NER的数据处理
import os
class TransferData:
def __init__(self):
cur = '/'.join(os.path.abspath(__file__).split('/')[:-1]) #获取当前文件地址的上级目录
#对分类进行标记
self.label_dict = {
'检查和检验': 'CHECK',
'症状和体征': 'SIGNS',
'疾病和诊断': 'DISEASE',
'治疗': 'TREATMENT',
'身体部位': 'BODY'}
self.origin_path = os.path.join(cur, 'data_origin') #原始数据地址
self.train_filepath = os.path.join(cur, 'train.txt') #转化后的训练数据地址
return
def transfer(self):
f = open(self.train_filepath, 'w+',encoding='utf-8') #以写入的方式打开训练数据要保存的文件
count = 0
for root,dirs,files in os.walk(self.origin_path):
#for (root, dirs, files) in walk(roots):
# roots代表需要遍历的根文件夹;
# root表示正在遍历的文件夹的名字(根/子);
# dirs记录正在遍历的文件夹下的子文件夹集合;
# files记录正在遍历的文件夹中的文件集合
for file in files:
filepath = os.path.join(root, file)
if 'original' not in filepath:
continue
label_filepath = filepath.replace('.txtoriginal','')
print(filepath, '\t\t', label_filepath) #data_origin\一般项目\一般项目-1.txtoriginal.txt data_origin\一般项目\一般项目-1.txt
content = open(filepath,encoding='utf-8').read().strip() #打开案例描述文件,去掉收尾空格
res_dict = {}
for line in open(label_filepath,encoding='utf-8'): #打开实体类别文件
res = line.strip().split(' ') #每个实体描述按空格分隔 ['右髋部',‘21’,‘23’,‘身体部位’]
start = int(res[1]) #实体的其实字符位置
end = int(res[2]) #实体的结束字符位置
label = res[3] #实体类别
label_id = self.label_dict.get(label) #返回分类字典中实体类别对应的values,作为实体名称的id
for i in range(start, end+1):
if i == start:
label_cate = label_id + '-B' #定义实体的首字符
else:
label_cate = label_id + '-I' #实体的非首字符
res_dict[i] = label_cate #构建实体字典{位置index:字符}
for indx, char in enumerate(content): #indx文本中字符的位置,char字符
char_label = res_dict.get(indx, 'O') #如果indx在字典的key中,则返回字典value;否则返回O,代表非实体
print(char, char_label) #字符:字符实体标注
f.write(char + '\t' + char_label + '\n')
f.close()
return
if __name__ == '__main__':
handler = TransferData()
train_datas = handler.transfer()
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