1.EOP marker is absent

在使用samtools index时出现

EOF是指the end of file,即samtools认为你的bam文件是不完整的。

如果把view参数的u（解压缩）去掉，是不会出现上述情况。

2.

samtools使用过程中出现的问题的更多相关文章

  1. WINDOWS系统下MYSQL安装过程中的注意事项

    1.首先MySQL的安装方式有两种:一种是MSI安装方式,很简单就像安装Windows软件一样.另外一种就是ZIP安装方式.这种相对而言比较麻烦.新手推荐MSI安装方式. 安装方式有以下两种: MSI ...

  2. 【转】SQL Server -- 已成功与服务器建立连接，但是在登录过程中发生错误

    SQL Server -- 已成功与服务器建立连接,但是在登录过程中发生错误 最近在VS2013上连接远程数据库时,突然连接不上,在跑MSTest下跑的时候,QTAgent32 crash.换成IIS ...

  3. zabbix 3.0.3 (nginx)安装过程中的问题排错记录

    特殊注明:安装zabbix 2.4.8和2.4.6遇到2个问题,如下:找了很多解决办法,实在无解,只能换版本,尝试换(2.2.2正常 | 3.0.3正常)都正常,最后决定换3.0.3 1.Error ...

  4. C语言调试过程中duplicate symbol错误分析

    说明:在我们调试C语言的过程中,经常会遇到duplicate symbol错误(在Mac平台下利用Xcode集成开发环境).如下图: 一.简单分析一下C语言程序的开发步骤. 由上图我们可以看出C语言由 ...

  5. 测试或运维工作过程中最常用的几个linux命令？

     大家在测试工作过程中,可能会遇到需要你去服务器修改一些配置文件,譬如说某个字段的值是1 则关联老版本,是0则关联新版本,这时候你可能就需要会下vi的命令操作:或者查看session设置的时长,可能需 ...

  6. Atomikos的使用过程中要注意的事

    在使用Atomikos过程中遇到的一些问题,以作记录: MySQL does not support TMJOIN MySQL does not allow for joining an existi ...

  7. MySQL Fabric和MyBatis的整合过程中遇到的问题

    这是我昨天在整合MySQL Fabric和MyBatis时遇到的问题,花了大半天才解决的问题,解决的过程中在网上查找了很久,都没有找到解决的方案.现在记下来,希望能够帮助有同样问题的朋友.如果各位朋友 ...

  8. gulp使用过程中出现的问题

    在使用gulp的过程中,最容易出现错误的地方就是在安装本地的gulp的时候,错误的原因有: 1.本来是局部安装gulp,但使用命令时还带-g. 2.忘记在局部安装gulp. 以上两种情况出错时会报错, ...

  9. JAVA安装过程中出现的“javac不是内部或外部指令”的解决方法

    近来重新安装了JAVA,安装过程中出现问题,网上找到解决办法,汇总发布. 解决流程: 1.确定自己的环境变量设置没问题,没有出现遗漏 : . 等情况 (具体环境变量设置百度) 2.环境变量设置后 ,d ...

随机推荐

  1. Hibernate通过many-to-one元素的一对一映射

    在hibernate中我们可以通过两种方式来执行一对一映射: 通过many-to-one元素标签 通过one-to-one元素标签 在这里,我们将通过多对一的many-to-one元素进行一对一的映射 ...

  2. selenium + js 处理窗口

    1.隐藏页面的广告窗口 document.getElementById("top_left").style.display="none"; 2.隐藏控件点击 d ...

  3. SVD分解的c++代码（Eigen 库）

    使用Eigen 库:进行svd分解,形如 A = U * S * VT. JacobiSVD<MatrixXd> svd(J, ComputeThinU | ComputeThinV); ...

  4. day12闭包，装饰器

    一.闭包:内部函数引用了外部函数的变量. # f1() #闭包的定义 #内部的函数引用了外部函数的变量 # def f1(b): #闭包的常用状态 # def f2(): # print(b) # r ...

  5. Android ADB 命令链接模拟器出现 daemon not running 解决方法

    用adb命令链接远程模拟器 有时候会遇到如下问题: C:Documents and SettingsAdministrator>adb connect 192.168.0.183 * daemo ...

  6. ViewPager页面切换特效

    ViewPager页面切换特效如下效果 看效果: 效果1: 效果2: 下面就开始讲解如何实现这两个页面翻转效果 1.首先你得会ViewPager控件的使用(废话!现在还有人不会使用吗???!!) 2. ...

  7. Eclipse 启动时闪退问题解决方案

    一.以前Eclipse都可以正常使用,突然有一天不能启动了,点击图标后启动画面一闪之后就消失了,以下是一些解决方案: 1. 找到Eclipse目录下的eclipse.exe,右键点击->发送到桌 ...

  8. filter和find区别，元素遍历

    转 filter和find区别 find()会在当前指定元素中查找符合条件的子元素,是对它的子集操作,而filter()则是在当前指定的元素集合中查找符合条件的元素,是对自身集合元素进行筛选. HTM ...

  9. 基于HttpClient、Jsoup的爬虫获取指定网页内容

    不断尝试,发现越来越多有趣的东西,刚刚接触Jsoup感觉比正则表达式用起来方便,但也有局限只适用HTML的解析. 不能尝试运用到四则运算中(工作室刚开始联系的小程序). 在原来写的HttpClient ...

  10. Xenserver中SR、VBD和VDI之间的关系

    首先需要理解xenserver下的SR,VDI,VBD这三个概念.如下图 存储库 (SR) 虚拟磁盘映像 (VDI) 物理块设备 (PBD) 虚拟块设备 (VBD) 看上图所示,他们之间的关系. SR ...