1.EOP marker is absent

在使用samtools index时出现

EOF是指the end of file,即samtools认为你的bam文件是不完整的。

如果把view参数的u（解压缩）去掉，是不会出现上述情况。

2.

samtools使用过程中出现的问题的更多相关文章

  1. WINDOWS系统下MYSQL安装过程中的注意事项

    1.首先MySQL的安装方式有两种:一种是MSI安装方式,很简单就像安装Windows软件一样.另外一种就是ZIP安装方式.这种相对而言比较麻烦.新手推荐MSI安装方式. 安装方式有以下两种: MSI ...

  2. 【转】SQL Server -- 已成功与服务器建立连接，但是在登录过程中发生错误

    SQL Server -- 已成功与服务器建立连接,但是在登录过程中发生错误 最近在VS2013上连接远程数据库时,突然连接不上,在跑MSTest下跑的时候,QTAgent32 crash.换成IIS ...

  3. zabbix 3.0.3 (nginx)安装过程中的问题排错记录

    特殊注明:安装zabbix 2.4.8和2.4.6遇到2个问题,如下:找了很多解决办法,实在无解,只能换版本,尝试换(2.2.2正常 | 3.0.3正常)都正常,最后决定换3.0.3 1.Error ...

  4. C语言调试过程中duplicate symbol错误分析

    说明:在我们调试C语言的过程中,经常会遇到duplicate symbol错误(在Mac平台下利用Xcode集成开发环境).如下图: 一.简单分析一下C语言程序的开发步骤. 由上图我们可以看出C语言由 ...

  5. 测试或运维工作过程中最常用的几个linux命令？

     大家在测试工作过程中,可能会遇到需要你去服务器修改一些配置文件,譬如说某个字段的值是1 则关联老版本,是0则关联新版本,这时候你可能就需要会下vi的命令操作:或者查看session设置的时长,可能需 ...

  6. Atomikos的使用过程中要注意的事

    在使用Atomikos过程中遇到的一些问题,以作记录: MySQL does not support TMJOIN MySQL does not allow for joining an existi ...

  7. MySQL Fabric和MyBatis的整合过程中遇到的问题

    这是我昨天在整合MySQL Fabric和MyBatis时遇到的问题,花了大半天才解决的问题,解决的过程中在网上查找了很久,都没有找到解决的方案.现在记下来,希望能够帮助有同样问题的朋友.如果各位朋友 ...

  8. gulp使用过程中出现的问题

    在使用gulp的过程中,最容易出现错误的地方就是在安装本地的gulp的时候,错误的原因有: 1.本来是局部安装gulp,但使用命令时还带-g. 2.忘记在局部安装gulp. 以上两种情况出错时会报错, ...

  9. JAVA安装过程中出现的“javac不是内部或外部指令”的解决方法

    近来重新安装了JAVA,安装过程中出现问题,网上找到解决办法,汇总发布. 解决流程: 1.确定自己的环境变量设置没问题,没有出现遗漏 : . 等情况 (具体环境变量设置百度) 2.环境变量设置后 ,d ...

随机推荐

  1. 第一百八十五节，jQuery，Ajax 表单插件

    jQuery,Ajax 表单插件 学习要点: 1.核心方法 2.option 参数 3.工具方法 传统的表单提交,需要多次跳转页面,极大的消耗资源也缺乏良好的用户体验.而这款 form.js 表单的 ...

  2. Linux 超级守护进程 xinetd

    在Linux中,守护进程有两种方式,一种是svsy方式,一种是xinetd方式(超级守护进程). 每个守护进程都会有一个脚本,可以理解成工作配置文件,守护进程的脚本需要放在指定位置,独立启动守护进程: ...

  3. 《转》Ubuntu14.04 openstack juno配置之 ceilometer遥測模块安装配置

    (一)在控制节点上 1.安装的遥測服务 apt-get install -y ceilometer-api ceilometer-collector ceilometer-agent-central ...

  4. VS+mysql+EF搭建

    2016年7月6日更新: vs2010只需要安装mysql的.net connector就可以 vs2012, vs2015都需要安装.net connector + ODBC connector才行 ...

  5. SVD分解的c++代码（Eigen 库）

    使用Eigen 库:进行svd分解,形如 A = U * S * VT. JacobiSVD<MatrixXd> svd(J, ComputeThinU | ComputeThinV); ...

  6. python的OS库和正则表达式库

    摘自:http://blog.chinaunix.net/uid-16360955-id-3351990.html 作留存学习 1.常用内置函数:(不用import就可以直接使用) help(obj) ...

  7. Android开发：《Gradle Recipes for Android》阅读笔记1.2

    在android开发中会需要配置使用app的android SDK的最低版本和目标版本,这个是bulidl.gradle的android模块设置.默认有以下几个设置: applicationId,这个 ...

  8. CF 617E【莫队求区间异或和】

    E. XOR and Favorite Number time limit per test 4 seconds memory limit per test 256 megabytes input s ...

  9. EasyNVR智能云终端硬件与EasyNVR解决方案软件综合对比

    背景分析 互联网视频直播越来越成为当前视频直播的大势,对于传统的安防监控,一般都是局限于内网,无法成批量上云台.传统的海康和大华的平台虽然可以通过自身私有协议上云平台 集总管控,但是往往只是支持自身的 ...

  10. float 的先后顺序 理解流

    <!DOCTYPE html><html><head><style> p{float:right;}</style></head> ...