一、说明

  医疗图像配准是ITK的一个重要内容,而我们今天想要说的一个程序则相当于是其中的HelloWorld程序。

  程序源码位置:

InsightToolkit-5.0.\Examples\RegistrationITKv4\\ImageRegistration1.cxx

二、ITK的配准框架

  

三、程序的主要思路

  程序的主要思路可以用如下的框图来表示:

  

  其中我们需要输入输出的文件如下:

  

  但是在这里,为了便于程序阅读,这个时候我把所有的参数全部都写在了程序里面。

四、工程构建

 1-构建工程

  按照之前的方法,利用已经有的源文件构建一个工程,并且添加属性表和动态链接库文件。

 2-程序修改

  源码程序这个时候不是能用的,需要稍作修改

  2.1将每一个argv参数的位置直接修改为文件名

  参数含义如下:

参数 内容
argv[1] 参考图片
argv[2] 待配准图片
argv[3] 输出待配准图片(以参考图片格式输出)
argv[4] 两个输入图片配准之后的差值图片
argv[5] 两个输入图片未配准的时候的差值图片

  实际程序里面修改:

//参考图片位置
fixedImageReader->SetFileName("D:\\FilesSetup\\ITK\\InsightToolkit-5.0.1\\Examples\\Data\\BrainProtonDensitySliceBorder20.png");
//待配准图片位置
movingImageReader->SetFileName("D:\\FilesSetup\\ITK\\InsightToolkit-5.0.1\\Examples\\Data\\BrainProtonDensitySliceShifted13x17y.png");
//文件写入位置,这三张图片全部都写入到本工程目录下
writer->SetFileName("D:\\Files\\ITKFiles\\ITK_6_Registration\\Data\OutputData\\Moving13x17yInputType.png");
writer2->SetFileName("D:\Files\ITKFiles\ITK_6_Registration\Data\OutputData\Moving13x17yInputType.png");
writer2->SetFileName("D:\\Files\\ITKFiles\\ITK_6_Registration\\Data\\OutputData\\DifferenceBeforeRegistration.png");

  2.2添加头文件

  因为要阅读png文件,所以需要添加png文件的IOFactory

#include "itkPNGImageIOFactory.h"

  初始化IOFactory:

itk::PNGImageIOFactory::RegisterOneFactory();

  2.3添加命令行参数

  因为程序里面有对输入参数的判断,当我们修改以后,还是要满足输入参数的个数(虽然我们已经不用这个参数了,但是这个判断条件是程序运行的触发条件)

  打开调试-属性:

  

   在调试-命令参数里面输入六个随意数字,以空格间隔:

 

五、运行结果

  得到的几张图片与参考书吻合:

  

控制台输出如下:

  

可以看到,一共经过了36次迭代,最后计算出来的测度函数值为0.0007,然后得到的偏移量是(13,17),和图片的真实偏移量是符合的

六、参考

  InsightSoftwareGuide-Book2-5.0.1 Page189(书籍页码)

七、问题

  今天出了一个糗事,我在构建工程的时候,由于偷懒,直接复制的另外一个工程,然后程序都已经修改好了,不论怎么运行,都没有输出。

  还以为是函数复制出了问题,但是这个时候我才发现,我根本没有把这个main.cpp文件添加到工程里面。

  害的我特地对比了一下是不是函数复制的时候出了问题。

  ......

  不注重细节害死人啊。

十二、ITK例程-医疗图像配准的HelloWorld程序的更多相关文章

  1. 如何在Visual Studio 2017中使用C# 7+语法 构建NetCore应用框架之实战篇(二):BitAdminCore框架定位及架构 构建NetCore应用框架之实战篇系列 构建NetCore应用框架之实战篇(一):什么是框架,如何设计一个框架 NetCore入门篇:(十二)在IIS中部署Net Core程序

    如何在Visual Studio 2017中使用C# 7+语法   前言 之前不知看过哪位前辈的博文有点印象C# 7控制台开始支持执行异步方法,然后闲来无事,搞着,搞着没搞出来,然后就写了这篇博文,不 ...

  2. NetCore入门篇:(十二)在IIS中部署Net Core程序

    一.简介 微软已经为net在iis中的部署提供了良好的支持,在IIS中部署NetCore是一件很容易的事. 二.在IIS中部署Net Core程序 1.微软官方文档有详细说明.进入 2.如果你已经熟悉 ...

  3. SSE图像算法优化系列三十二:Zhang\Guo图像细化算法的C语言以及SIMD指令优化

    二值图像的细化算法也有很多种,比较有名的比如Hilditch细化.Rosenfeld细化.基于索引表的细化.还有Opencv自带的THINNING_ZHANGSUEN.THINNING_GUOHALL ...

