Uniprot 数据库-最常用的蛋白质数据库
Uniprot 数据库是收录信息最全面的蛋白质数据库,包含swissport, uniparc, TrEMBL 3个子数据库;
其中swiss-prot 是手工核对过的 ,非冗余, 有详细注释信息的蛋白数据库,也是最常用的数据库;
该数据库收录了不同物种的蛋白信息,以人类为例,
数据库中可以看到如下的信息:
http://www.uniprot.org/uniprot/?query=*&fil=organism%3A%22Homo+sapiens+%28Human%29+%5B9606%5D%22
对于研究蛋白质的功能而言,其对应的GO注释信息时我们最关注的, 以human的 Q8NHS2 蛋白为例,其对应的GO注释为
http://www.ebi.ac.uk/QuickGO/GProtein?ac=Q8NHS2
可以看到其对应的所有GO注释信息,包括对应的GO ID, GO的描述信息,以及分类
通过uniprot 数据库,我们可以知道编码蛋白的基因,对应的蛋白名称, 序列,以及GO注释
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