of sequences is a given integer n.

Input

First line contains two integer m (0 <= m <= 10), n (1 <= n <=2000000000). Here, m is the number of genetic disease segment, and n is the length of sequences.

Next m lines each line contain a DNA genetic disease segment, and length of these segments is not larger than 10.

Output

An integer, the number of DNA sequences, mod 100000.

Sample Input

4 3
AT
AC
AG
AA

Sample Output

36

思路: 用病毒源建立ac自动机,然后所有节点可看做状态转移图。呃,懒得画图了,你们可以百度下。然后根据转移图建立矩阵,之后快速幂即可。
  之前一直忘了把end【x】为1的节点的所有子节点的end标记为1,wa的不省人事。
 #include <queue>
#include <cstring>
#include <cstdio>
using namespace std; const long long mod=1e5;
struct MM
{
int r,c;
long long mx[][];
MM(int rr=,int cc=){r=rr,c=cc;}
friend MM operator *(MM ta,MM tb)
{
MM tc(ta.r,tb.c);
for(int i=;i<tc.r;i++)
for(int j=;j<tc.c;j++)
{
tc.mx[i][j]=;
for(int k=;k<tb.r;k++)
tc.mx[i][j]=(tc.mx[i][j]+ta.mx[i][k]*tb.mx[k][j])%mod;
}
return tc;
}
friend MM operator ^(MM ta,int num)
{
MM ret(ta.r,ta.c); //r==c
memset(ret.mx,,sizeof ret.mx);
for(int i=;i<ta.r;i++) ret.mx[i][i]=; //µ¥Î»¾ØÕó
while(num)
{
if(num&)
ret=ta*ret;
num>>=;
ta=ta*ta;
}
return ret;
}
}mm;
struct AC_auto
{
const static int LetterSize = ;
const static int TrieSize = *; int tot,root,fail[TrieSize],end[TrieSize],next[TrieSize][LetterSize]; int newnode(void)
{
memset(next[tot],-,sizeof(next[tot]));
end[tot] = ;
return tot++;
} void init(void)
{
tot = ;
root = newnode();
} int getidx(char x)
{
if(x=='A')return ;
else if(x=='C')return ;
else if(x=='G')return ;
else return ;
} void insert(char *ss)
{
int len = strlen(ss);
int now = root;
for(int i = ; i < len; i++)
{
int idx = getidx(ss[i]);
if(next[now][idx] == -)
next[now][idx] = newnode();
now = next[now][idx];
}
end[now]=;
} void build(void)
{
queue<int>Q;
fail[root] = root;
for(int i = ; i < LetterSize; i++)
if(next[root][i] == -)
next[root][i] = root;
else
fail[next[root][i]] = root,Q.push(next[root][i]);
while(Q.size())
{
int now = Q.front();Q.pop();
if(end[fail[now]])end[now]=;
for(int i = ; i < LetterSize; i++)
if(next[now][i] == -) next[now][i] = next[fail[now]][i];
else
fail[next[now][i]] = next[fail[now]][i],Q.push(next[now][i]);
}
} int buildmm(int n)
{
int cnt = ;
mm.c=mm.r=tot;
for(int i = ; i < tot; i++)
for(int j = ; j < ; j++)
if(!end[next[i][j]])
mm.mx[i][next[i][j]]++;
mm=mm ^ n;
for(int i = ; i < tot; i++)
cnt = (cnt + mm.mx[][i]) % mod;
return cnt;
}
}; AC_auto ac;
char sa[];
int main(void)
{
int n,m;
scanf("%d%d",&n,&m);
ac.init();
for(int i=;i<=n;i++)
scanf("%s",sa),ac.insert(sa);
ac.build();
printf("%d\n",ac.buildmm(m));
return ;
}

poj 2278 DNASequnce AC自动机的更多相关文章

  1. POJ 1625 Censored!(AC自动机+DP+高精度)

    Censored! Time Limit: 5000MS   Memory Limit: 10000K Total Submissions: 6956   Accepted: 1887 Descrip ...

  2. poj 1625 (AC自动机好模版,大数好模版)

    题目 给n个字母,构成长度为m的串,总共有n^m种.给p个字符串,问n^m种字符串中不包含(不是子串)这p个字符串的个数. 将p个不能包含的字符串建立AC自动机,每个结点用val值来标记以当前节点为后 ...