  4. Opencv探索之路(二十):制作一个简易手动图像配准工具

    近日在做基于sift特征点的图像配准时遇到匹配失败的情况,失败的原因在于两幅图像分辨率相差有点大,而且这两幅图是不同时间段的同一场景的图片,所以基于sift点的匹配已经找不到匹配点了.然后老师叫我尝试 ...

  5. OpenCV探索之路(二十四)图像拼接和图像融合技术

    图像拼接在实际的应用场景很广,比如无人机航拍,遥感图像等等,图像拼接是进一步做图像理解基础步骤,拼接效果的好坏直接影响接下来的工作,所以一个好的图像拼接算法非常重要. 再举一个身边的例子吧,你用你的手 ...

  6. 从零开始学习PYTHON3讲义(十二)画一颗心送给你

    (内容需要,本讲使用了大量在线公式,如果因为转帖网站不支持公式无法显示的情况,欢迎访问原始博客.) <从零开始PYTHON3>第十二讲 上一节课我们主要讲解了数值计算和符号计算.数值计算的 ...

  7. 【腾讯Bugly干货分享】腾讯验证码的十二年

    本文来自于腾讯bugly开发者社区,未经作者同意,请勿转载,原文地址:http://dev.qq.com/topic/581301b146dfb1456904df8d Dev Club 是一个交流移动 ...

  8. Web 前端开发精华文章推荐(HTML5、CSS3、jQuery)【系列二十二】

    <Web 前端开发精华文章推荐>2014年第一期(总第二十二期)和大家见面了.梦想天空博客关注 前端开发 技术,分享各类能够提升网站用户体验的优秀 jQuery 插件,展示前沿的 HTML ...

  9. PRML读书会第十二章 Continuous Latent Variables(PCA,Principal Component Analysis,PPCA,核PCA,Autoencoder,非线性流形)

    主讲人 戴玮 (新浪微博: @戴玮_CASIA) Wilbur_中博(1954123) 20:00:49 我今天讲PRML的第十二章,连续隐变量.既然有连续隐变量,一定也有离散隐变量,那么离散隐变量是 ...

随机推荐

  1. elasticsearch中mapping全解实战

    目录 Mapping简介 Mapping Type 分词器最佳实践 字段类型 text 类型 keyword 类型 date类型 object类型 nest类型 range类型 实战:同时使用keyw ...

  2. MySQL 04

    目录 python操作mysql mysql sql注入问题 问题描述 解决办法 增/删/改 查询 索引 基本概念 索引的原理 mysql索引种类 普通索引 唯一索引 联合索引 创建索引 正确使用索引 ...

  3. PHP7 break和continue的区别

    break:结束当前 for,foreach,while,do-while 或者 switch 结构的执行. continue:在循环结构用用来跳过本次循环中剩余的代码并在条件求值为真时开始执行下一次 ...

  4. 小胖求学系列之-文档生成利器(下)-smart-doc

    叮叮叮....一阵铃声响起,大家都陆续来到了课堂,看老师没来,小张和小胖又闲聊起来,小张问:怎么样,smart-doc好用吧.小胖笑着说:挺好用的,不过? 小张看卖关子,问到:不过什么,有什么新发现? ...

  5. 6张图说清楚Tomcat原理及请求流程

    前言 很多东西在时序图中体现的已经非常清楚了,没有必要再一步一步的作介绍,本文以图为主,然后对部分内容加以简单解释. 绘制图形使用的工具是 PlantUML + Visual Studio Code ...

  6. 《Java基础知识》Java包的概念

    一.什么是java中的包 Java程序中,为了开发方便,会将功能相似的类放入一个文件夹中,这个文件结构就是包. 二.java中的包的命名规范 域名反写,例如:com.baidu. 三.java中的包的 ...

  7. C#访问SFTP:Renci.SshNet.Async

    SFTP是SSH File Transfer Protocol的缩写,安全文件传送协议.安全文件传送协议.可以为传输文件提供一种安全的网络的加密方法.sftp 与 ftp 有着几乎一样的语法和功能. ...

  8. 松软科技Web课堂:JavaScript While 循环

    只要条件为 true,循环能够一直执行代码块. While 循环 while 循环会一直循环代码块,只要指定的条件为 true. 语法 while (条件) { 要执行的代码块 } 实例 在下面的例子 ...

  9. crontab 定时任务没有响应 检测步骤

    设置规则 # 每分钟执行一次 */1 * * * * /scripts/script.sh # 每小时执行一次 0 */1 * * * /scripts/script.sh # 每天 02:00 执行 ...

  10. Android utils 工具类之MD5加密 MD5Utils

    实际开发过程中,密码不会保存明文形式,容易被别人窃取. MD5加密是不可逆的加密算法,只能由明文转换成密文. 但是有些人通过将明文对应的密文保存在数据库中,进行查询破解密文.为防止这种解密,根据许多对 ...