calibur处理ROSETTA输出的多个结构文件,clustering
下载网址:https://sourceforge.net/projects/calibur/
安装:
- $ tar zxvf calibur.tar.gz
- $ cd calibur
- $ make
安装完成后,会产生calibur和calibur-lite两个可执行文件。
添加环境变量:
- $ vim ~/.bashrc
- #calibur
- export PATH=$Programs/calibur:$PATH
- $ source ~/.bashrc
安装及配置完成。
用法:
1. 首先需要把所有pdb文件的名称制成一个列表;
- $ ls *.pdb > pdblist
2. 运行calibur;
- $ calibur pdblist # 软件自行指定合适的阈值
- $ calibur pdblist 1 # 自己指定阈值
- $ calibur # 打印帮助信息
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