  3. DNA Sequence - POJ 2778(AC自动机+矩阵乘法)

    题目大意:DNA序列是有 ATGC 组成的,现在知道一些动物的遗传片段有害的,那么如果给出这些有害的片段,能否求出来所有长度为 N 的基因中有多少是不包含这些有害片段的.   分析:也是断断续续做了一 ...

  4. DNA Sequence POJ - 2778 (ac自动机 + 快速幂)

    题意: 给出患病的DNA序列,问序列长度为n的,且不包含患病的DNA序列有多少种 解析: 以给出的患病DNA序列建trie树  患病结点要用flag标记 对于长度为n的序列 位置i有四种 情况A  C ...

  5. POJ 1625 Censored! [AC自动机 高精度]

    Censored! Time Limit: 5000MS   Memory Limit: 10000K Total Submissions: 9793   Accepted: 2686 Descrip ...

  6. 【原创】AC自动机小结

    有了KMP和Trie的基础,就可以学习神奇的AC自动机了.AC自动机其实就是在Trie树上实现KMP,可以完成多模式串的匹配.           AC自动机 其实 就是创建了一个状态的转移图,思想很 ...

  7. 转自kuangbin的AC自动机(赛前最后一博)

    有了KMP和Trie的基础,就可以学习神奇的AC自动机了.AC自动机其实就是在Trie树上实现KMP,可以完成多模式串的匹配.           AC自动机 其实 就是创建了一个状态的转移图,思想很 ...

  8. HDU 3695 / POJ 3987 Computer Virus on Planet Pandora(AC自动机)(2010 Asia Fuzhou Regional Contest)

    Description Aliens on planet Pandora also write computer programs like us. Their programs only consi ...

  9. POJ 2778 DNA Sequence(AC自动机+矩阵加速)

    DNA Sequence Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 65536K Total Submissions: 9899   Accepted: 3717 Desc ...

随机推荐

  1. Ajax中get和post使用问题

    使用get遇到的问题: 1.问题一. 缓存:当每次访问的url相同,客户端直接读取本地缓存里面的内容,即使后台数据变化前台也不会有变化: 解决方法:在?后面链接一个num=[随机数Math.rando ...

  2. 未找到与约束ContractName Microsoft.VisualStudio.Text.ITextDocumentFactoryService... 匹配的导出 VS2012报错

    刚安装完VS2012,打开VS2012新建项目,但是并没有像之前那样顺利的创建页面,而是弹出了一个错误窗口. 我的系统是win7旗舰版 64位 ,同时安装了VS2010和VS2012.然后我又试了一下 ...

  3. 使用js制作一般网站首页图片轮播效果

    <!DOCTYPE html> <html lang="en"> <head> <meta charset="UTF-8&quo ...

  4. 对比MS Test与NUnit Test框架

    前言: 项目中进行Unit Test时,肯定会用到框架,因为这样能够更快捷.方便的进行测试. .Net环境下的测试框架非常多,在这里只是对MS Test和NUnit Test进行一下比较, 因为这两个 ...

  5. 更改SAP的字段翻译

    TC:SE63在SAP用户选择屏幕中,用鼠标选定一个栏位后按F1键,可以看到SAP对其具体解释,通常这种解释文本分为两部分,一部分为标题,一部分为正文.比如:  有时,SAP的翻译让人感觉很别扭,对于 ...

  6. 【Leafletjs】5.L.Control 自定义一个Control

    L.Control 所有leaflet控制的基础类.继承自IControl接口. 你可以这样添加控件: control.addTo(map); // the same as map.addContro ...

  7. java 驼峰字符和下划线字符相互转换工具类

    public static final char UNDERLINE='_'; public static String camelToUnderline(String param){ if (par ...

  8. Laravel 5 性能优化技巧

    说明 性能一直是 Laravel 框架为人诟病的一个点,所以调优 Laravel 程序算是一个必学的技能. 接下来分享一些开发的最佳实践,还有调优技巧,大家有别的建议也欢迎留言讨论. 这里是简单的列表 ...

  9. 【iOS】WebView加载HTML图片大小自适应与文章自动换行

    在很多App中都会使用到webview,尤其是在加载新闻内容等文章形式的数据时.因为图文混编以及不同字体格式的显示,在iOS进行编辑 和显示都是一大问题(当然,iOS中也可以用CoreText进行绘制 ...

  10. android 数据存储Ⅰ

    本章讲述在Android开发中,简单的数据存储.涉及知识主要是SharedPreferences,及多页面切换ViewPager. 1.功能需求 做一个小应用.启动的时候有左右引导图.只有第一次启动时 ...