十二、ITK例程-医疗图像配准的HelloWorld程序
一、说明
医疗图像配准是ITK的一个重要内容,而我们今天想要说的一个程序则相当于是其中的HelloWorld程序。
程序源码位置:
InsightToolkit-5.0.\Examples\RegistrationITKv4\\ImageRegistration1.cxx
二、ITK的配准框架
三、程序的主要思路
程序的主要思路可以用如下的框图来表示:
其中我们需要输入输出的文件如下:
但是在这里,为了便于程序阅读,这个时候我把所有的参数全部都写在了程序里面。
四、工程构建
1-构建工程
按照之前的方法,利用已经有的源文件构建一个工程,并且添加属性表和动态链接库文件。
2-程序修改
源码程序这个时候不是能用的,需要稍作修改
2.1将每一个argv参数的位置直接修改为文件名
参数含义如下:
参数 | 内容 |
argv[1] | 参考图片 |
argv[2] | 待配准图片 |
argv[3] | 输出待配准图片(以参考图片格式输出) |
argv[4] | 两个输入图片配准之后的差值图片 |
argv[5] | 两个输入图片未配准的时候的差值图片 |
实际程序里面修改:
//参考图片位置
fixedImageReader->SetFileName("D:\\FilesSetup\\ITK\\InsightToolkit-5.0.1\\Examples\\Data\\BrainProtonDensitySliceBorder20.png");
//待配准图片位置
movingImageReader->SetFileName("D:\\FilesSetup\\ITK\\InsightToolkit-5.0.1\\Examples\\Data\\BrainProtonDensitySliceShifted13x17y.png");
//文件写入位置,这三张图片全部都写入到本工程目录下
writer->SetFileName("D:\\Files\\ITKFiles\\ITK_6_Registration\\Data\OutputData\\Moving13x17yInputType.png");
writer2->SetFileName("D:\Files\ITKFiles\ITK_6_Registration\Data\OutputData\Moving13x17yInputType.png");
writer2->SetFileName("D:\\Files\\ITKFiles\\ITK_6_Registration\\Data\\OutputData\\DifferenceBeforeRegistration.png");
2.2添加头文件
因为要阅读png文件,所以需要添加png文件的IOFactory
#include "itkPNGImageIOFactory.h"
初始化IOFactory:
itk::PNGImageIOFactory::RegisterOneFactory();
2.3添加命令行参数
因为程序里面有对输入参数的判断,当我们修改以后,还是要满足输入参数的个数(虽然我们已经不用这个参数了,但是这个判断条件是程序运行的触发条件)
打开调试-属性:
在调试-命令参数里面输入六个随意数字,以空格间隔:
五、运行结果
得到的几张图片与参考书吻合:
控制台输出如下:
可以看到,一共经过了36次迭代,最后计算出来的测度函数值为0.0007,然后得到的偏移量是(13,17),和图片的真实偏移量是符合的
六、参考
InsightSoftwareGuide-Book2-5.0.1 Page189(书籍页码)
七、问题
今天出了一个糗事,我在构建工程的时候,由于偷懒,直接复制的另外一个工程,然后程序都已经修改好了,不论怎么运行,都没有输出。
还以为是函数复制出了问题,但是这个时候我才发现,我根本没有把这个main.cpp文件添加到工程里面。
害的我特地对比了一下是不是函数复制的时候出了问题。
......
不注重细节害死人啊。
十二、ITK例程-医疗图像配准的HelloWorld程序的更多相关文章
- 如何在Visual Studio 2017中使用C# 7+语法 构建NetCore应用框架之实战篇(二):BitAdminCore框架定位及架构 构建NetCore应用框架之实战篇系列 构建NetCore应用框架之实战篇(一):什么是框架,如何设计一个框架 NetCore入门篇:(十二)在IIS中部署Net Core程序
如何在Visual Studio 2017中使用C# 7+语法 前言 之前不知看过哪位前辈的博文有点印象C# 7控制台开始支持执行异步方法,然后闲来无事,搞着,搞着没搞出来,然后就写了这篇博文,不 ...
- NetCore入门篇:(十二)在IIS中部署Net Core程序
一.简介 微软已经为net在iis中的部署提供了良好的支持,在IIS中部署NetCore是一件很容易的事. 二.在IIS中部署Net Core程序 1.微软官方文档有详细说明.进入 2.如果你已经熟悉 ...
- SSE图像算法优化系列三十二:Zhang\Guo图像细化算法的C语言以及SIMD指令优化
二值图像的细化算法也有很多种,比较有名的比如Hilditch细化.Rosenfeld细化.基于索引表的细化.还有Opencv自带的THINNING_ZHANGSUEN.THINNING_GUOHALL ...
- Opencv探索之路(二十):制作一个简易手动图像配准工具
近日在做基于sift特征点的图像配准时遇到匹配失败的情况,失败的原因在于两幅图像分辨率相差有点大,而且这两幅图是不同时间段的同一场景的图片,所以基于sift点的匹配已经找不到匹配点了.然后老师叫我尝试 ...
- OpenCV探索之路(二十四)图像拼接和图像融合技术
图像拼接在实际的应用场景很广,比如无人机航拍,遥感图像等等,图像拼接是进一步做图像理解基础步骤,拼接效果的好坏直接影响接下来的工作,所以一个好的图像拼接算法非常重要. 再举一个身边的例子吧,你用你的手 ...
- 从零开始学习PYTHON3讲义(十二)画一颗心送给你
(内容需要,本讲使用了大量在线公式,如果因为转帖网站不支持公式无法显示的情况,欢迎访问原始博客.) <从零开始PYTHON3>第十二讲 上一节课我们主要讲解了数值计算和符号计算.数值计算的 ...
- 【腾讯Bugly干货分享】腾讯验证码的十二年
本文来自于腾讯bugly开发者社区,未经作者同意,请勿转载,原文地址:http://dev.qq.com/topic/581301b146dfb1456904df8d Dev Club 是一个交流移动 ...
- Web 前端开发精华文章推荐(HTML5、CSS3、jQuery)【系列二十二】
<Web 前端开发精华文章推荐>2014年第一期(总第二十二期)和大家见面了.梦想天空博客关注 前端开发 技术,分享各类能够提升网站用户体验的优秀 jQuery 插件,展示前沿的 HTML ...
- PRML读书会第十二章 Continuous Latent Variables(PCA,Principal Component Analysis,PPCA,核PCA,Autoencoder,非线性流形)
主讲人 戴玮 (新浪微博: @戴玮_CASIA) Wilbur_中博(1954123) 20:00:49 我今天讲PRML的第十二章,连续隐变量.既然有连续隐变量,一定也有离散隐变量,那么离散隐变量是 ...
随机推荐
- Python实现截图功能你肯定不会吧?【面试必学】
前言本文的文字及图片来源于网络,仅供学习.交流使用,不具有任何商业用途,版权归原作者所有,如有问题请及时联系我们以作处理.作者:CyborgLin python实现截图功能. windows环境下.需 ...
- HTTP报文(首部字段)
HTTP报文 请求报文/响应报文 结构: 报文首部 + (可选)报文主体(两者通过空行CR + LF来划分) 使用首部字段是为了给浏览器和服务器提供报文主体大小.所使用的语言.认证信息等内容 HTTP ...
- wc命令统计目录下所有文件行数
想统计一下最近一个项目的代码行数,一个一个文件统计显然不是程序员的思维,wc命令可以统计一个文本的行数,结合find命令可以实现我的需求(注意符号):
- 2016/09/22 mapreduce
1.概念 Mapreduce是一个计算框架,表现形式是有个输入(input),mapreduce操作这个输入,通过本身定义好的计算模型,得到一个输出(output),也就是我们需要的结果. 在运行一个 ...
- Python基础-day01-3
PyCharm 的初始设置(知道) 目标 恢复 PyCharm 的初始设置 第一次启动 PyCharm 新建一个 Python 项目 设置 PyCharm 的字体显示 PyCharm 的升级以及其他 ...
- [ASP.NET Core 3框架揭秘] 依赖注入[2]:IoC模式
正如我们在<依赖注入:控制反转>提到过的,很多人将IoC理解为一种"面向对象的设计模式",实际上IoC不仅与面向对象没有必然的联系,它自身甚至算不上是一种设计模式.一般 ...
- 如何编写一个TS程序?
第一步:我们首先需要个代码编辑器-VSCode 点击此处下载(你会下载到rar文件) 第二步:我们还需要下载NodeJS,因为这里有npm,npm是包管理工具,可以下载TypeScript. 注意: ...
- react-native run-ios “Could not find iPhone X simulator”
问题 这个问题发生在旧的RN版本(0.57,0.58(<0.58.4),-)和Xcode 10.3中,其中可用模拟器的名称得到了一些调整 在文件node_modules/@react nativ ...
- DRF单表序列化和反序列化
安装 djangorestframework pip install djangorestframework 将rest_framework注册到app上 INSTALLED_APPS = [ 're ...
- MySQL 两张表关联更新(用一个表的数据更新另一个表的数据)
有两张表,info1, info2 . info1: info2: 现在,要用info2中的数据更新info1中对应的学生信息,sql语句如下: UPDATE info1 t1 JOIN info2 ...